More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2909 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2909  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 268 aa  538  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.999783  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.34 
 
 		 242 aa  258  9e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.65 
 
 		 256 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  50.2 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 239 aa  205  7e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.37 
 
 		 275 aa  203  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  51.05 
 
 		 246 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  51.05 
 
 		 246 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  46.78 
 
 		 246 aa  202  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  50.63 
 
 		 246 aa  201  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  50.63 
 
 		 246 aa  201  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  50.21 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  47.64 
 
 		 240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3772  two component transcriptional regulator  49.15 
 
 		 240 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.83932 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4048  two component transcriptional regulator  49.15 
 
 		 240 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507063  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  48.48 
 
 		 237 aa  198  7.999999999999999e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2235  two component transcriptional regulator  47.41 
 
 		 236 aa  198  7.999999999999999e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  48.1 
 
 		 247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  44.73 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  48.12 
 
 		 243 aa  196  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  47.64 
 
 		 243 aa  196  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.98 
 
 		 240 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  48.07 
 
 		 236 aa  196  4.0000000000000005e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.09 
 
 		 236 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.41 
 
 		 241 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  47.41 
 
 		 241 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.64 
 
 		 240 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  45.53 
 
 		 245 aa  195  6e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  47.7 
 
 		 246 aa  195  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  49.37 
 
 		 246 aa  195  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  47.28 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.84 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  47.28 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  45.53 
 
 		 245 aa  194  2e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  47.26 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  48.52 
 
 		 242 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  44.63 
 
 		 241 aa  192  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  46.84 
 
 		 247 aa  190  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.61 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.38 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.99 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  46.84 
 
 		 245 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  46.84 
 
 		 246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4076  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.11 
 
 		 253 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.31516 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  44.96 
 
 		 241 aa  189  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4429  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.11 
 
 		 247 aa  189  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23129  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.51 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  46.91 
 
 		 248 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  46.86 
 
 		 245 aa  188  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5210  two component response regulator  45.3 
 
 		 241 aa  188  9e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  46.84 
 
 		 236 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  45.99 
 
 		 246 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2155  two component transcriptional regulator  48.31 
 
 		 261 aa  186  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.128892 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6199  OmpR family two component response transcriptional regulator  44.87 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  45.73 
 
 		 238 aa  186  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  45.3 
 
 		 237 aa  186  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1587  two component transcriptional regulator  47.28 
 
 		 261 aa  186  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367759  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  46.38 
 
 		 249 aa  185  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  45.38 
 
 		 246 aa  185  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2286  response regulator GltR  43.22 
 
 		 241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  44.98 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  45.96 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1148  two component transcriptional regulator  46.86 
 
 		 243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000285872  normal  0.61114 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3382  two component transcriptional regulator  43.46 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98781 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1971  two component transcriptional regulator  45.69 
 
 		 232 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.999465  normal  0.0504331 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5255  two component transcriptional regulator  50.69 
 
 		 218 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0413  putative transcriptional regulatory protein OmpR  45.15 
 
 		 238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16231  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  45.69 
 
 		 241 aa  182  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.78 
 
 		 239 aa  182  7e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0287  two component transcriptional regulator  44.4 
 
 		 239 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0271  winged helix family two component transcriptional regulator  44.4 
 
 		 239 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195642 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 		 239 aa  181  9.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.84 
 
 		 244 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.710276 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2121  osmolarity response regulator  42.98 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.201602  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2092  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.07 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.187111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4212  two component transcriptional regulator  47.11 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0297  two component transcriptional regulator  43.8 
 
 		 240 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0126  osmolarity response regulator  43.4 
 
 		 254 aa  179  5.999999999999999e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0135  osmolarity response regulator  43.4 
 
 		 254 aa  179  5.999999999999999e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.35 
 
 		 259 aa  178  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3326  two component transcriptional regulator  46.25 
 
 		 243 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2374  two component transcriptional regulator  45.73 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.348064  normal  0.588953 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  44.02 
 
 		 240 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.83 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1012  winged helix family two component transcriptional regulator  45.64 
 
 		 241 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0418267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1050  two component transcriptional regulator  46.28 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.36572  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  46.35 
 
 		 230 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  46.78 
 
 		 242 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  44.21 
 
 		 245 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3025  two component transcriptional regulator  45.96 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04421  two-component system regulatory protein  46.32 
 
 		 230 aa  177  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  43.72 
 
 		 241 aa  176  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1290  DNA-binding response regulator  43.39 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4373  two component transcriptional regulator  45.04 
 
 		 243 aa  176  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3731  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.06 
 
 		 246 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1011  two component transcriptional regulator  46.28 
 
 		 241 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  43.97 
 
 		 239 aa  176  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5813  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 253 aa  176  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548874 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  45.49 
 
 		 262 aa  175  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>