More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00241 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00241  VirG  100 
 
 		 258 aa  511  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3900  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.15 
 
 		 259 aa  267  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2105  two component transcriptional regulator  56.22 
 
 		 253 aa  252  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3905  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.95 
 
 		 243 aa  218  6e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0328  two component transcriptional regulator  51.28 
 
 		 242 aa  218  6e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0159166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5813  two component transcriptional regulator  47.41 
 
 		 253 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548874 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4385  two-component response regulator VirG  47.03 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0602  DNA-binding response regulator  43.17 
 
 		 245 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2023  DNA-binding response regulator  43.17 
 
 		 245 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485022  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0746  DNA-binding response regulator  43.17 
 
 		 245 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413916  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0713  DNA-binding response regulator  43.17 
 
 		 245 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0531  DNA-binding response regulator  43.17 
 
 		 245 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2121  DNA-binding response regulator  43.17 
 
 		 245 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0885999  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1669  DNA-binding response regulator  43.17 
 
 		 245 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.501573  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 246 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6145  two-component response regulator VirG  44.21 
 
 		 241 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  45.45 
 
 		 244 aa  186  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0872  DNA-binding response regulator  42.29 
 
 		 244 aa  183  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.359732  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.8 
 
 		 240 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3219  two component transcriptional regulator  45.42 
 
 		 241 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  41.49 
 
 		 243 aa  180  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  43.16 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3846  osmolarity response regulator  43.78 
 
 		 241 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0654  two component transcriptional regulator  46.31 
 
 		 244 aa  178  7e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  43.78 
 
 		 241 aa  178  8e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4191  two component transcriptional regulator  41.03 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4134  osmolarity response regulator  43.35 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4338  osmolarity response regulator  43.35 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  43.78 
 
 		 241 aa  178  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4206  osmolarity response regulator  43.35 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5210  two component response regulator  43.51 
 
 		 241 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.3 
 
 		 239 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3538  osmolarity response regulator  43.22 
 
 		 240 aa  177  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000279148  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3510  osmolarity response regulator  44.02 
 
 		 241 aa  176  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0324  osmolarity response regulator  43.72 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566854  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0308  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.72 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1938  osmolarity response regulator  44.4 
 
 		 244 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0280828  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1333  osmolarity response regulator  44.4 
 
 		 244 aa  176  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00265076  decreased coverage  0.0000710625 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3809  osmolarity response regulator  43.72 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3325  osmolarity response regulator  44.4 
 
 		 244 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000316731  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2352  osmolarity response regulator  44.4 
 
 		 244 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.260389  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1485  osmolarity response regulator  44.4 
 
 		 241 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.021777  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3775  osmolarity response regulator  43.72 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2507  osmolarity response regulator  44.4 
 
 		 241 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.734124  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3879  osmolarity response regulator  43.72 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3784  osmolarity response regulator  43.72 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5249  osmolarity response regulator  44.4 
 
 		 244 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204246  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3686  osmolarity response regulator  43.72 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550003 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1962  osmolarity response regulator  44.4 
 
 		 244 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187967  normal  0.0634815 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2395  osmolarity response regulator  44.4 
 
 		 244 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0308  osmolarity response regulator  43.72 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0516186 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4621  osmolarity response regulator  43.72 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2094  osmolarity response regulator  44.4 
 
 		 241 aa  176  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3703  osmolarity response regulator  43.72 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3818  osmolarity response regulator  43.72 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3602  osmolarity response regulator  43.72 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1853  osmolarity response regulator  44.4 
 
 		 244 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00101518  hitchhiker  0.0000149756 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5579  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.56 
 
 		 248 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00126537  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3700  osmolarity response regulator  43.72 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1980  osmolarity response regulator  44.4 
 
 		 244 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0224779  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3871  osmolarity response regulator  43.72 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6141  osmolarity response regulator  44.4 
 
 		 244 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120853  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1926  osmolarity response regulator  44.4 
 
 		 244 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0250147  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1253  osmolarity response regulator  44.4 
 
 		 244 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.512472  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4711  osmolarity response regulator  43.72 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1003  osmolarity response regulator  44.83 
 
 		 244 aa  176  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal  0.39184 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0244  osmolarity response regulator  43.72 
 
 		 239 aa  176  5e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3741  osmolarity response regulator  43.22 
 
 		 239 aa  175  5e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2354  two component transcriptional regulator  46.75 
 
 		 235 aa  176  5e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.402981 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0172  osmolarity response regulator  43.22 
 
 		 239 aa  175  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3898  osmolarity response regulator  43.72 
 
 		 239 aa  175  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  41.88 
 
 		 245 aa  176  5e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4075  osmolarity response regulator  43.72 
 
 		 239 aa  175  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3980  osmolarity response regulator  43.72 
 
 		 239 aa  176  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.75818  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2307  osmolarity response regulator  44.83 
 
 		 244 aa  175  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0713504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2286  osmolarity response regulator  45.02 
 
 		 240 aa  175  6e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 261 aa  175  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1879  osmolarity response regulator  44.83 
 
 		 244 aa  175  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.276509  normal  0.342548 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8217  two-component response regulator VirG  44.21 
 
 		 241 aa  175  7e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.206668  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3811  osmolarity response regulator  42.92 
 
 		 241 aa  175  7e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3902  osmolarity response regulator  42.92 
 
 		 241 aa  175  7e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.140952 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03257  osmolarity response regulator  43.29 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4597  osmolarity response regulator  43.29 
 
 		 240 aa  174  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1574  osmolarity response regulator  45.79 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.16 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03209  hypothetical protein  43.29 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  43.4 
 
 		 242 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0168  osmolarity response regulator  42.92 
 
 		 241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  40.77 
 
 		 240 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1998  two component transcriptional regulator  45.49 
 
 		 240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0541046  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0218  osmolarity response regulator  42.92 
 
 		 241 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00621  osmolarity response regulator  43.64 
 
 		 239 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0150  osmolarity response regulator  43.16 
 
 		 241 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.32 
 
 		 241 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03947  osmolarity response regulator  41.84 
 
 		 240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  42.32 
 
 		 241 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 		 246 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 		 246 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  41.45 
 
 		 245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>