More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3564 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3564  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  447  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153344  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8578  two component transcriptional regulator, winged helix family  92.64 
 
 		 231 aa  412  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0565107  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2643  two component transcriptional regulator  62.55 
 
 		 236 aa  278  6e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2014  two component transcriptional regulator  59.23 
 
 		 239 aa  267  8e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193015 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0510  two component transcriptional regulator  56.84 
 
 		 234 aa  248  6e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0735  two component transcriptional regulator  59.66 
 
 		 235 aa  246  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0151  two component transcriptional regulator  54.77 
 
 		 241 aa  245  4e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0259  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.22 
 
 		 240 aa  245  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2160  two component transcriptional regulator  53.56 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0208  two component transcriptional regulator  54.58 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1820  two component transcriptional regulator  51.88 
 
 		 240 aa  238  5.999999999999999e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2103  two component transcriptional regulator  51.88 
 
 		 240 aa  238  8e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0666731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.71 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.71 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  54.91 
 
 		 245 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0194  two component transcriptional regulator  55.46 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0213  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.04 
 
 		 238 aa  221  8e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0395409  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0275  two component transcriptional regulator  56.78 
 
 		 239 aa  221  8e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0318  two component transcriptional regulator  52.51 
 
 		 241 aa  218  8.999999999999998e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523003  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  47.19 
 
 		 257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0328  two component transcriptional regulator  54.36 
 
 		 252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46550  response regulator  51.69 
 
 		 267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203573  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0880  two component transcriptional regulator  54.42 
 
 		 234 aa  215  5e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.220279 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0324  osmolarity response regulator  48.68 
 
 		 239 aa  215  5e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566854  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0244  osmolarity response regulator  48.68 
 
 		 239 aa  214  9e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4075  osmolarity response regulator  48.68 
 
 		 239 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3898  osmolarity response regulator  48.68 
 
 		 239 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0308  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.25 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4711  osmolarity response regulator  48.25 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3809  osmolarity response regulator  48.25 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4621  osmolarity response regulator  48.25 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3871  osmolarity response regulator  48.25 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3686  osmolarity response regulator  48.25 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550003 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3818  osmolarity response regulator  48.25 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3775  osmolarity response regulator  48.25 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3703  osmolarity response regulator  48.25 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3700  osmolarity response regulator  48.25 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0308  osmolarity response regulator  48.25 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0516186 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3879  osmolarity response regulator  48.25 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3784  osmolarity response regulator  48.25 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3602  osmolarity response regulator  48.25 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  48.52 
 
 		 241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0172  osmolarity response regulator  48.25 
 
 		 239 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3741  osmolarity response regulator  48.25 
 
 		 239 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0196  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 238 aa  212  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815382  hitchhiker  0.00535544 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3980  osmolarity response regulator  48.25 
 
 		 239 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.75818  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  47.37 
 
 		 240 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3811  osmolarity response regulator  48.52 
 
 		 241 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3902  osmolarity response regulator  48.52 
 
 		 241 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.140952 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03257  osmolarity response regulator  48.46 
 
 		 239 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2635  two component transcriptional regulator  52.72 
 
 		 239 aa  212  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.179803  normal  0.648849 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03209  hypothetical protein  48.46 
 
 		 239 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3846  osmolarity response regulator  48.52 
 
 		 241 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4206  osmolarity response regulator  48.1 
 
 		 241 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4338  osmolarity response regulator  48.1 
 
 		 241 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4134  osmolarity response regulator  48.1 
 
 		 241 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  48.52 
 
 		 241 aa  211  7e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.09 
 
 		 240 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4597  osmolarity response regulator  47.81 
 
 		 240 aa  209  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2325  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 238 aa  209  4e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6199  OmpR family two component response transcriptional regulator  49.34 
 
 		 255 aa  208  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3510  osmolarity response regulator  47.68 
 
 		 241 aa  207  9e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2022  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.730555 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1321  two component transcriptional regulator  47.64 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0200617  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3392  two component transcriptional regulator  46.52 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000345034  normal  0.431956 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  51.54 
 
 		 241 aa  206  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0168  osmolarity response regulator  47.26 
 
 		 241 aa  205  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4222  two-component response regulator  48.92 
 
 		 236 aa  205  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.560932  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.98 
 
 		 240 aa  205  5e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0150  osmolarity response regulator  47.68 
 
 		 241 aa  205  6e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  47.41 
 
 		 243 aa  204  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  51.98 
 
 		 241 aa  204  8e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001870  two-component system response regulator OmpR  46.93 
 
 		 239 aa  204  8e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.360284  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.98 
 
 		 241 aa  204  8e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2286  osmolarity response regulator  46.35 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00621  osmolarity response regulator  46.93 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4017  osmolarity response regulator  47.83 
 
 		 241 aa  202  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2354  two component transcriptional regulator  51.54 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.402981 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3637  osmolarity response regulator  46.84 
 
 		 241 aa  202  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3146  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.96 
 
 		 234 aa  202  5e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.119762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49440  two-component response regulator  49.35 
 
 		 236 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000474992  normal  0.747521 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0050  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.83 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  49.1 
 
 		 236 aa  201  6e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  49.1 
 
 		 240 aa  201  7e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3138  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 238 aa  201  8e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224709  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3538  osmolarity response regulator  45.34 
 
 		 240 aa  201  9e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000279148  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1853  osmolarity response regulator  50.24 
 
 		 244 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00101518  hitchhiker  0.0000149756 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2395  osmolarity response regulator  50.24 
 
 		 244 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2507  osmolarity response regulator  50.24 
 
 		 241 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.734124  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2352  osmolarity response regulator  50.24 
 
 		 244 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.260389  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5249  osmolarity response regulator  50.24 
 
 		 244 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204246  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2094  osmolarity response regulator  50.24 
 
 		 241 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1980  osmolarity response regulator  50.24 
 
 		 244 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0224779  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1962  osmolarity response regulator  50.24 
 
 		 244 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187967  normal  0.0634815 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6141  osmolarity response regulator  50.24 
 
 		 244 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120853  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1253  osmolarity response regulator  50.24 
 
 		 244 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.512472  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1926  osmolarity response regulator  50.24 
 
 		 244 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0250147  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3325  osmolarity response regulator  50.24 
 
 		 244 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000316731  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1938  osmolarity response regulator  50.24 
 
 		 244 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0280828  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1333  osmolarity response regulator  50.24 
 
 		 244 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00265076  decreased coverage  0.0000710625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>