More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0328 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0328  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 252 aa  502  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0510  two component transcriptional regulator  79.1 
 
 		 234 aa  368  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0259  two component transcriptional regulator, winged helix family  75.9 
 
 		 240 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0194  two component transcriptional regulator  83.2 
 
 		 251 aa  364  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0213  two component transcriptional regulator, winged helix family  82.79 
 
 		 238 aa  362  4e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0395409  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0275  two component transcriptional regulator  81.71 
 
 		 239 aa  361  7.0000000000000005e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0151  two component transcriptional regulator  75.71 
 
 		 241 aa  347  9e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0208  two component transcriptional regulator  74.8 
 
 		 240 aa  346  3e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2635  two component transcriptional regulator  77.14 
 
 		 239 aa  340  1e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.179803  normal  0.648849 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2643  two component transcriptional regulator  59.35 
 
 		 236 aa  269  4e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2014  two component transcriptional regulator  56.97 
 
 		 239 aa  261  8e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193015 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8578  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.6 
 
 		 231 aa  242  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0565107  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3564  two component transcriptional regulator  54.77 
 
 		 230 aa  237  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153344  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0735  two component transcriptional regulator  57.38 
 
 		 235 aa  237  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2160  two component transcriptional regulator  48.99 
 
 		 240 aa  223  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1820  two component transcriptional regulator  48.57 
 
 		 240 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2103  two component transcriptional regulator  48.57 
 
 		 240 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0666731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0318  two component transcriptional regulator  50.21 
 
 		 241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523003  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  49.58 
 
 		 245 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0196  two component transcriptional regulator  46 
 
 		 238 aa  209  4e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815382  hitchhiker  0.00535544 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 234 aa  208  6e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2325  two component transcriptional regulator  46.8 
 
 		 238 aa  208  7e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 234 aa  207  9e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2022  two component transcriptional regulator  47.33 
 
 		 238 aa  206  3e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.730555 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  48.55 
 
 		 241 aa  202  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1321  two component transcriptional regulator  45.9 
 
 		 234 aa  202  5e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0200617  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0880  two component transcriptional regulator  51.88 
 
 		 234 aa  201  9e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.220279 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2321  two component transcriptional regulator  46.59 
 
 		 244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483652  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1980  osmolarity response regulator  44.54 
 
 		 243 aa  198  7.999999999999999e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431202  normal  0.459947 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0669  two component transcriptional regulator  46.99 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.851863  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  46.03 
 
 		 246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3138  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.16 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224709  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2892  two component transcriptional regulator  45.49 
 
 		 233 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440569  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4621  osmolarity response regulator  43.93 
 
 		 239 aa  195  6e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3741  osmolarity response regulator  43.75 
 
 		 239 aa  194  8.000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0172  osmolarity response regulator  43.75 
 
 		 239 aa  194  8.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3980  osmolarity response regulator  43.75 
 
 		 239 aa  194  8.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.75818  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03257  osmolarity response regulator  43.51 
 
 		 239 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  47.13 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.85 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  45.85 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03209  hypothetical protein  43.51 
 
 		 239 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0308  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.51 
 
 		 239 aa  193  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3703  osmolarity response regulator  43.51 
 
 		 239 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4711  osmolarity response regulator  43.51 
 
 		 239 aa  193  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3879  osmolarity response regulator  43.51 
 
 		 239 aa  193  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0308  osmolarity response regulator  43.51 
 
 		 239 aa  193  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0516186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3686  osmolarity response regulator  43.51 
 
 		 239 aa  193  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550003 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3775  osmolarity response regulator  43.51 
 
 		 239 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.72 
 
 		 251 aa  192  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3602  osmolarity response regulator  43.51 
 
 		 239 aa  193  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3809  osmolarity response regulator  43.51 
 
 		 239 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3871  osmolarity response regulator  43.51 
 
 		 239 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.91 
 
 		 240 aa  192  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3818  osmolarity response regulator  43.51 
 
 		 239 aa  193  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3784  osmolarity response regulator  43.51 
 
 		 239 aa  193  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3700  osmolarity response regulator  43.51 
 
 		 239 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0244  osmolarity response regulator  43.51 
 
 		 239 aa  192  5e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0324  osmolarity response regulator  43.33 
 
 		 239 aa  192  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566854  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3898  osmolarity response regulator  43.51 
 
 		 239 aa  192  6e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4075  osmolarity response regulator  43.51 
 
 		 239 aa  192  6e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  44.4 
 
 		 244 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3571  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4222  two-component response regulator  45.68 
 
 		 236 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.560932  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2286  osmolarity response regulator  43.57 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0290  response regulator receiver domain-containing protein  39.43 
 
 		 236 aa  190  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870097  hitchhiker  0.0000582863 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49440  two-component response regulator  46.5 
 
 		 236 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000474992  normal  0.747521 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  45.15 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0204  osmolarity response regulator  43.33 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  44.58 
 
 		 241 aa  189  4e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  44.17 
 
 		 228 aa  189  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  42.98 
 
 		 243 aa  189  5e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  43.33 
 
 		 240 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0934  DNA-binding response regulator  44.62 
 
 		 240 aa  188  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1019  DNA-binding response regulator  44.62 
 
 		 240 aa  188  7e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.79357  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03947  osmolarity response regulator  43.75 
 
 		 240 aa  188  8e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4338  osmolarity response regulator  44.58 
 
 		 241 aa  188  9e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  42.56 
 
 		 227 aa  188  9e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2307  osmolarity response regulator  50.8 
 
 		 244 aa  187  9e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0713504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1879  osmolarity response regulator  50.8 
 
 		 244 aa  187  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.276509  normal  0.342548 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4134  osmolarity response regulator  44.58 
 
 		 241 aa  188  9e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4206  osmolarity response regulator  44.58 
 
 		 241 aa  188  9e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1253  osmolarity response regulator  50.27 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.512472  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1980  osmolarity response regulator  50.27 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0224779  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3325  osmolarity response regulator  50.27 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000316731  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1485  osmolarity response regulator  50.27 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.021777  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2395  osmolarity response regulator  50.27 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3219  two component transcriptional regulator  43.27 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2507  osmolarity response regulator  50.27 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.734124  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2259  response regulator protein  44.62 
 
 		 288 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625515  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  42.21 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2094  osmolarity response regulator  50.27 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2352  osmolarity response regulator  50.27 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.260389  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3538  osmolarity response regulator  43.93 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000279148  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1333  osmolarity response regulator  50.27 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00265076  decreased coverage  0.0000710625 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1853  osmolarity response regulator  50.27 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00101518  hitchhiker  0.0000149756 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1926  osmolarity response regulator  50.27 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0250147  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  44.17 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.24 
 
 		 224 aa  187  2e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00974604  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1739  DNA-binding response regulator  44.22 
 
 		 240 aa  186  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>