More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3376 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3376  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 242 aa  483  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2270  two component transcriptional regulator  54.77 
 
 		 244 aa  267  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3588  two component transcriptional regulator  58.44 
 
 		 234 aa  263  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0224  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  55.32 
 
 		 243 aa  261  6.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3280  two component transcriptional regulator  55.6 
 
 		 246 aa  254  8e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4261  DNA-binding response regulator  51.09 
 
 		 233 aa  235  5.0000000000000005e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0046  two component transcriptional regulator  47.11 
 
 		 233 aa  220  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.214766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2215  two component transcriptional regulator  48.93 
 
 		 235 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2281  two-component transcriptional regulator  46.31 
 
 		 235 aa  215  4e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0956  two component transcriptional regulator  45.9 
 
 		 235 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.357771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4014  two component transcriptional regulator  44.67 
 
 		 234 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0111  two component transcriptional regulator  46.55 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  45.85 
 
 		 252 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.7 
 
 		 259 aa  191  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  46.7 
 
 		 230 aa  191  9e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  45.06 
 
 		 243 aa  191  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.76 
 
 		 275 aa  189  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  41.28 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  41.7 
 
 		 245 aa  186  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  43.53 
 
 		 239 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  41.7 
 
 		 245 aa  186  2e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2983  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.35 
 
 		 242 aa  185  6e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000906081  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 243 aa  184  8e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5579  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.42 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00126537  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6165  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.46 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.362427  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.29 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  42.19 
 
 		 242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  44.16 
 
 		 262 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1282  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 242 aa  179  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  44.17 
 
 		 251 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3326  two component transcriptional regulator  42.13 
 
 		 243 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 236 aa  177  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  40.6 
 
 		 236 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  41.6 
 
 		 240 aa  176  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2345  two component transcriptional regulator  40.5 
 
 		 252 aa  175  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000474063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  41.45 
 
 		 240 aa  174  8e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 240 aa  174  9e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 240 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  42.31 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  42.42 
 
 		 241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.42 
 
 		 241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  38.79 
 
 		 241 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.88 
 
 		 251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  38.82 
 
 		 244 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  40.34 
 
 		 238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1874  two component transcriptional regulator  44.68 
 
 		 235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  45.81 
 
 		 245 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 239 aa  172  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003939  TorCAD operon transcriptional regulatory protein TorR  40.09 
 
 		 236 aa  171  7.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0753413  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.56 
 
 		 240 aa  171  9e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.81 
 
 		 234 aa  171  9e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.81 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  46.09 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65880  putative two-component response regulator  41.28 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0780512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2105  two component transcriptional regulator  43.43 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5813  two component transcriptional regulator  41.1 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548874 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1148  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3382  two component transcriptional regulator  38.4 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98781 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0390  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  42.49 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0687003  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0655  two component transcriptional regulator  38.17 
 
 		 242 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.379452 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 246 aa  169  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  40.93 
 
 		 237 aa  169  4e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0107  DNA-binding response regulator  42.55 
 
 		 236 aa  169  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2033  two component transcriptional regulator  40.51 
 
 		 238 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5717  putative two-component response regulator  40.85 
 
 		 245 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  42.44 
 
 		 246 aa  168  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2387  DNA-binding response regulator  38.36 
 
 		 236 aa  168  8e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0108  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.55 
 
 		 234 aa  168  8e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0318  two component transcriptional regulator  43.29 
 
 		 241 aa  167  9e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523003  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01583  DNA-binding transcriptional regulator TorR  39.91 
 
 		 237 aa  168  9e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3730  winged helix family two component transcriptional regulator  40.93 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2176  two component transcriptional regulator  39.57 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0413  putative transcriptional regulatory protein OmpR  39.91 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16231  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  38.02 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1998  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 240 aa  166  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0541046  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3900  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.96 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1255  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.67 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  41.35 
 
 		 246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  41.35 
 
 		 246 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  41.35 
 
 		 246 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3731  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.98 
 
 		 246 aa  165  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2160  two component transcriptional regulator  41.35 
 
 		 240 aa  165  5e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.63 
 
 		 242 aa  165  5.9999999999999996e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  42.68 
 
 		 245 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.79 
 
 		 240 aa  165  6.9999999999999995e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  38.3 
 
 		 241 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00276  two-component response regulator  38.79 
 
 		 235 aa  165  6.9999999999999995e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2121  DNA-binding response regulator  38.11 
 
 		 245 aa  164  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0885999  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2023  DNA-binding response regulator  38.11 
 
 		 245 aa  164  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485022  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0531  DNA-binding response regulator  38.11 
 
 		 245 aa  164  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3219  two component transcriptional regulator  41.6 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.42 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  42.13 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5210  two component response regulator  39.32 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4191  two component transcriptional regulator  37.02 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  41.88 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2404  two component transcriptional regulator  42.13 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  40.93 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>