More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1716 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009727  CBUD_1716  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  100 
 
 		 248 aa  503  9.999999999999999e-143  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00444869  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0473  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  100 
 
 		 248 aa  503  9.999999999999999e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01026  response regulator  51.34 
 
 		 229 aa  252  5.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00347  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with PhoR (or CreC)  50 
 
 		 229 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3210  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  50 
 
 		 229 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146413  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0427  transcriptional regulator PhoB  50 
 
 		 229 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0318  transcriptional regulator PhoB  50 
 
 		 229 aa  251  8.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3234  transcriptional regulator PhoB  50 
 
 		 229 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.456974  unclonable  0.00000000819474 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0475  transcriptional regulator PhoB  50 
 
 		 229 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0429  transcriptional regulator PhoB  50 
 
 		 229 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.283039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0467  transcriptional regulator PhoB  50 
 
 		 229 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00351  hypothetical protein  50 
 
 		 229 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3286  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  49.11 
 
 		 230 aa  251  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0413143 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3276  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 		 229 aa  250  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3136  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  49.11 
 
 		 229 aa  250  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004385  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  50.89 
 
 		 229 aa  248  5e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2232  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  50 
 
 		 227 aa  248  5e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.326614  normal  0.43086 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1041  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 		 229 aa  248  6e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.194422 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1053  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 229 aa  248  7e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3302  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  47.77 
 
 		 229 aa  248  8e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1008  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  47.77 
 
 		 229 aa  248  8e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0441  transcriptional regulator PhoB  49.11 
 
 		 229 aa  248  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0496  transcriptional regulator PhoB  49.11 
 
 		 229 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0454  transcriptional regulator PhoB  49.11 
 
 		 229 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0435  transcriptional regulator PhoB  49.11 
 
 		 229 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.464381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3106  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  47.77 
 
 		 229 aa  246  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0867  transcriptional regulator PhoB  49.55 
 
 		 229 aa  247  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.437737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0253  DNA-binding response regulator PhoB  50.45 
 
 		 229 aa  246  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0435  transcriptional regulator PhoB  48.66 
 
 		 229 aa  245  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2915  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  47.77 
 
 		 229 aa  245  6e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03440  putative DNA-binding response regulator PhoB  48.43 
 
 		 229 aa  244  8e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3303  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 229 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000702519  hitchhiker  0.00000106408 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2749  two component transcriptional regulator  47.7 
 
 		 241 aa  242  3e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000593879  unclonable  0.00000330773 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2768  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  50.89 
 
 		 229 aa  241  7e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2457  response regulator homolog PhoB (phosphate regulon transcriptional regulatory protein)  50.45 
 
 		 230 aa  241  7e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1074  response regulator receiver protein  50 
 
 		 229 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000246777  normal  0.491091 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1558  phosphate regulon response regulator PhoB  50.45 
 
 		 239 aa  240  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1364  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 229 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000657343  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2981  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  50.45 
 
 		 229 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000220801  hitchhiker  0.00121997 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1403  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 229 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal  0.0219543 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3452  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 229 aa  241  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00686704  hitchhiker  0.000158375 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1378  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 229 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000291119  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2709  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 229 aa  240  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000407229  decreased coverage  0.000000263688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2777  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 229 aa  240  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  decreased coverage  0.000208697 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2879  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 229 aa  240  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000143261  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1296  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 229 aa  238  5e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000460678  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2689  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  50 
 
 		 229 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000627834  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2969  two component transcriptional regulator  48.66 
 
 		 229 aa  237  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000855765  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3105  DNA-binding response regulator PhoB  50.88 
 
 		 232 aa  236  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2266  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  50.67 
 
 		 230 aa  236  2e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1923  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3838  response regulator receiver domain-containing protein  47.98 
 
 		 234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000539223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02492  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  45.54 
 
 		 229 aa  232  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.506678  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0824  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 229 aa  232  5e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2216  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 		 234 aa  230  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.357864  normal  0.270863 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4408  two component transcriptional regulator  48.43 
 
 		 229 aa  229  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0897949 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1208  phosphate regulon response regulator PhoB  45.09 
 
 		 233 aa  228  7e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5320  winged helix family two component transcriptional regulator  46.35 
 
 		 242 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6138  two-component response regulator PhoB  48.43 
 
 		 229 aa  228  8e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70750  two-component response regulator PhoB  48.43 
 
 		 229 aa  228  8e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0154  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  46.64 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48520  phosphate regulon response regulator; PhoB  47.09 
 
 		 229 aa  226  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0667889  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5367  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 229 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5228  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 229 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.661336  normal  0.450139 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2093  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 233 aa  225  5.0000000000000005e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.582679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3596  two component transcriptional regulator  48.66 
 
 		 230 aa  225  5.0000000000000005e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2231  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 234 aa  225  6e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5606  two component transcriptional regulator  46.88 
 
 		 229 aa  224  7e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0098  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 		 229 aa  224  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.761303  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2163  response regulator receiver protein  46.19 
 
 		 231 aa  224  1e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5477  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  46.43 
 
 		 229 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.43 
 
 		 229 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0959  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  45.54 
 
 		 229 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.159493 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2074  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 231 aa  224  1e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1105  two component transcriptional regulator  44.89 
 
 		 229 aa  223  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0227  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  43.04 
 
 		 236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0541  two component transcriptional regulator  45.78 
 
 		 230 aa  218  8.999999999999998e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0216  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4400  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0489  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1597  two component transcriptional regulator  41.88 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3253  two component transcriptional regulator  44.89 
 
 		 229 aa  206  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2472  response regulator receiver protein  45.54 
 
 		 216 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2367  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2021  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.13 
 
 		 237 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.198844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 		 236 aa  202  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2180  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 235 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0753297 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2316  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  43.29 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1713  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  41.13 
 
 		 237 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0484795  normal  0.810471 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4913  two component transcriptional regulator  45.74 
 
 		 231 aa  202  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2201  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 242 aa  202  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.153982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2162  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  41.41 
 
 		 235 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1534  phosphate regulon two-component response regulator transcription regulator protein  40.26 
 
 		 237 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1491  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  44.2 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2339  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 231 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1288  two component transcriptional regulator  43.48 
 
 		 238 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2257  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.512842  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1271  two component transcriptional regulator  43.17 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.624894  normal  0.128476 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>