More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0318 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0318  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 241 aa  468  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523003  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0510  two component transcriptional regulator  53.1 
 
 		 234 aa  223  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0208  two component transcriptional regulator  50.43 
 
 		 240 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 224 aa  218  1e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00974604  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8578  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.18 
 
 		 231 aa  217  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0565107  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3564  two component transcriptional regulator  52.51 
 
 		 230 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153344  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0151  two component transcriptional regulator  50.21 
 
 		 241 aa  216  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4891  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.71 
 
 		 249 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2643  two component transcriptional regulator  52 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0259  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.09 
 
 		 240 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  50.41 
 
 		 245 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3392  two component transcriptional regulator  46.98 
 
 		 239 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000345034  normal  0.431956 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.33 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.33 
 
 		 234 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1181  winged helix family two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 232 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.037877  normal  0.73042 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2325  two component transcriptional regulator  47.81 
 
 		 238 aa  206  3e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1211  two component transcriptional regulator  48.88 
 
 		 232 aa  205  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.676109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001870  two-component system response regulator OmpR  46.78 
 
 		 239 aa  205  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.360284  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2022  two component transcriptional regulator  47.81 
 
 		 238 aa  205  6e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.730555 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00621  osmolarity response regulator  46.78 
 
 		 239 aa  204  8e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3138  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.53 
 
 		 238 aa  204  8e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224709  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  48.25 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4235  two component transcriptional regulator  48.25 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.207223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1193  two component transcriptional regulator  47.81 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0519929  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4597  osmolarity response regulator  45.89 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0196  two component transcriptional regulator  48.02 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815382  hitchhiker  0.00535544 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1321  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0200617  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  47.03 
 
 		 240 aa  203  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  51.54 
 
 		 242 aa  202  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  51.12 
 
 		 230 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  50.89 
 
 		 259 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0150  osmolarity response regulator  45.73 
 
 		 241 aa  201  7e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0168  osmolarity response regulator  44.87 
 
 		 241 aa  201  8e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3510  osmolarity response regulator  46.15 
 
 		 241 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2321  two component transcriptional regulator  48.7 
 
 		 244 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483652  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  48.47 
 
 		 243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  45.96 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03947  osmolarity response regulator  45.3 
 
 		 240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.7 
 
 		 223 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0194  two component transcriptional regulator  46.75 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  46.56 
 
 		 252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4222  two-component response regulator  47.83 
 
 		 236 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.560932  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0780  two-component response regulator  42.08 
 
 		 224 aa  198  7e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2286  osmolarity response regulator  46.12 
 
 		 240 aa  197  9e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  45.11 
 
 		 241 aa  197  9e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.03 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4017  osmolarity response regulator  44.26 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4206  osmolarity response regulator  45.3 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4134  osmolarity response regulator  45.3 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0669  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.851863  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3811  osmolarity response regulator  46.15 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3902  osmolarity response regulator  46.15 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.140952 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4338  osmolarity response regulator  45.3 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49440  two-component response regulator  47.83 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000474992  normal  0.747521 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3146  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  50 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.119762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2936  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3637  osmolarity response regulator  44.02 
 
 		 241 aa  196  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2014  two component transcriptional regulator  48.42 
 
 		 239 aa  196  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193015 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  45.5 
 
 		 236 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3846  osmolarity response regulator  45.11 
 
 		 241 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3538  osmolarity response regulator  43.59 
 
 		 240 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000279148  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0328  two component transcriptional regulator  49.79 
 
 		 252 aa  195  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.5 
 
 		 240 aa  194  7e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2740  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 231 aa  194  7e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.307567  normal  0.0284463 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0498  DNA-binding response regulator  42.99 
 
 		 224 aa  194  7e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00199813  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  47.84 
 
 		 261 aa  195  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2529  two component transcriptional regulator  51.3 
 
 		 232 aa  195  7e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00604151 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0218  osmolarity response regulator  44.02 
 
 		 241 aa  194  7e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0880  two component transcriptional regulator  51.74 
 
 		 234 aa  194  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.220279 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1362  DNA-binding response regulator  42.99 
 
 		 224 aa  194  8.000000000000001e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1241  DNA-binding response regulator  42.99 
 
 		 224 aa  194  8.000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0204  osmolarity response regulator  44.64 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.5 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3391  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0275  two component transcriptional regulator  49.35 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  44 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0359  osmolarity response regulator  44.08 
 
 		 245 aa  192  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4245  two component transcriptional regulator  48 
 
 		 240 aa  192  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0492398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  46.93 
 
 		 237 aa  192  4e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3980  osmolarity response regulator  45.02 
 
 		 239 aa  192  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.75818  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 237 aa  192  5e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0308  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.02 
 
 		 239 aa  192  5e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3741  osmolarity response regulator  44.64 
 
 		 239 aa  192  5e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3809  osmolarity response regulator  45.02 
 
 		 239 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3602  osmolarity response regulator  45.02 
 
 		 239 aa  192  5e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0213  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.62 
 
 		 238 aa  192  5e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0395409  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3700  osmolarity response regulator  45.02 
 
 		 239 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3879  osmolarity response regulator  45.02 
 
 		 239 aa  192  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0172  osmolarity response regulator  44.64 
 
 		 239 aa  192  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3686  osmolarity response regulator  45.02 
 
 		 239 aa  192  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550003 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3703  osmolarity response regulator  45.02 
 
 		 239 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3871  osmolarity response regulator  45.02 
 
 		 239 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1063  response regulator receiver domain-containing protein  42.6 
 
 		 225 aa  192  5e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00754715  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3775  osmolarity response regulator  45.02 
 
 		 239 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0308  osmolarity response regulator  45.02 
 
 		 239 aa  192  5e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0516186 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4621  osmolarity response regulator  45.02 
 
 		 239 aa  192  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4711  osmolarity response regulator  45.02 
 
 		 239 aa  192  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3818  osmolarity response regulator  45.02 
 
 		 239 aa  192  5e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3784  osmolarity response regulator  45.02 
 
 		 239 aa  192  5e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>