More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2535 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2535  response regulator receiver protein  100 
 
 		 126 aa  253  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1548  response regulator receiver protein  58.2 
 
 		 124 aa  150  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3271  response regulator receiver protein  53.57 
 
 		 120 aa  121  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  49.58 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1646  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 391 aa  118  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.930467  normal  0.0178265 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2690  response regulator receiver domain-containing protein  50.43 
 
 		 124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  44.26 
 
 		 123 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1307  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.67 
 
 		 391 aa  111  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1368  response regulator receiver protein  46.55 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.136056  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1219  response regulator receiver protein  50.96 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.54 
 
 		 397 aa  107  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3565  response regulator receiver protein  40 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  43.97 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2626  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.7 
 
 		 392 aa  103  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4585  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 124 aa  103  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0945273  normal  0.0607582 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1097  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 131 aa  102  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00801176  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4215  response regulator receiver  40.68 
 
 		 124 aa  103  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783308  normal  0.412692 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4732  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 133 aa  102  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.788518  decreased coverage  0.0029072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3554  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 125 aa  100  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.46 
 
 		 1044 aa  100  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 123 aa  100  7e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.83 
 
 		 1101 aa  99.8  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4117  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.98 
 
 		 1588 aa  99  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0887298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2107  response regulator receiver protein  43.93 
 
 		 123 aa  98.6  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4000  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 125 aa  99  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1997  response regulator receiver  45.28 
 
 		 106 aa  97.4  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  43.93 
 
 		 128 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0080  response regulator receiver domain-containing protein  36.75 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1426  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.13 
 
 		 1079 aa  97.1  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.688315  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 964 aa  96.3  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.21 
 
 		 1271 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1527  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 119 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4176  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 128 aa  94.7  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0214  response regulator receiver protein  40 
 
 		 139 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00485635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0533  histidine kinase  37.29 
 
 		 244 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0248  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1051  response regulator receiver  39.17 
 
 		 125 aa  94  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.73 
 
 		 1101 aa  94  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000252838 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  40 
 
 		 124 aa  93.6  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.73 
 
 		 818 aa  93.6  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.74 
 
 		 2213 aa  93.6  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1943  histidine kinase  43.81 
 
 		 647 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.539019  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0195  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 222 aa  93.2  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.304768 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  37.82 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3355  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 		 685 aa  93.2  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0162851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5197  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4337  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.7 
 
 		 1629 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.571014  normal  0.322198 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 		 1245 aa  92.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4133  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.7 
 
 		 1629 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  36.97 
 
 		 1060 aa  92  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.34 
 
 		 1548 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.27 
 
 		 643 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0423  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 123 aa  92  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.89687 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.38 
 
 		 1362 aa  91.3  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 123 aa  91.3  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  40.17 
 
 		 735 aa  90.9  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4173  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.31 
 
 		 643 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  37.82 
 
 		 121 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1522  histidine kinase  40.17 
 
 		 544 aa  90.5  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1191  hybrid sensory histidine kinase BarA  39.34 
 
 		 950 aa  90.5  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000146059  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  42.02 
 
 		 823 aa  90.5  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1346  PAS sensor protein  39.02 
 
 		 803 aa  90.5  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1492  histidine kinase  43.81 
 
 		 519 aa  90.1  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.416072 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  35.29 
 
 		 123 aa  90.1  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1099  response regulator receiver  42.45 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  40 
 
 		 937 aa  89.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0325  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.57 
 
 		 2037 aa  90.1  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1749  two component response regulator  35.29 
 
 		 123 aa  90.1  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 		 743 aa  89.4  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  36.97 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.12 
 
 		 1964 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.370442 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 144 aa  89.4  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  35.29 
 
 		 134 aa  90.1  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1943  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.84 
 
 		 1468 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1381  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 123 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  39.47 
 
 		 933 aa  89  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.31 
 
 		 643 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  40 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1289  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 123 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254052  hitchhiker  0.00394342 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  36.97 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3542  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0046  response regulator receiver protein  39.62 
 
 		 125 aa  89.4  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.74 
 
 		 1352 aa  89  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 		 1177 aa  89  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0925  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 123 aa  89.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3226  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 		 1251 aa  89  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0796968  normal  0.806997 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3678  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 123 aa  88.6  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.716343  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 124 aa  88.6  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1431  response regulator receiver  36.97 
 
 		 121 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.87 
 
 		 1172 aa  88.6  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.33 
 
 		 944 aa  88.2  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.37 
 
 		 818 aa  88.6  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 993 aa  88.2  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.31 
 
 		 929 aa  87.8  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2265  histidine kinase  38.71 
 
 		 559 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.71 
 
 		 1055 aa  88.2  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0500  histidine kinase  40.74 
 
 		 940 aa  88.2  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.27 
 
 		 633 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>