More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0224 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0224  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  100 
 
 		 243 aa  492  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3588  two component transcriptional regulator  59.31 
 
 		 234 aa  274  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3280  two component transcriptional regulator  54.17 
 
 		 246 aa  268  4e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2270  two component transcriptional regulator  56.28 
 
 		 244 aa  267  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3376  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.32 
 
 		 242 aa  261  6.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2281  two-component transcriptional regulator  46.32 
 
 		 235 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0956  two component transcriptional regulator  46.32 
 
 		 235 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.357771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0046  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 233 aa  215  5.9999999999999996e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.214766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2215  two component transcriptional regulator  45.61 
 
 		 235 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4014  two component transcriptional regulator  45.73 
 
 		 234 aa  211  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4261  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 		 233 aa  207  9e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0111  two component transcriptional regulator  44.17 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0655  two component transcriptional regulator  41.28 
 
 		 242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.379452 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5579  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.78 
 
 		 248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00126537  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  43.83 
 
 		 243 aa  179  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  41.2 
 
 		 245 aa  178  7e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  40.77 
 
 		 245 aa  175  6e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.35 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  38.36 
 
 		 250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1998  two component transcriptional regulator  43.97 
 
 		 240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0541046  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 252 aa  172  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  41.1 
 
 		 240 aa  172  5.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  43.29 
 
 		 242 aa  172  5.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  40.89 
 
 		 238 aa  171  6.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5813  two component transcriptional regulator  40.95 
 
 		 253 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548874 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3326  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 243 aa  171  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1255  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.86 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1282  two component transcriptional regulator  38.75 
 
 		 249 aa  168  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 240 aa  168  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 244 aa  168  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.710276 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4076  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.57 
 
 		 253 aa  168  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.31516 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0413  putative transcriptional regulatory protein OmpR  40.44 
 
 		 238 aa  167  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16231  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  38.14 
 
 		 243 aa  166  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  41.82 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5277  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  41.82 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4667  two component transcriptional regulator  38.89 
 
 		 247 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  39.39 
 
 		 239 aa  165  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4376  winged helix family two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 247 aa  165  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  38.89 
 
 		 245 aa  165  5.9999999999999996e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  38.4 
 
 		 240 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.26 
 
 		 242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  39.42 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  41.36 
 
 		 242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03947  osmolarity response regulator  41.1 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  40.93 
 
 		 239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  39.74 
 
 		 244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3683  two component transcriptional regulator  39.48 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.801848  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65880  putative two-component response regulator  39.41 
 
 		 244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0780512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2116  response regulator receiver  41.1 
 
 		 244 aa  163  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124282 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  40.77 
 
 		 262 aa  162  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5717  putative two-component response regulator  39.41 
 
 		 245 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2393  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.1 
 
 		 244 aa  163  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1574  osmolarity response regulator  40.81 
 
 		 236 aa  163  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6165  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.95 
 
 		 245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.362427  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  39.39 
 
 		 251 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3731  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.6 
 
 		 246 aa  161  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2845  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 234 aa  161  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003939  TorCAD operon transcriptional regulatory protein TorR  37.83 
 
 		 236 aa  161  8.000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0753413  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2069  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.28 
 
 		 291 aa  161  9e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.501994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2546  osmolarity response regulator  38.79 
 
 		 245 aa  160  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0094  two component transcriptional regulator  38.02 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01583  DNA-binding transcriptional regulator TorR  37.66 
 
 		 237 aa  161  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  38.77 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.78 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3286  two component transcriptional regulator  41.92 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2345  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000474063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.49 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1003  osmolarity response regulator  42.65 
 
 		 244 aa  159  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal  0.39184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0710  two component transcriptional regulator  38.72 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1085  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.1 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1944  two component transcriptional regulator  39.47 
 
 		 238 aa  159  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2033  two component transcriptional regulator  37.77 
 
 		 238 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1879  osmolarity response regulator  46.24 
 
 		 244 aa  159  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.276509  normal  0.342548 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2307  osmolarity response regulator  46.24 
 
 		 244 aa  159  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0713504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  38.89 
 
 		 240 aa  159  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2176  two component transcriptional regulator  37.77 
 
 		 238 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120128  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1485  osmolarity response regulator  45.7 
 
 		 241 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.021777  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1253  osmolarity response regulator  45.7 
 
 		 244 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.512472  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2507  osmolarity response regulator  45.7 
 
 		 241 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.734124  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3325  osmolarity response regulator  45.7 
 
 		 244 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000316731  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5249  osmolarity response regulator  45.7 
 
 		 244 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204246  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2094  osmolarity response regulator  45.7 
 
 		 241 aa  159  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  37.29 
 
 		 246 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2352  osmolarity response regulator  45.7 
 
 		 244 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.260389  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1962  osmolarity response regulator  45.7 
 
 		 244 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187967  normal  0.0634815 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1333  osmolarity response regulator  45.7 
 
 		 244 aa  159  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00265076  decreased coverage  0.0000710625 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1853  osmolarity response regulator  45.7 
 
 		 244 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00101518  hitchhiker  0.0000149756 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2395  osmolarity response regulator  45.7 
 
 		 244 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6141  osmolarity response regulator  45.7 
 
 		 244 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120853  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1980  osmolarity response regulator  45.7 
 
 		 244 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0224779  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1926  osmolarity response regulator  45.7 
 
 		 244 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0250147  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1938  osmolarity response regulator  45.7 
 
 		 244 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0280828  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  35.81 
 
 		 236 aa  159  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.74 
 
 		 240 aa  159  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2713  osmolarity response regulator  38.36 
 
 		 245 aa  158  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394419  normal  0.0259821 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.7 
 
 		 240 aa  158  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>