More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1097 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1097  response regulator receiver protein  100 
 
 
131 aa  270  6e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00801176  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0604  response regulator receiver protein  50.42 
 
 
123 aa  131  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.72319  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4000  response regulator receiver protein  47.11 
 
 
125 aa  131  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5197  response regulator receiver protein  50 
 
 
134 aa  130  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  54.87 
 
 
123 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  49.14 
 
 
121 aa  123  9e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  49.15 
 
 
121 aa  122  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3877  response regulator receiver protein  49.14 
 
 
130 aa  121  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3308  response regulator receiver protein  45.69 
 
 
130 aa  116  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.678314  normal  0.215079 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  45 
 
 
123 aa  115  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3554  response regulator receiver protein  46.96 
 
 
125 aa  114  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3077  response regulator receiver protein  47.83 
 
 
124 aa  110  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.74045  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4585  response regulator receiver protein  46.43 
 
 
124 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0945273  normal  0.0607582 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4215  response regulator receiver  46.43 
 
 
124 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783308  normal  0.412692 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4732  response regulator receiver protein  46.43 
 
 
133 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.788518  decreased coverage  0.0029072 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3565  response regulator receiver protein  45.54 
 
 
126 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.15 
 
 
397 aa  108  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1706  response regulator receiver protein  42.5 
 
 
131 aa  107  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  39.66 
 
 
124 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1548  response regulator receiver protein  40.52 
 
 
124 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  35.09 
 
 
122 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  42.98 
 
 
128 aa  105  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  41.23 
 
 
121 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  40.35 
 
 
121 aa  104  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0497  response regulator receiver protein  41.67 
 
 
124 aa  104  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.41839  hitchhiker  0.0000227207 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  39.83 
 
 
127 aa  103  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2535  response regulator receiver protein  34.78 
 
 
126 aa  102  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1368  response regulator receiver protein  37.72 
 
 
125 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.136056  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1431  response regulator receiver  39.47 
 
 
121 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  39.47 
 
 
121 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0214  response regulator receiver protein  45.61 
 
 
139 aa  101  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00485635  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1527  response regulator receiver protein  46.09 
 
 
119 aa  100  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  39.47 
 
 
121 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  39.47 
 
 
121 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4117  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.88 
 
 
1588 aa  99.4  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0887298  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 
1977 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3271  response regulator receiver protein  37.17 
 
 
120 aa  98.6  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  39.47 
 
 
124 aa  98.6  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  40.71 
 
 
126 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 
1352 aa  97.8  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4908  response regulator receiver protein  39.2 
 
 
130 aa  97.8  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100675  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3612  response regulator receiver protein  41.07 
 
 
128 aa  97.4  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3542  response regulator receiver protein  38.6 
 
 
121 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  41.23 
 
 
123 aa  97.1  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  42.11 
 
 
121 aa  97.1  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  39.47 
 
 
1170 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  39.47 
 
 
1172 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  42.11 
 
 
126 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0966  response regulator receiver  42.11 
 
 
126 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.734958  normal  0.0218415 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2112  Cache sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 
1361 aa  96.7  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  39.82 
 
 
126 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3678  response regulator receiver protein  38.94 
 
 
123 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.716343  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.64 
 
 
876 aa  95.9  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1943  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.38 
 
 
1468 aa  95.5  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  39.57 
 
 
385 aa  95.5  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  38.94 
 
 
123 aa  95.1  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  38.94 
 
 
134 aa  95.1  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  39.32 
 
 
497 aa  94.7  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4302  response regulator receiver protein  43.75 
 
 
124 aa  95.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1219  response regulator receiver protein  37.5 
 
 
126 aa  95.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0930  response regulator receiver protein  41.23 
 
 
126 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.177566 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 
935 aa  94.4  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0925  response regulator receiver protein  38.6 
 
 
123 aa  94  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  41.96 
 
 
1053 aa  94  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  39.37 
 
 
134 aa  94  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2626  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 
392 aa  94  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1749  two component response regulator  39.82 
 
 
123 aa  94  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.86 
 
 
1237 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1865  response regulator receiver protein  40.17 
 
 
123 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.111325  normal  0.212824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0401  sensor histidine kinase/response regulator  42.24 
 
 
1392 aa  92.8  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1381  response regulator receiver protein  38.6 
 
 
123 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0423  response regulator receiver protein  39.82 
 
 
123 aa  93.2  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.89687 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3728  response regulator receiver protein  36.75 
 
 
128 aa  92.8  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6560  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.18 
 
 
720 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.646619 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1289  response regulator receiver protein  38.6 
 
 
123 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254052  hitchhiker  0.00394342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5565  response regulator receiver protein  42.74 
 
 
126 aa  92.8  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00725459 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  37.17 
 
 
123 aa  93.2  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 
778 aa  92.8  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2202  histidine kinase  38.79 
 
 
613 aa  92.4  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.143763  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0286  GAF sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
1406 aa  92  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 
929 aa  92.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.52 
 
 
1158 aa  92  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 
1857 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  38.52 
 
 
265 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  38.14 
 
 
125 aa  92  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 
1839 aa  92  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 
1271 aa  92  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 
1274 aa  92  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.8 
 
 
1287 aa  91.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5202  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 
1478 aa  91.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0874625 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  44.83 
 
 
120 aa  91.7  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.82 
 
 
1954 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  43.1 
 
 
777 aa  91.3  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3009  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.87 
 
 
920 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.59521  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2677  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  38.84 
 
 
636 aa  90.9  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068934 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  37.72 
 
 
144 aa  90.9  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0185  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.38 
 
 
1214 aa  90.9  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467777  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 
970 aa  90.9  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3206  response regulator receiver protein  41.23 
 
 
126 aa  90.9  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.901142  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0261  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 
948 aa  90.9  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>