More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3286 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  464  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  58.72 
 
 		 238 aa  247  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3219  two component transcriptional regulator  54.82 
 
 		 241 aa  238  5.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  51.68 
 
 		 236 aa  238  8e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  50.65 
 
 		 246 aa  235  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  50.64 
 
 		 243 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  51.08 
 
 		 240 aa  235  6e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.95 
 
 		 240 aa  234  7e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.21 
 
 		 256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  48.55 
 
 		 245 aa  233  3e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  48.55 
 
 		 245 aa  232  3e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3731  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.75 
 
 		 246 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.85 
 
 		 246 aa  229  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.85 
 
 		 275 aa  229  3e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  50.86 
 
 		 251 aa  228  7e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.42 
 
 		 246 aa  227  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  50.84 
 
 		 246 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1587  two component transcriptional regulator  52.16 
 
 		 261 aa  226  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367759  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  51.24 
 
 		 246 aa  226  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  50.84 
 
 		 246 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  50.42 
 
 		 246 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  52.16 
 
 		 262 aa  226  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 243 aa  225  4e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  54.19 
 
 		 241 aa  225  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.02 
 
 		 251 aa  225  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.88 
 
 		 241 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  53.88 
 
 		 241 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  50.83 
 
 		 246 aa  224  6e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  50.42 
 
 		 246 aa  225  6e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  49.36 
 
 		 237 aa  224  9e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4076  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.59 
 
 		 253 aa  224  9e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.31516 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0771  two component transcriptional regulator  54.39 
 
 		 244 aa  223  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.132718 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  52.84 
 
 		 244 aa  223  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.59 
 
 		 240 aa  223  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 		 245 aa  222  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6199  OmpR family two component response transcriptional regulator  48.5 
 
 		 255 aa  221  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  50.84 
 
 		 247 aa  221  6e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  50.42 
 
 		 247 aa  221  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.21 
 
 		 239 aa  221  8e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.86 
 
 		 239 aa  221  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.43 
 
 		 246 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  50 
 
 		 246 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  48.93 
 
 		 237 aa  221  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  48.94 
 
 		 242 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4363  osmolarity response regulator  51.53 
 
 		 243 aa  219  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.37 
 
 		 240 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  52.4 
 
 		 243 aa  218  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  51.09 
 
 		 243 aa  218  6e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  50.84 
 
 		 245 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  45.65 
 
 		 236 aa  218  8.999999999999998e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2500  osmolarity response regulator  51.53 
 
 		 243 aa  217  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  50.65 
 
 		 239 aa  217  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3153  osmolarity response regulator  51.53 
 
 		 243 aa  217  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2155  two component transcriptional regulator  50.43 
 
 		 261 aa  217  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.128892 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1584  osmolarity response regulator  51.53 
 
 		 243 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.131787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  50.64 
 
 		 249 aa  215  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 236 aa  215  5e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.72 
 
 		 244 aa  215  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.710276 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  45.19 
 
 		 241 aa  214  9e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2546  osmolarity response regulator  50.22 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  45.15 
 
 		 241 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  45.96 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2092  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.78 
 
 		 263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.187111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4347  two component transcriptional regulator  47.28 
 
 		 244 aa  212  3.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.215798  normal  0.0155623 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2713  osmolarity response regulator  50.66 
 
 		 245 aa  212  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394419  normal  0.0259821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1971  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 		 232 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.999465  normal  0.0504331 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  47.64 
 
 		 240 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  49.56 
 
 		 242 aa  209  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5210  two component response regulator  46.86 
 
 		 241 aa  209  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1574  osmolarity response regulator  50.91 
 
 		 236 aa  209  3e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  49.12 
 
 		 230 aa  208  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  49.12 
 
 		 259 aa  208  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2732  osmolarity response regulator  48.93 
 
 		 243 aa  208  5e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.744063  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04421  two-component system regulatory protein  49.57 
 
 		 230 aa  208  6e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03947  osmolarity response regulator  46.25 
 
 		 240 aa  207  9e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5579  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.69 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00126537  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3781  two component transcriptional regulator  50.21 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  47.68 
 
 		 246 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2176  two component transcriptional regulator  50.86 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0244  osmolarity response regulator  45.96 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0308  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.96 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0172  osmolarity response regulator  45.53 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3602  osmolarity response regulator  45.96 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  47.26 
 
 		 246 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4621  osmolarity response regulator  45.96 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0324  osmolarity response regulator  45.53 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566854  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3879  osmolarity response regulator  45.96 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2033  two component transcriptional regulator  51.08 
 
 		 238 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0308  osmolarity response regulator  45.96 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0516186 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3784  osmolarity response regulator  45.96 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3741  osmolarity response regulator  45.53 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3700  osmolarity response regulator  45.96 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3686  osmolarity response regulator  45.96 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550003 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.68 
 
 		 246 aa  206  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3809  osmolarity response regulator  45.96 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3818  osmolarity response regulator  45.96 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3871  osmolarity response regulator  45.96 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3703  osmolarity response regulator  45.96 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3775  osmolarity response regulator  45.96 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  47.26 
 
 		 246 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>