More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8578 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8578  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 231 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0565107  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3564  two component transcriptional regulator  92.64 
 
 		 230 aa  412  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153344  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2014  two component transcriptional regulator  58.37 
 
 		 239 aa  268  5e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193015 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2643  two component transcriptional regulator  59.15 
 
 		 236 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0510  two component transcriptional regulator  58.12 
 
 		 234 aa  251  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0151  two component transcriptional regulator  55.19 
 
 		 241 aa  249  3e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0259  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.65 
 
 		 240 aa  248  7e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0208  two component transcriptional regulator  55 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0735  two component transcriptional regulator  57.08 
 
 		 235 aa  242  3.9999999999999997e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2160  two component transcriptional regulator  52.72 
 
 		 240 aa  236  3e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1820  two component transcriptional regulator  51.46 
 
 		 240 aa  234  7e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2103  two component transcriptional regulator  51.46 
 
 		 240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0666731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0194  two component transcriptional regulator  55.97 
 
 		 251 aa  229  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0213  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.88 
 
 		 238 aa  226  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0395409  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0275  two component transcriptional regulator  57.38 
 
 		 239 aa  224  6e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.85 
 
 		 234 aa  224  9e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.85 
 
 		 234 aa  224  9e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  52.89 
 
 		 245 aa  222  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0328  two component transcriptional regulator  55.6 
 
 		 252 aa  221  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2635  two component transcriptional regulator  53.97 
 
 		 239 aa  219  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.179803  normal  0.648849 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0318  two component transcriptional regulator  53.18 
 
 		 241 aa  217  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523003  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0324  osmolarity response regulator  48.68 
 
 		 239 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566854  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4075  osmolarity response regulator  48.9 
 
 		 239 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3898  osmolarity response regulator  48.9 
 
 		 239 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0244  osmolarity response regulator  48.9 
 
 		 239 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0172  osmolarity response regulator  48.46 
 
 		 239 aa  213  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3741  osmolarity response regulator  48.46 
 
 		 239 aa  213  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3980  osmolarity response regulator  48.46 
 
 		 239 aa  213  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.75818  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0308  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.46 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3784  osmolarity response regulator  48.46 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3775  osmolarity response regulator  48.46 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3602  osmolarity response regulator  48.46 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0308  osmolarity response regulator  48.46 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0516186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3686  osmolarity response regulator  48.46 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550003 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3871  osmolarity response regulator  48.46 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3809  osmolarity response regulator  48.46 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3818  osmolarity response regulator  48.46 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3703  osmolarity response regulator  48.46 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3879  osmolarity response regulator  48.46 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4711  osmolarity response regulator  48.46 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3700  osmolarity response regulator  48.46 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4621  osmolarity response regulator  48.46 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03257  osmolarity response regulator  48.67 
 
 		 239 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03209  hypothetical protein  48.67 
 
 		 239 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4597  osmolarity response regulator  48.68 
 
 		 240 aa  211  7.999999999999999e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0880  two component transcriptional regulator  53.1 
 
 		 234 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.220279 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  48.25 
 
 		 257 aa  210  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001870  two-component system response regulator OmpR  48.25 
 
 		 239 aa  210  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.360284  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  49.78 
 
 		 241 aa  209  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00621  osmolarity response regulator  48.25 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  47.14 
 
 		 240 aa  209  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4222  two-component response regulator  50.88 
 
 		 236 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.560932  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2286  osmolarity response regulator  48.46 
 
 		 240 aa  209  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.33 
 
 		 240 aa  208  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3811  osmolarity response regulator  49.34 
 
 		 241 aa  208  5e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3902  osmolarity response regulator  49.34 
 
 		 241 aa  208  5e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.140952 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0196  two component transcriptional regulator  49.35 
 
 		 238 aa  208  6e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815382  hitchhiker  0.00535544 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4206  osmolarity response regulator  48.91 
 
 		 241 aa  208  7e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4338  osmolarity response regulator  48.91 
 
 		 241 aa  208  7e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4134  osmolarity response regulator  48.91 
 
 		 241 aa  208  7e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3846  osmolarity response regulator  49.78 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  49.34 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6199  OmpR family two component response transcriptional regulator  48.9 
 
 		 255 aa  206  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1321  two component transcriptional regulator  47.64 
 
 		 234 aa  207  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0200617  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46550  response regulator  50.42 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203573  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0126  osmolarity response regulator  46.09 
 
 		 254 aa  205  5e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2354  two component transcriptional regulator  50.66 
 
 		 235 aa  205  5e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.402981 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0135  osmolarity response regulator  46.09 
 
 		 254 aa  205  5e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49440  two-component response regulator  50 
 
 		 236 aa  204  8e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000474992  normal  0.747521 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3392  two component transcriptional regulator  47.83 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000345034  normal  0.431956 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2121  osmolarity response regulator  45.45 
 
 		 248 aa  204  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.201602  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0669  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.851863  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2325  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 		 238 aa  204  1e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0204  osmolarity response regulator  46.93 
 
 		 239 aa  203  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 		 225 aa  202  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3510  osmolarity response regulator  47.66 
 
 		 241 aa  202  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0168  osmolarity response regulator  48.02 
 
 		 241 aa  202  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2022  two component transcriptional regulator  48.91 
 
 		 238 aa  202  4e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.730555 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0150  osmolarity response regulator  47.66 
 
 		 241 aa  202  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1393  transcriptional regulatory protein CpxR  45.54 
 
 		 226 aa  201  7e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0050  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.52 
 
 		 235 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4017  osmolarity response regulator  47.81 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1603  transcriptional regulatory protein CpxR  45.54 
 
 		 226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0654  two component transcriptional regulator  48.52 
 
 		 244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3538  osmolarity response regulator  46.38 
 
 		 240 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000279148  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03947  osmolarity response regulator  46.29 
 
 		 240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3637  osmolarity response regulator  47.37 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  45.26 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2321  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 244 aa  198  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483652  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0218  osmolarity response regulator  46.05 
 
 		 241 aa  198  5e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3138  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 		 238 aa  197  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224709  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2155  two component transcriptional regulator  47.44 
 
 		 261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.128892 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  48.9 
 
 		 241 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.19 
 
 		 237 aa  196  4.0000000000000005e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  44.78 
 
 		 245 aa  195  5.000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.3 
 
 		 240 aa  194  8.000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  45.45 
 
 		 243 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  48.9 
 
 		 240 aa  193  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  47.58 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>