More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2105 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2105  two component transcriptional regulator  100 
 
 
253 aa  488  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3900  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.53 
 
 
259 aa  296  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0328  two component transcriptional regulator  68.22 
 
 
242 aa  295  5e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0159166  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3905  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.17 
 
 
243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00241  VirG  56.96 
 
 
258 aa  251  6e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5813  two component transcriptional regulator  51.88 
 
 
253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548874 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4385  two-component response regulator VirG  50.65 
 
 
241 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6145  two-component response regulator VirG  47.41 
 
 
241 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8217  two-component response regulator VirG  50 
 
 
241 aa  209  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.206668  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0531  DNA-binding response regulator  46.72 
 
 
245 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2121  DNA-binding response regulator  46.72 
 
 
245 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0885999  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2023  DNA-binding response regulator  46.72 
 
 
245 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485022  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0713  DNA-binding response regulator  46.72 
 
 
245 aa  204  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0746  DNA-binding response regulator  46.72 
 
 
245 aa  204  8e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413916  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1669  DNA-binding response regulator  46.72 
 
 
245 aa  204  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.501573  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0602  DNA-binding response regulator  46.72 
 
 
245 aa  204  8e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0872  DNA-binding response regulator  45.96 
 
 
244 aa  201  7e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.359732  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  46.89 
 
 
243 aa  193  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.57 
 
 
239 aa  192  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 
252 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  45.06 
 
 
236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  48.05 
 
 
241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  46.35 
 
 
242 aa  189  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  45.92 
 
 
243 aa  188  5e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  43.93 
 
 
245 aa  186  3e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  43.93 
 
 
245 aa  186  3e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  44.87 
 
 
240 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  47.21 
 
 
262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  43.1 
 
 
236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5210  two component response regulator  45.8 
 
 
241 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.35 
 
 
239 aa  182  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.55 
 
 
240 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.58 
 
 
251 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1874  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 
235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  45.53 
 
 
237 aa  179  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 
246 aa  179  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  47.66 
 
 
238 aa  179  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2176  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 
238 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120128  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.41 
 
 
275 aa  178  9e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2092  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.61 
 
 
263 aa  178  9e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.187111  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1587  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 
261 aa  177  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367759  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2033  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 
238 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649752  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2155  two component transcriptional regulator  47.48 
 
 
261 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.128892 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0655  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 
242 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.379452 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 
261 aa  176  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5579  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.27 
 
 
248 aa  176  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00126537  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  45.3 
 
 
245 aa  176  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3025  two component transcriptional regulator  45.92 
 
 
270 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0654  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 
244 aa  176  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3730  winged helix family two component transcriptional regulator  44.07 
 
 
238 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1255  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.25 
 
 
246 aa  175  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  44.83 
 
 
242 aa  174  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  44.4 
 
 
259 aa  174  9e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  44.78 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  43.51 
 
 
241 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1998  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 
240 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0541046  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7106  two component transcriptional regulator  44.16 
 
 
237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.323714  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 
251 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 
250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  44.87 
 
 
246 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4191  two component transcriptional regulator  39.74 
 
 
244 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  44.87 
 
 
246 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  44.87 
 
 
246 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  44.26 
 
 
245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4076  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.35 
 
 
253 aa  172  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.31516 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.21 
 
 
241 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  44.21 
 
 
241 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1282  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 
249 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  44.87 
 
 
246 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6165  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.42 
 
 
245 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.362427  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 
246 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  43.88 
 
 
246 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 
246 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  44.92 
 
 
249 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2802  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  41.1 
 
 
246 aa  171  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.25 
 
 
234 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.58 
 
 
244 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.710276 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  43.88 
 
 
246 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  42.49 
 
 
238 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  43.88 
 
 
246 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5717  putative two-component response regulator  43.1 
 
 
245 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.35 
 
 
240 aa  170  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.81 
 
 
234 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3376  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.43 
 
 
242 aa  170  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1985  DNA-binding transcriptional regulator TorR  42.67 
 
 
232 aa  170  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.156357  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  42.39 
 
 
244 aa  169  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3382  two component transcriptional regulator  41.1 
 
 
241 aa  169  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.98781 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65880  putative two-component response regulator  43.1 
 
 
244 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0780512  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  43.88 
 
 
246 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  45.8 
 
 
240 aa  169  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  43.67 
 
 
244 aa  169  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.46 
 
 
246 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  43.88 
 
 
246 aa  168  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  47.37 
 
 
245 aa  168  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2345  two component transcriptional regulator  42.39 
 
 
252 aa  168  7e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000474063  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 
256 aa  168  8e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.3 
 
 
242 aa  168  8e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3772  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 
232 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2374  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 
245 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.348064  normal  0.588953 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 
248 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>