More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0261 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0261  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 948 aa  1955    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.29 
 
 		 927 aa  488  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2648  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.22 
 
 		 997 aa  361  3e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.16 
 
 		 1064 aa  359  1.9999999999999998e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.25 
 
 		 1101 aa  340  5e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2282  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.96 
 
 		 685 aa  339  1.9999999999999998e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  38.35 
 
 		 1135 aa  317  7e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.68 
 
 		 1260 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.36 
 
 		 929 aa  303  9e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0425  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.18 
 
 		 893 aa  303  1e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2229  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.9 
 
 		 1049 aa  302  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664054  normal  0.108682 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  35.9 
 
 		 1763 aa  301  3e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0298  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.26 
 
 		 899 aa  301  3e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0542846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  35.63 
 
 		 1574 aa  301  6e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.56 
 
 		 1313 aa  300  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.33 
 
 		 770 aa  299  1e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.64 
 
 		 1193 aa  298  3e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.48 
 
 		 916 aa  298  3e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.95 
 
 		 816 aa  295  2e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  36.16 
 
 		 932 aa  295  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2022  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.76 
 
 		 1258 aa  295  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.3 
 
 		 1234 aa  292  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  35.53 
 
 		 1322 aa  291  3e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0319  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.3 
 
 		 636 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  35.47 
 
 		 1188 aa  291  4e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  35.49 
 
 		 917 aa  291  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  34.55 
 
 		 917 aa  290  6e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0316  response regulator, histidine kinase  35.54 
 
 		 891 aa  290  6e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 		 1238 aa  290  8e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.95 
 
 		 937 aa  290  8e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  34.8 
 
 		 923 aa  290  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.3 
 
 		 1238 aa  290  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 		 1238 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 		 1238 aa  290  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.5 
 
 		 1266 aa  289  2e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.75 
 
 		 1165 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3693  histidine kinase  32.59 
 
 		 667 aa  288  4e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.75 
 
 		 917 aa  287  5e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3595  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.44 
 
 		 744 aa  287  5e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.07 
 
 		 932 aa  287  5.999999999999999e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  35.24 
 
 		 1179 aa  287  8e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 1582 aa  287  8e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  35.14 
 
 		 1765 aa  286  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.74 
 
 		 1236 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 		 1236 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 		 1236 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  34.17 
 
 		 1014 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.06 
 
 		 1303 aa  285  3.0000000000000004e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  34.07 
 
 		 765 aa  284  5.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.31 
 
 		 933 aa  284  6.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.32 
 
 		 1230 aa  284  6.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3120  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  31.34 
 
 		 1653 aa  283  8.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 		 1397 aa  283  8.000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  34.14 
 
 		 925 aa  283  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 		 1245 aa  282  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 		 1771 aa  281  3e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 		 1284 aa  282  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.63 
 
 		 927 aa  281  3e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2240  sensor/response regulator hybrid  35.9 
 
 		 942 aa  282  3e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499034 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.94 
 
 		 2213 aa  281  3e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2152  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.55 
 
 		 985 aa  281  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0146455  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 		 1611 aa  281  5e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.69 
 
 		 916 aa  281  5e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 		 745 aa  281  6e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 		 1767 aa  280  6e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 		 1767 aa  281  6e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.74 
 
 		 1765 aa  281  6e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  33.72 
 
 		 1177 aa  280  7e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 		 1767 aa  280  7e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2774  histidine kinase  35.66 
 
 		 761 aa  280  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.44 
 
 		 1040 aa  279  2e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.78 
 
 		 1236 aa  279  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.25 
 
 		 909 aa  278  3e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  33 
 
 		 1398 aa  278  3e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  35.38 
 
 		 905 aa  278  5e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.34 
 
 		 920 aa  277  6e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 		 1267 aa  277  6e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 		 876 aa  277  7e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3543  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 		 1603 aa  277  8e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143205 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.94 
 
 		 1245 aa  276  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  35.27 
 
 		 1287 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.73 
 
 		 818 aa  276  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  36.8 
 
 		 1407 aa  276  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2687  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.12 
 
 		 784 aa  275  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.762737  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 		 917 aa  275  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0141  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 		 778 aa  275  4.0000000000000004e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.44 
 
 		 917 aa  274  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2263  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.63 
 
 		 1009 aa  274  6e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00899  sensory box histidine kinase/response regulator  35.3 
 
 		 1070 aa  274  6e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  32.3 
 
 		 1200 aa  274  7e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2105  PAS  36.79 
 
 		 680 aa  274  7e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.292551  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  34.5 
 
 		 1683 aa  273  1e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 922 aa  273  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  33.27 
 
 		 1331 aa  273  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 		 1326 aa  273  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.3 
 
 		 1310 aa  273  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.84 
 
 		 914 aa  272  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  34.23 
 
 		 847 aa  272  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.38 
 
 		 919 aa  273  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.01 
 
 		 1442 aa  272  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>