More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0248 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0248  response regulator receiver protein  100 
 
 		 128 aa  260  4e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4176  response regulator receiver protein  46.83 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  43.55 
 
 		 122 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1368  response regulator receiver protein  44.8 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.136056  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2107  response regulator receiver protein  47.5 
 
 		 123 aa  107  6e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2690  response regulator receiver domain-containing protein  44.07 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.55 
 
 		 1284 aa  101  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3271  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3206  response regulator receiver protein  41.94 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.901142  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1051  response regulator receiver  40.98 
 
 		 125 aa  100  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 		 1160 aa  99.4  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2112  Cache sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 		 1361 aa  99.4  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  42.62 
 
 		 121 aa  99.4  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 124 aa  99.4  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  40.98 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1865  response regulator receiver protein  42.52 
 
 		 123 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.111325  normal  0.212824 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 123 aa  99.4  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  40.16 
 
 		 121 aa  98.2  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1431  response regulator receiver  40.16 
 
 		 121 aa  97.8  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 126 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  40.98 
 
 		 121 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 144 aa  97.4  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.5 
 
 		 1954 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 		 1356 aa  97.1  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  40.98 
 
 		 121 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 782 aa  96.7  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  39.06 
 
 		 126 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  40.16 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  40.16 
 
 		 134 aa  95.5  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 		 1857 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 		 1839 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3678  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.716343  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.92 
 
 		 947 aa  95.9  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3542  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2535  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.68 
 
 		 1274 aa  95.1  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 127 aa  94.7  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 126 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.37 
 
 		 964 aa  94.4  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0966  response regulator receiver  40.16 
 
 		 126 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.734958  normal  0.0218415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1943  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 		 1468 aa  94.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.8 
 
 		 902 aa  94.4  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.67 
 
 		 929 aa  94  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3009  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 		 1177 aa  94  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0046  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 125 aa  94  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.53 
 
 		 397 aa  93.6  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.53 
 
 		 1005 aa  93.2  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3493  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.83 
 
 		 1782 aa  92.8  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0298684  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1000  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.32 
 
 		 1161 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0930  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.177566 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00475  two-component system sensor histidine kinase-response regulator hybridprotein  38.98 
 
 		 1364 aa  92.8  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679058  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0423  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 123 aa  92.8  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.89687 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 		 1853 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4253  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 		 1843 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 		 1142 aa  91.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4276  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 		 1847 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1381  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 123 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1289  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 123 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254052  hitchhiker  0.00394342 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  36.13 
 
 		 1695 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1031  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.67 
 
 		 1131 aa  91.3  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.768055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3548  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.82 
 
 		 1942 aa  91.3  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  38.98 
 
 		 121 aa  91.3  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3226  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 		 1251 aa  90.9  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0796968  normal  0.806997 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 123 aa  90.5  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1749  two component response regulator  36.89 
 
 		 123 aa  90.5  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.6 
 
 		 1245 aa  90.1  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0925  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  38.46 
 
 		 923 aa  89.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 876 aa  89.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1737  response regulator receiver domain-containing protein  41.46 
 
 		 277 aa  89.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.570794  normal  0.630295 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2180  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 		 922 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.238731  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.59 
 
 		 944 aa  89.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26471  two-component response regulator  39.06 
 
 		 268 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  42.37 
 
 		 1023 aa  89  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2891  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  36.07 
 
 		 858 aa  88.6  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.432629 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  41.44 
 
 		 1060 aa  88.6  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1646  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 391 aa  89  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.930467  normal  0.0178265 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2480  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.59 
 
 		 846 aa  89  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000921222 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 		 1816 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1216  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 		 1194 aa  88.6  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.469894 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.8 
 
 		 1166 aa  89.4  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0790  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.06 
 
 		 906 aa  89.4  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437862  normal  0.397369 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3766  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.6 
 
 		 802 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0676736 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.71 
 
 		 1765 aa  88.2  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 1155 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 		 2107 aa  88.2  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.84 
 
 		 2213 aa  88.2  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  38.33 
 
 		 1172 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 1155 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  36.8 
 
 		 1560 aa  88.2  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 1155 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  40.34 
 
 		 1287 aa  88.6  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 		 1159 aa  88.2  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3009  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 920 aa  88.2  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.59521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0305  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.06 
 
 		 967 aa  88.2  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000133293 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2473  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 1792 aa  87.8  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0667  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.05 
 
 		 703 aa  88.2  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 1977 aa  88.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>