More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2740 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2740  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  451  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.307567  normal  0.0284463 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4891  two component transcriptional regulator, winged helix family  75 
 
 		 249 aa  328  4e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2529  two component transcriptional regulator  68.12 
 
 		 232 aa  282  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00604151 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0318  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 241 aa  194  7e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523003  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  45.65 
 
 		 243 aa  180  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0050  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 		 235 aa  178  7e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3564  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 230 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153344  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0676  two comoponent transcriptional regulator  44.78 
 
 		 231 aa  175  4e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021656  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1019  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 240 aa  175  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.79357  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0934  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 240 aa  175  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2259  response regulator protein  44.44 
 
 		 288 aa  174  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625515  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1739  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 240 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203383  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3275  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.96 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000116561  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3195  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2753  transcriptional regulatory protein CpxR  43.3 
 
 		 227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000494292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8578  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.1 
 
 		 231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0565107  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1424  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 		 227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00122466  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3452  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 		 226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186092 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2936  two component transcriptional regulator  44.98 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1313  transcriptional regulatory protein CpxR  42.86 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.186950000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0771  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.25 
 
 		 226 aa  171  5.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000423816  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001059  putative two-component response regulator  41.41 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  39.39 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.89 
 
 		 237 aa  171  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2483  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 233 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0259  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.1 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0716  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  43.88 
 
 		 252 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4460  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1517  DNA-binding response regulator  43.56 
 
 		 240 aa  168  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.184346  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1144  DNA-binding response regulator  43.56 
 
 		 240 aa  168  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0096  DNA-binding response regulator  43.56 
 
 		 240 aa  168  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0972666  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.96 
 
 		 240 aa  168  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  43.81 
 
 		 227 aa  168  6e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.05 
 
 		 234 aa  168  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.05 
 
 		 234 aa  167  9e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3454  winged helix family two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 279 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.85 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.27 
 
 		 236 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0196  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 		 238 aa  167  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815382  hitchhiker  0.00535544 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  37.89 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  38.94 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.29 
 
 		 243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1008  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.25 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.17 
 
 		 247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2315  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  43.36 
 
 		 227 aa  165  4e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 		 244 aa  165  5e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2643  two component transcriptional regulator  44.78 
 
 		 236 aa  165  5e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  42.29 
 
 		 242 aa  164  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1321  two component transcriptional regulator  40.69 
 
 		 234 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0200617  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  42.29 
 
 		 242 aa  164  8e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1181  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.89 
 
 		 234 aa  164  8e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335068 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2014  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 239 aa  164  8e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193015 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0510  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 234 aa  164  8e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0208  two component transcriptional regulator  42.31 
 
 		 240 aa  164  9e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 232 aa  164  9e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.91 
 
 		 242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1500  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3064  response regulator transcription regulator protein  44.49 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.38417 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  41.15 
 
 		 250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  42.29 
 
 		 244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3029  two component transcriptional regulator  45.89 
 
 		 238 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2325  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  37.17 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 		 241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  36.73 
 
 		 223 aa  163  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2022  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 238 aa  162  3e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.730555 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.17 
 
 		 236 aa  162  3e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6199  OmpR family two component response transcriptional regulator  40.89 
 
 		 255 aa  162  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  36.73 
 
 		 223 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.2 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  36.73 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  36.73 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  37.17 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.28 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02061  two-component response regulator  42.67 
 
 		 248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.540525 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  36.73 
 
 		 223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  36.73 
 
 		 223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  36.73 
 
 		 223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2321  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 244 aa  161  7e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483652  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 242 aa  161  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 237 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1063  response regulator receiver domain-containing protein  35.5 
 
 		 225 aa  161  8.000000000000001e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00754715  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01694  two component response regulator transcription regulator protein  44.49 
 
 		 259 aa  161  9e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  36.73 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1930  two component transcriptional regulator  40.71 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.465475  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1393  transcriptional regulatory protein CpxR  40.09 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1603  transcriptional regulatory protein CpxR  40.09 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0308  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.030574  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26531  two-component response regulator  42.67 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 		 240 aa  159  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  41.85 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>