More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0283 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0283  two component transcriptional regulator  100 
 
 
243 aa  492  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.126158 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1035  two component transcriptional regulator  74.39 
 
 
246 aa  364  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5596  two component transcriptional regulator, winged helix family  75.42 
 
 
235 aa  360  2e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4102  DNA-binding response regulator  75.21 
 
 
239 aa  354  5.999999999999999e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0131  two component transcriptional regulator  73.36 
 
 
245 aa  343  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.364585  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4024  DNA-binding response regulator  73.36 
 
 
245 aa  343  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1971  two component transcriptional regulator  47.37 
 
 
232 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.999465  normal  0.0504331 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.64 
 
 
239 aa  193  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  43.39 
 
 
243 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  43.83 
 
 
241 aa  189  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  43.64 
 
 
245 aa  189  4e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  43.64 
 
 
245 aa  189  5e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5210  two component response regulator  44.07 
 
 
241 aa  186  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.16 
 
 
240 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  44.16 
 
 
237 aa  186  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.77 
 
 
275 aa  184  9e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  45.15 
 
 
239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  45.26 
 
 
239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  43.22 
 
 
243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  45.34 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  40.83 
 
 
236 aa  182  5.0000000000000004e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6199  OmpR family two component response transcriptional regulator  42.86 
 
 
255 aa  182  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 
239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5579  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.37 
 
 
248 aa  178  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00126537  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4191  two component transcriptional regulator  43.33 
 
 
244 aa  178  8e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2387  DNA-binding response regulator  41.7 
 
 
236 aa  178  9e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  41.2 
 
 
238 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2121  osmolarity response regulator  42.67 
 
 
248 aa  176  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.201602  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5813  two component transcriptional regulator  43.8 
 
 
253 aa  176  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548874 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 
236 aa  175  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 
240 aa  175  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0126  osmolarity response regulator  41.42 
 
 
254 aa  175  6e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0135  osmolarity response regulator  41.42 
 
 
254 aa  175  6e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  41.53 
 
 
240 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2374  two component transcriptional regulator  45 
 
 
245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.348064  normal  0.588953 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  41.42 
 
 
241 aa  172  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.42 
 
 
241 aa  172  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6165  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 
245 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.362427  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3772  two component transcriptional regulator  44.4 
 
 
240 aa  172  5.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.83932 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4048  two component transcriptional regulator  44.4 
 
 
240 aa  172  5.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507063  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  41 
 
 
240 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2092  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.63 
 
 
263 aa  171  7.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.187111  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 
241 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0413  putative transcriptional regulatory protein OmpR  40.77 
 
 
238 aa  171  9e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16231  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  42.44 
 
 
247 aa  171  9e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  41.56 
 
 
246 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  41.56 
 
 
246 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4597  osmolarity response regulator  41.28 
 
 
240 aa  170  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.25 
 
 
256 aa  170  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2235  two component transcriptional regulator  39.74 
 
 
236 aa  169  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 
246 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  41.88 
 
 
240 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3029  two component transcriptional regulator  43.33 
 
 
238 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452516  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  42.24 
 
 
246 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  40.6 
 
 
250 aa  170  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  40.51 
 
 
251 aa  169  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1998  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 
240 aa  169  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0541046  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2286  osmolarity response regulator  41.99 
 
 
240 aa  169  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  41.42 
 
 
246 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  40.91 
 
 
246 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  43.78 
 
 
249 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  41.13 
 
 
246 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  41.95 
 
 
241 aa  169  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0710  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 
248 aa  169  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3232  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 
244 aa  169  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  41.42 
 
 
246 aa  168  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  41.42 
 
 
246 aa  168  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5277  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.8 
 
 
246 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1587  two component transcriptional regulator  40.66 
 
 
261 aa  167  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367759  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  40.91 
 
 
246 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 
235 aa  166  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3376  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.53 
 
 
242 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  40.69 
 
 
246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2619  two component transcriptional regulator  38.43 
 
 
240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0094  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 
246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  41.1 
 
 
246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.6 
 
 
251 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001870  two-component system response regulator OmpR  42.92 
 
 
239 aa  166  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.360284  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00621  osmolarity response regulator  42.92 
 
 
239 aa  165  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  42.49 
 
 
240 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  41.45 
 
 
242 aa  164  8e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2286  response regulator GltR  39.42 
 
 
241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.2 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3439  two component transcriptional regulator  41.63 
 
 
239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2155  two component transcriptional regulator  41.49 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.128892 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4376  winged helix family two component transcriptional regulator  41.25 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3382  two component transcriptional regulator  37.45 
 
 
241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.98781 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0359  osmolarity response regulator  40.77 
 
 
245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4667  two component transcriptional regulator  41 
 
 
247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.84 
 
 
246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04421  two-component system regulatory protein  40.34 
 
 
230 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2802  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  38.84 
 
 
246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  39 
 
 
244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  42.55 
 
 
238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0324  osmolarity response regulator  42.86 
 
 
239 aa  162  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566854  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1980  osmolarity response regulator  40.76 
 
 
243 aa  163  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431202  normal  0.459947 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.92 
 
 
246 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3898  osmolarity response regulator  42.86 
 
 
239 aa  162  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3286  two component transcriptional regulator  43.97 
 
 
253 aa  162  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.92 
 
 
246 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>