More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0046 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0046  response regulator receiver protein  100 
 
 		 125 aa  249  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  48.72 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 124 aa  116  9e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  45.76 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1865  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 123 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.111325  normal  0.212824 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0966  response regulator receiver  44.07 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.734958  normal  0.0218415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1099  response regulator receiver  43.55 
 
 		 129 aa  114  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  44.92 
 
 		 121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0423  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 123 aa  114  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.89687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0930  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 126 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.177566 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  44.92 
 
 		 121 aa  113  7.999999999999999e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1431  response regulator receiver  44.92 
 
 		 121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 123 aa  113  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0903  cell division response regulator DivK  42.86 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.91869  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3206  response regulator receiver protein  48.31 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.901142  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0925  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 123 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1289  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 123 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254052  hitchhiker  0.00394342 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1381  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 123 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  44.07 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3542  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 121 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  44.07 
 
 		 121 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1749  two component response regulator  40.52 
 
 		 123 aa  108  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3678  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 123 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.716343  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 127 aa  107  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  39.83 
 
 		 123 aa  106  8.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  39.83 
 
 		 134 aa  107  8.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1051  response regulator receiver  39.34 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4176  response regulator receiver protein  41.13 
 
 		 128 aa  104  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6413  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  45.9 
 
 		 404 aa  104  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.341429  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3271  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 120 aa  103  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3612  response regulator receiver protein  43.09 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1219  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  40.68 
 
 		 122 aa  100  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1548  response regulator receiver protein  43.4 
 
 		 124 aa  99.4  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3009  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 120 aa  99.8  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 		 1352 aa  99.8  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2690  response regulator receiver domain-containing protein  38.53 
 
 		 124 aa  97.4  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 397 aa  97.4  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.02 
 
 		 602 aa  94.7  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3548  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.13 
 
 		 1007 aa  94  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.508984  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 1274 aa  94  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 121 aa  94  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0248  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 128 aa  94  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1409  Signal transduction histidine kinase-like  41.03 
 
 		 685 aa  93.6  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1706  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 131 aa  93.2  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0186  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.59 
 
 		 657 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00908915 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  39.67 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2068  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.33 
 
 		 948 aa  92.4  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1918  ATP-binding region, ATPase-like protein  43.48 
 
 		 935 aa  92.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 		 1977 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0080  response regulator receiver domain-containing protein  39.5 
 
 		 124 aa  91.3  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  43.52 
 
 		 123 aa  91.3  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  43.33 
 
 		 231 aa  90.9  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4302  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 124 aa  90.9  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1215  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 120 aa  90.9  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1019  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.67 
 
 		 869 aa  90.5  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1097  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00801176  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  42.5 
 
 		 231 aa  90.5  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0214  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 139 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00485635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2093  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.34 
 
 		 530 aa  89.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874358  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.57 
 
 		 870 aa  89.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2390  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.74 
 
 		 618 aa  89  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.868312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2535  response regulator receiver protein  39.62 
 
 		 126 aa  89.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2220  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 		 928 aa  88.2  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.467526 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2998  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 807 aa  88.6  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.745142 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 123 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  40.19 
 
 		 1060 aa  88.2  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6993  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 		 1159 aa  88.2  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.922616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.51 
 
 		 1070 aa  87.4  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000317  sensor protein TorS  37.5 
 
 		 987 aa  87.4  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.598131  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  35.54 
 
 		 265 aa  87  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.7 
 
 		 1284 aa  87  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5565  response regulator receiver protein  40.95 
 
 		 126 aa  87  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00725459 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4337  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 		 1629 aa  87  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.571014  normal  0.322198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0401  sensor histidine kinase/response regulator  36.59 
 
 		 1392 aa  87  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24530  Response regulator KdpE  40.83 
 
 		 232 aa  87  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689152  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2473  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 1792 aa  86.3  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 		 935 aa  86.3  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4133  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 		 1629 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 		 1044 aa  86.3  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4103  ATPase domain-containing protein  35.48 
 
 		 1179 aa  85.5  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.972573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0958  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 734 aa  85.5  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5381  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 		 235 aa  85.5  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0242785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0479  response regulator receiver modulated serine phosphatase  35.83 
 
 		 529 aa  85.5  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3493  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.2 
 
 		 1782 aa  85.5  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0298684  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3108  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.6062  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2107  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1040  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 365 aa  85.9  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1368  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.136056  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4205  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 		 1625 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6560  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 720 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.646619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1527  response regulator receiver protein  42.99 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1220  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2781  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1943  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 		 1468 aa  84.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>