More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0234 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  100 
 
 		 121 aa  243  6e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  92.56 
 
 		 121 aa  229  9e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  90.91 
 
 		 121 aa  227  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  90.08 
 
 		 121 aa  227  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1447  response regulator receiver protein  72.73 
 
 		 121 aa  186  8e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3622  response regulator receiver protein  76.03 
 
 		 121 aa  185  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707081 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  67.77 
 
 		 121 aa  171  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2707  response regulator receiver protein  69.42 
 
 		 121 aa  158  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1793  response regulator receiver protein  60.33 
 
 		 122 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2437  chemotaxis response regulator, CheY1  59.17 
 
 		 122 aa  150  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.365798  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1101  response regulator receiver protein  59.17 
 
 		 122 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2842  response regulator receiver domain-containing protein  62.18 
 
 		 126 aa  148  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.810937  normal  0.282987 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3207  response regulator receiver protein  61.98 
 
 		 124 aa  144  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.138724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3187  response regulator receiver protein  57.98 
 
 		 136 aa  139  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  51.67 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  51.26 
 
 		 121 aa  130  6.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3065  response regulator receiver protein  47.86 
 
 		 120 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3791  response regulator receiver protein  47.86 
 
 		 120 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  47.9 
 
 		 121 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3466  response regulator receiver protein  61.67 
 
 		 127 aa  125  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.12169 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1937  response regulator receiver domain-containing protein  49.58 
 
 		 121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.644536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  51.26 
 
 		 121 aa  124  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2428  response regulator receiver domain-containing protein  48.74 
 
 		 128 aa  124  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0147  chemotaxis protein CheY  49.14 
 
 		 119 aa  124  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4379  response regulator receiver protein  47.01 
 
 		 120 aa  125  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1739  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0375564  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0092  response regulator receiver protein  49.58 
 
 		 122 aa  124  4.0000000000000003e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  47.9 
 
 		 122 aa  124  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1598  response regulator receiver protein  48.7 
 
 		 120 aa  124  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  50.42 
 
 		 121 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2177  response regulator receiver protein  47.83 
 
 		 120 aa  123  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0654  response regulator receiver protein  47.86 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54464 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0566  response regulator receiver domain-containing protein  48.7 
 
 		 120 aa  123  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22620  response regulator receiver protein  47.86 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2994  response regulator receiver protein  46.22 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2620  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1593  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0468  response regulator receiver protein  46.22 
 
 		 120 aa  120  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  49.58 
 
 		 122 aa  120  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1398  response regulator receiver domain-containing protein  47.9 
 
 		 123 aa  120  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503734  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0263  response regulator receiver protein  48.74 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.419062 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  48.7 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  49.58 
 
 		 122 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1606  response regulator receiver protein  46.22 
 
 		 121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0584  chemotaxis signal transduction protein CheY  46.09 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  48.72 
 
 		 121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1417  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 120 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1541  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 120 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 121 aa  116  9e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2318  chemotaxis protein CheY  41.53 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00411  chemotaxis protein CheY  45.38 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0880  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 123 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2107  response regulator receiver domain-containing protein  45.45 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0754  response regulator receiver domain-containing protein  47.01 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3294  response regulator receiver  41.18 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1570  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 121 aa  114  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.945276 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1315  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0517324  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1853  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 121 aa  114  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00571982  normal  0.853875 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0235  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 121 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1583  chemotaxis response regulator, CheY3  47.06 
 
 		 121 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00144899  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0167  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 120 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0581  chemotaxis response regulator  45.6 
 
 		 124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0915  chemotaxis protein CheY  41.18 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  45.3 
 
 		 120 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3298  hypothetical protein  47.06 
 
 		 121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.765394 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0155  chemotaxis response regulator  43.59 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0788  response regulator receiver  41.18 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0203  chemotaxis response regulator  43.59 
 
 		 123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.989482  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3494  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1382  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 122 aa  111  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.997925  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2111  Fis family transcriptional regulator  44.54 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2365  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00457125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2248  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2097  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.371893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2094  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1880  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.578036 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1787  response regulator receiver protein  43.8 
 
 		 122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2443  putative chemotaxis response regulator, CheY5  45.38 
 
 		 122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.451762  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1576  response regulator receiver domain-containing protein  44.54 
 
 		 123 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0980022  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1107  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.91502 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1155  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 122 aa  110  5e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22671  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2219  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 121 aa  110  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 121 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4035  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 121 aa  110  9e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3302  chemotaxis response regulator, CheY4  47.06 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0775  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0246849 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2650  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2120  chemotaxis protein CheY  43.7 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1378  response regulator receiver domain-containing protein  42.86 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.207936  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0899  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1456  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00031  chemotaxis response regulator  43.86 
 
 		 116 aa  108  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3816  response regulator receiver protein  47.9 
 
 		 125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0118  response regulator receiver domain-containing protein  47.9 
 
 		 125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2575  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 122 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0149684  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4812  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 121 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>