More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3280 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3280  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 246 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2270  two component transcriptional regulator  80.89 
 
 		 244 aa  400  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0224  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  54.17 
 
 		 243 aa  268  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3588  two component transcriptional regulator  60.52 
 
 		 234 aa  258  8e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3376  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.6 
 
 		 242 aa  254  8e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4261  DNA-binding response regulator  44.21 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2281  two-component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2215  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0956  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 235 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.357771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0046  two component transcriptional regulator  44.02 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.214766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4014  two component transcriptional regulator  40.6 
 
 		 234 aa  185  5e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  44.87 
 
 		 243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  44.02 
 
 		 243 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0111  two component transcriptional regulator  41.45 
 
 		 239 aa  181  6e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1998  two component transcriptional regulator  45.49 
 
 		 240 aa  179  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0541046  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5579  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00126537  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1255  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.45 
 
 		 246 aa  179  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  40.93 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  40.93 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  41.42 
 
 		 236 aa  172  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3326  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 243 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  42.13 
 
 		 242 aa  170  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.62 
 
 		 275 aa  170  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 250 aa  169  5e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  41.6 
 
 		 245 aa  168  8e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 244 aa  167  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  41.13 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  42.36 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  39.74 
 
 		 241 aa  166  4e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  40.76 
 
 		 238 aa  165  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6165  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.08 
 
 		 245 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.362427  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.95 
 
 		 240 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5277  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 246 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 239 aa  162  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3382  two component transcriptional regulator  38.98 
 
 		 241 aa  163  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98781 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4376  winged helix family two component transcriptional regulator  40.85 
 
 		 247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0094  two component transcriptional regulator  40.6 
 
 		 246 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  42.31 
 
 		 262 aa  162  6e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4667  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 247 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1971  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 232 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.999465  normal  0.0504331 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7106  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.323714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0655  two component transcriptional regulator  38.63 
 
 		 242 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.379452 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4076  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.31516 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.98 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5813  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548874 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3683  two component transcriptional regulator  38.62 
 
 		 246 aa  159  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.801848  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0207  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.24 
 
 		 262 aa  159  4e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00814931  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 241 aa  158  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4191  two component transcriptional regulator  36.51 
 
 		 244 aa  158  6e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.52 
 
 		 242 aa  158  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2497  two component transcriptional regulator  40.95 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2033  two component transcriptional regulator  39.15 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3286  two component transcriptional regulator  40.95 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  38.89 
 
 		 245 aa  156  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.66 
 
 		 239 aa  156  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0710  two component transcriptional regulator  39.41 
 
 		 248 aa  156  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2116  response regulator receiver  40.96 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124282 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2393  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.96 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2176  two component transcriptional regulator  38.72 
 
 		 238 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120128  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2387  DNA-binding response regulator  38.36 
 
 		 236 aa  155  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 236 aa  155  6e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3730  winged helix family two component transcriptional regulator  38.72 
 
 		 238 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  41.05 
 
 		 259 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  40.69 
 
 		 240 aa  155  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 239 aa  155  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3900  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.28 
 
 		 259 aa  155  8e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 240 aa  154  9e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  41.05 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04421  two-component system regulatory protein  38.46 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65880  putative two-component response regulator  40.76 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0780512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03947  osmolarity response regulator  39.91 
 
 		 240 aa  153  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.82 
 
 		 246 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1282  two component transcriptional regulator  37.55 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1148  two component transcriptional regulator  41.32 
 
 		 243 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000285872  normal  0.61114 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1035  two component transcriptional regulator  38.75 
 
 		 246 aa  153  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3566  two component transcriptional regulator  36.73 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.291783  normal  0.121657 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.57 
 
 		 239 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.82 
 
 		 256 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.29 
 
 		 240 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.38 
 
 		 244 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.710276 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 241 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5717  putative two-component response regulator  40.34 
 
 		 245 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  41.48 
 
 		 242 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.89 
 
 		 246 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2105  two component transcriptional regulator  42.5 
 
 		 253 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2286  response regulator GltR  34.18 
 
 		 241 aa  152  5e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5596  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.82 
 
 		 235 aa  152  5e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  38.93 
 
 		 243 aa  151  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  38.5 
 
 		 240 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.03 
 
 		 246 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2069  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.59 
 
 		 291 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.501994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  37.87 
 
 		 249 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3731  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.45 
 
 		 246 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00276  two-component response regulator  37.23 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3373  two component transcriptional regulator  36.55 
 
 		 238 aa  150  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.584151  normal  0.399207 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2546  osmolarity response regulator  38.89 
 
 		 245 aa  149  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2155  two component transcriptional regulator  41.91 
 
 		 261 aa  149  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.128892 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2354  two component transcriptional regulator  42.44 
 
 		 235 aa  149  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.402981 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0287  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 239 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  38.4 
 
 		 246 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>