More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2067 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2067  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 233 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000016314  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1875  response regulator receiver  51.12 
 
 		 230 aa  219  3.9999999999999997e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.72432  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2274  two component transcriptional regulator  51.54 
 
 		 231 aa  216  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3122  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.88 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1172  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.44 
 
 		 235 aa  211  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0509  two component transcriptional regulator  48.23 
 
 		 232 aa  206  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2094  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.91 
 
 		 231 aa  203  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  47.09 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6070  two component response regulator  48.88 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1222  two component transcriptional regulator  47.96 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0249  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.67 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1196  two component transcriptional regulator  47.79 
 
 		 240 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2694  two component transcriptional regulator  48.23 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3778  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.13 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0820994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1865  response regulator receiver  49.55 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4763  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.96205  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2246  KDP operon transcriptional regulatory protein kdpE  45.49 
 
 		 230 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.683582  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2262  two component transcriptional regulator  48.25 
 
 		 231 aa  197  9e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2437  two component transcriptional regulator  50.64 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1872  DNA-binding response regulator KdpE  45.73 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0800306  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1088  DNA-binding response regulator KdpE  45.73 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0779  DNA-binding response regulator KdpE  45.73 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97246  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1254  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  45.73 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00667548  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0371  DNA-binding response regulator KdpE  45.73 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1708  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 		 228 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.476364 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1100  two component transcriptional regulator  45.78 
 
 		 230 aa  195  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3104  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 		 233 aa  195  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.317177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1397  DNA-binding response regulator KdpE  46.09 
 
 		 232 aa  195  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.089264  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1246  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  46.09 
 
 		 232 aa  195  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4238  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 		 226 aa  194  7e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3729  two component transcriptional regulator  47.39 
 
 		 231 aa  194  7e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3636  two-component response regulator KdpE  48 
 
 		 230 aa  194  9e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3077  two component transcriptional regulator  46.9 
 
 		 227 aa  194  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0828  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.02 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.159677 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1025  DNA-binding response regulator KdpE  45.3 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  46.52 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.09 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  46.96 
 
 		 231 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11045  transcriptional regulatory protein kdpE  47.51 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  46.96 
 
 		 231 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2484  DNA-binding response regulator KdpE  50.44 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1884  response regulator receiver protein  45.78 
 
 		 244 aa  192  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.365735  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0942  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.64 
 
 		 231 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0532517  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1159  two component transcriptional regulator  48.89 
 
 		 230 aa  191  6e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4088  response regulator receiver  44.74 
 
 		 231 aa  192  6e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1514  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.72 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0313038  normal  0.23375 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2213  DNA binding response regulator KdpE  47.81 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0891  two component transcriptional regulator  48.64 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24530  Response regulator KdpE  46.82 
 
 		 232 aa  190  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689152  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4546  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.926448 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43340  two-component response regulator KdpE  46.22 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807414  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0299  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.61 
 
 		 231 aa  189  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1312  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.02 
 
 		 232 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1865 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3226  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.45 
 
 		 232 aa  188  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.661673  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5960  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.85 
 
 		 226 aa  188  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.891848  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.9 
 
 		 237 aa  188  7e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0371836  normal  0.118342 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0666  response regulator receiver  46.85 
 
 		 240 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  44.78 
 
 		 241 aa  187  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3248  two component transcriptional regulator  46.02 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0772  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.88 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5362  two component transcriptional regulator  47.56 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0748621 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2322  two component transcriptional regulator  44.93 
 
 		 232 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2200  two component transcriptional regulator  44.93 
 
 		 232 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 		 229 aa  185  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3050  two component transcriptional regulator  44.55 
 
 		 224 aa  185  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.519152  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1269  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 228 aa  184  7e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1017  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 229 aa  184  7e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.957911  normal  0.735899 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2927  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 228 aa  185  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2604  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.89 
 
 		 246 aa  184  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  43.17 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5611  two component transcriptional regulator  44.93 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0731674  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0994  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2822  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.25 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2053  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2990  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.839569  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1672  two component transcriptional regulator  44.93 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3717  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  44.89 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.89 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2284  two component transcriptional regulator  44.93 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2307  two component transcriptional regulator  44.93 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.84 
 
 		 247 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1587  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 231 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 		 228 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0720  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.23 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2842  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.93 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3248  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.99 
 
 		 224 aa  179  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3370  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3600  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0720  DNA-binding transcriptional activator KdpE  42.99 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0669037  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2942  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1493  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0741  DNA-binding transcriptional activator KdpE  42.79 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000675118  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0716  DNA-binding transcriptional activator KdpE  42.79 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0593355  normal  0.505732 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3023  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 229 aa  179  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0359  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 236 aa  179  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274157  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0555  DNA-binding transcriptional activator KdpE  42.34 
 
 		 225 aa  178  4.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4649  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 230 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.424735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0386  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 229 aa  178  5.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00651  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with KdpD  42.34 
 
 		 225 aa  178  7e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>