More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0758 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  100 
 
 
244 aa  489  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  61.37 
 
 
245 aa  288  4e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2387  DNA-binding response regulator  51.07 
 
 
236 aa  244  6.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  53.19 
 
 
245 aa  244  6.999999999999999e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  53.19 
 
 
245 aa  244  9e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  55.04 
 
 
240 aa  235  5.0000000000000005e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  53.85 
 
 
239 aa  235  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2497  two component transcriptional regulator  54.2 
 
 
239 aa  234  7e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  54.01 
 
 
262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  48.07 
 
 
236 aa  232  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.2 
 
 
256 aa  230  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.12 
 
 
275 aa  223  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  48.28 
 
 
242 aa  222  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  49.58 
 
 
246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2374  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 
245 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.348064  normal  0.588953 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  48.12 
 
 
243 aa  218  5e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  49.15 
 
 
246 aa  218  5e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  48.78 
 
 
257 aa  218  6e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04421  two-component system regulatory protein  48.92 
 
 
230 aa  218  6e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  49.17 
 
 
246 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  49.15 
 
 
246 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  49.15 
 
 
246 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  47.64 
 
 
240 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.94 
 
 
239 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.44 
 
 
246 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  49.36 
 
 
247 aa  216  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  48.73 
 
 
246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  49.35 
 
 
236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  48.73 
 
 
246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  47.48 
 
 
245 aa  215  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  47.08 
 
 
247 aa  214  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  48.54 
 
 
245 aa  214  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  47.08 
 
 
241 aa  215  7e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  46.19 
 
 
243 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.06 
 
 
240 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.5 
 
 
246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3772  two component transcriptional regulator  47.64 
 
 
240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.83932 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4048  two component transcriptional regulator  47.64 
 
 
240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507063  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  49.35 
 
 
237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.89 
 
 
241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  46.89 
 
 
241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.01 
 
 
246 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3029  two component transcriptional regulator  50.42 
 
 
238 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452516  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2155  two component transcriptional regulator  51.52 
 
 
261 aa  211  7e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.128892 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  47.21 
 
 
246 aa  210  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  48.07 
 
 
244 aa  210  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.76 
 
 
251 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  48.91 
 
 
243 aa  209  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  50.45 
 
 
230 aa  209  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  50.45 
 
 
259 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4363  osmolarity response regulator  48.47 
 
 
243 aa  209  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  47.21 
 
 
246 aa  209  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  46.78 
 
 
246 aa  208  8e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  46.78 
 
 
246 aa  208  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.41 
 
 
246 aa  207  9e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3326  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 
243 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  48.67 
 
 
242 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2176  two component transcriptional regulator  44.68 
 
 
238 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120128  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0308  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.41 
 
 
239 aa  206  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3871  osmolarity response regulator  47.41 
 
 
239 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3686  osmolarity response regulator  47.41 
 
 
239 aa  206  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.550003 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3879  osmolarity response regulator  47.41 
 
 
239 aa  206  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3703  osmolarity response regulator  47.41 
 
 
239 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3775  osmolarity response regulator  47.41 
 
 
239 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3818  osmolarity response regulator  47.41 
 
 
239 aa  206  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339561  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3602  osmolarity response regulator  47.41 
 
 
239 aa  206  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0655  two component transcriptional regulator  47.84 
 
 
242 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.379452 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3809  osmolarity response regulator  47.41 
 
 
239 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  45.92 
 
 
261 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1574  osmolarity response regulator  49.33 
 
 
236 aa  207  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4711  osmolarity response regulator  47.41 
 
 
239 aa  206  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0308  osmolarity response regulator  47.41 
 
 
239 aa  206  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0516186 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3784  osmolarity response regulator  47.41 
 
 
239 aa  206  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4621  osmolarity response regulator  47.37 
 
 
239 aa  206  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3700  osmolarity response regulator  47.41 
 
 
239 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0172  osmolarity response regulator  47.41 
 
 
239 aa  206  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2500  osmolarity response regulator  47.6 
 
 
243 aa  206  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3741  osmolarity response regulator  47.41 
 
 
239 aa  206  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3153  osmolarity response regulator  47.6 
 
 
243 aa  206  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3980  osmolarity response regulator  47.41 
 
 
239 aa  206  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.75818  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.96 
 
 
239 aa  206  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3510  osmolarity response regulator  47.81 
 
 
241 aa  206  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2033  two component transcriptional regulator  44.68 
 
 
238 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649752  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  46.49 
 
 
241 aa  206  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03257  osmolarity response regulator  47.62 
 
 
239 aa  205  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0654  two component transcriptional regulator  51.09 
 
 
244 aa  206  4e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0244  osmolarity response regulator  47.41 
 
 
239 aa  205  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03209  hypothetical protein  47.62 
 
 
239 aa  205  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  46.35 
 
 
246 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  46.35 
 
 
246 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4075  osmolarity response regulator  47.41 
 
 
239 aa  205  5e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4597  osmolarity response regulator  46.12 
 
 
240 aa  205  5e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3898  osmolarity response regulator  47.41 
 
 
239 aa  205  5e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  48.07 
 
 
240 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1584  osmolarity response regulator  48.03 
 
 
243 aa  205  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.131787  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  47.64 
 
 
243 aa  205  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 
251 aa  205  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4134  osmolarity response regulator  46.49 
 
 
241 aa  205  6e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4206  osmolarity response regulator  46.49 
 
 
241 aa  205  6e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  45.53 
 
 
248 aa  205  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>