More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0509 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0509  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 232 aa  471  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6070  two component response regulator  51.35 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5362  two component transcriptional regulator  51.79 
 
 		 230 aa  212  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0748621 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1865  response regulator receiver  48.21 
 
 		 224 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5960  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.35 
 
 		 226 aa  208  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.891848  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1196  two component transcriptional regulator  46.49 
 
 		 240 aa  208  6e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1791  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 		 240 aa  205  5e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2262  two component transcriptional regulator  45.98 
 
 		 231 aa  204  6e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0299  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.91 
 
 		 231 aa  204  7e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1514  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.61 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0313038  normal  0.23375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4763  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 230 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.96205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2694  two component transcriptional regulator  45.58 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1017  two component transcriptional regulator  48.65 
 
 		 229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.957911  normal  0.735899 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3288  two component transcriptional regulator  43.6 
 
 		 272 aa  198  6e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4649  two component transcriptional regulator  46.02 
 
 		 230 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.424735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 		 241 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3050  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 224 aa  197  7.999999999999999e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.519152  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3804  response regulator receiver protein  47.35 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0687952  normal  0.157721 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3729  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24530  Response regulator KdpE  46.82 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689152  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1875  response regulator receiver  45.74 
 
 		 230 aa  197  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.72432  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.29 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 231 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3122  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 235 aa  196  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2540  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 228 aa  196  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3248  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.53 
 
 		 224 aa  196  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1100  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 230 aa  195  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  43.69 
 
 		 229 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1172  two component transcriptional regulator, winged helix family  45 
 
 		 235 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2021  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.07 
 
 		 236 aa  195  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48021  normal  0.282737 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4253  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 228 aa  195  6e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4088  response regulator receiver  43.3 
 
 		 231 aa  195  6e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1159  two component transcriptional regulator  46.9 
 
 		 230 aa  194  7e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2927  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 		 228 aa  194  9e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4238  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1222  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0195  two component transcriptional regulator  45.74 
 
 		 243 aa  192  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4344  two component transcriptional regulator  45.29 
 
 		 239 aa  192  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.325933  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1269  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 228 aa  191  7e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3600  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 235 aa  191  7e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11045  transcriptional regulatory protein kdpE  44.34 
 
 		 226 aa  190  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0666  response regulator receiver  45.61 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4990  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.6 
 
 		 230 aa  189  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 247 aa  190  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3787  transposase  47.77 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2990  two component transcriptional regulator  43.69 
 
 		 230 aa  189  5e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.839569  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0437  response regulator receiver protein  48.23 
 
 		 222 aa  188  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.79 
 
 		 235 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2246  KDP operon transcriptional regulatory protein kdpE  43.56 
 
 		 230 aa  188  8e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.683582  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1708  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.26 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.476364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6788  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.72 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.241896 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3104  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.317177  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1872  DNA-binding response regulator KdpE  43.36 
 
 		 234 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0800306  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1397  DNA-binding response regulator KdpE  43.36 
 
 		 232 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.089264  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1025  DNA-binding response regulator KdpE  42.92 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1214  DNA-binding transcriptional activator KdpE  43.36 
 
 		 226 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00514307  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2053  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 232 aa  186  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.93 
 
 		 236 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0359  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 236 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274157  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1088  DNA-binding response regulator KdpE  43.36 
 
 		 234 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0779  DNA-binding response regulator KdpE  43.36 
 
 		 234 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97246  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1246  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  43.36 
 
 		 232 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1254  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  43.36 
 
 		 234 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00667548  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0371  DNA-binding response regulator KdpE  43.36 
 
 		 234 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0249  two component transcriptional regulator, winged helix family  44 
 
 		 232 aa  186  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1461  response regulator receiver  42.01 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000661728  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5029  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.22 
 
 		 225 aa  186  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3717  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  44.44 
 
 		 244 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3077  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 227 aa  185  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0465  DNA-binding response regulator  43.05 
 
 		 230 aa  185  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000321608  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3248  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 232 aa  185  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43340  two-component response regulator KdpE  44.55 
 
 		 230 aa  185  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  44.54 
 
 		 235 aa  185  5e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.69 
 
 		 226 aa  185  6e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1633  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.44 
 
 		 254 aa  185  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1493  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 		 233 aa  185  6e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2067  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 		 233 aa  185  6e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000016314  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  44.69 
 
 		 235 aa  184  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 235 aa  184  8e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.91 
 
 		 237 aa  184  8e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1884  response regulator receiver protein  45.29 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.365735  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  44.69 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  44.69 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  44.69 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3636  two-component response regulator KdpE  44.09 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  44.69 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  44.25 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  44.69 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1312  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1865 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  44.69 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6752  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.5 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  44.69 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.42 
 
 		 242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2343  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00929975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>