More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3138 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3138  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 238 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224709  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  67.86 
 
 		 245 aa  283  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.86 
 
 		 234 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.86 
 
 		 234 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0880  two component transcriptional regulator  66.1 
 
 		 234 aa  261  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.220279 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2014  two component transcriptional regulator  50.9 
 
 		 239 aa  205  5e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193015 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0318  two component transcriptional regulator  51.53 
 
 		 241 aa  204  8e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523003  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3564  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 230 aa  201  9e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153344  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  47.35 
 
 		 236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4460  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 230 aa  198  6e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.16 
 
 		 240 aa  198  6e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8578  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 		 231 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0565107  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0510  two component transcriptional regulator  48.9 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1393  transcriptional regulatory protein CpxR  43.95 
 
 		 226 aa  194  9e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  47.19 
 
 		 245 aa  194  9e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  47.19 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.35 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1603  transcriptional regulatory protein CpxR  43.95 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  48.48 
 
 		 242 aa  192  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2643  two component transcriptional regulator  49.56 
 
 		 236 aa  191  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0208  two component transcriptional regulator  47.21 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0194  two component transcriptional regulator  51.29 
 
 		 251 aa  187  9e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.31 
 
 		 275 aa  187  9e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  49.12 
 
 		 242 aa  187  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  46.12 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3391  two component transcriptional regulator  47.75 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  45.98 
 
 		 227 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  49.12 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  49.34 
 
 		 259 aa  186  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0716  two component transcriptional regulator  43.4 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0259  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.96 
 
 		 240 aa  186  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3146  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  48.67 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.119762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0196  two component transcriptional regulator  45.34 
 
 		 238 aa  186  3e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815382  hitchhiker  0.00535544 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.22 
 
 		 237 aa  185  5e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0213  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.86 
 
 		 238 aa  185  6e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0395409  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  45.22 
 
 		 241 aa  185  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 239 aa  184  8e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 237 aa  184  8e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2279  DNA-binding response regulator  43.04 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.05 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.1 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0275  two component transcriptional regulator  49.36 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2264  transcriptional regulator CpxR  44.2 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000005667  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4245  two component transcriptional regulator  45.38 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0492398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  49.09 
 
 		 231 aa  182  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.64 
 
 		 231 aa  182  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1181  winged helix family two component transcriptional regulator  46.64 
 
 		 232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.037877  normal  0.73042 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2022  two component transcriptional regulator  45.11 
 
 		 238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.730555 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1211  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 		 232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.676109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4222  two-component response regulator  46.55 
 
 		 236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.560932  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3716  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  44.96 
 
 		 247 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.422774  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  47.11 
 
 		 248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2325  two component transcriptional regulator  45.3 
 
 		 238 aa  182  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0151  two component transcriptional regulator  46.38 
 
 		 241 aa  182  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  43.53 
 
 		 257 aa  182  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.89 
 
 		 236 aa  182  6e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  46.35 
 
 		 241 aa  181  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4235  two component transcriptional regulator  45.98 
 
 		 232 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.207223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.76 
 
 		 246 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41260  putative two-component response regulator  45.13 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.923976 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  42.55 
 
 		 239 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  42.55 
 
 		 239 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0934  DNA-binding response regulator  44.35 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.61 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2259  response regulator protein  44.35 
 
 		 288 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625515  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1193  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0519929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.54 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00974604  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 246 aa  179  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 246 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  45.26 
 
 		 246 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 246 aa  179  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49440  two-component response regulator  45.49 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000474992  normal  0.747521 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1019  DNA-binding response regulator  44.35 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.79357  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  43.11 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.84 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4429  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.9 
 
 		 247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23129  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0309  two component transcriptional regulator  40.95 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  45.26 
 
 		 246 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  42.55 
 
 		 239 aa  179  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  45.26 
 
 		 246 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.58 
 
 		 246 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  45.69 
 
 		 246 aa  178  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  42.55 
 
 		 239 aa  178  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1672  DNA-binding response regulator  44.73 
 
 		 247 aa  178  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  42.55 
 
 		 239 aa  178  7e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  42.55 
 
 		 239 aa  178  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  42.55 
 
 		 239 aa  178  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  42.55 
 
 		 239 aa  178  7e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  42.55 
 
 		 239 aa  178  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0328  two component transcriptional regulator  49.16 
 
 		 252 aa  177  9e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  44.83 
 
 		 246 aa  177  9e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.02 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0305  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1739  DNA-binding response regulator  43.91 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203383  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3498  putative two-component response regulator  44.25 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0401889  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2321  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>