More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1548 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1548  response regulator receiver protein  100 
 
 		 124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2535  response regulator receiver protein  58.2 
 
 		 126 aa  150  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  45.76 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2690  response regulator receiver domain-containing protein  51.75 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  45 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 121 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3271  response regulator receiver protein  49.11 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.76 
 
 		 397 aa  111  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 128 aa  111  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4000  response regulator receiver protein  44.26 
 
 		 125 aa  110  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0080  response regulator receiver domain-containing protein  41.88 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 123 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 123 aa  108  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1368  response regulator receiver protein  47.46 
 
 		 125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.136056  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  41.18 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1097  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00801176  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.3 
 
 		 1352 aa  105  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0214  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 139 aa  104  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00485635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 126 aa  103  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3565  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 126 aa  103  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4585  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 124 aa  103  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0945273  normal  0.0607582 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4732  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 133 aa  103  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.788518  decreased coverage  0.0029072 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4215  response regulator receiver  42.02 
 
 		 124 aa  103  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783308  normal  0.412692 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0925  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 123 aa  103  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 124 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 124 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1381  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1749  two component response regulator  41.18 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1289  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254052  hitchhiker  0.00394342 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  41.18 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3678  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.716343  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  41.18 
 
 		 134 aa  101  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.6 
 
 		 1274 aa  101  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2626  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.86 
 
 		 392 aa  101  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3554  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 123 aa  100  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  41.18 
 
 		 121 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.72 
 
 		 1977 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0423  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 123 aa  100  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.89687 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  40.34 
 
 		 121 aa  100  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 127 aa  99.4  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3542  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 121 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0046  response regulator receiver protein  43.4 
 
 		 125 aa  99.4  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1706  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 131 aa  99  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0966  response regulator receiver  40.34 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.734958  normal  0.0218415 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.32 
 
 		 1101 aa  99  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114215 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0930  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.177566 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1527  response regulator receiver protein  40 
 
 		 119 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1646  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 		 391 aa  97.8  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.930467  normal  0.0178265 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  42.86 
 
 		 823 aa  97.4  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  39.5 
 
 		 121 aa  97.1  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1219  response regulator receiver protein  43.27 
 
 		 126 aa  97.1  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1865  response regulator receiver protein  43.81 
 
 		 123 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.111325  normal  0.212824 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 1044 aa  96.3  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  37.82 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1431  response regulator receiver  37.82 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  38.66 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3206  response regulator receiver protein  41.9 
 
 		 126 aa  94.7  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.901142  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.17 
 
 		 1362 aa  94  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1099  response regulator receiver  39.62 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0604  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.72319  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1307  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.32 
 
 		 391 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2543  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 1245 aa  92.8  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2957  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.73 
 
 		 810 aa  92  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2107  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5197  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 134 aa  92  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.75 
 
 		 833 aa  91.7  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1191  hybrid sensory histidine kinase BarA  45.19 
 
 		 950 aa  91.7  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000146059  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0903  cell division response regulator DivK  37.74 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.91869  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0960  histidine kinase  40.68 
 
 		 258 aa  91.3  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4337  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 1629 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.571014  normal  0.322198 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  43.48 
 
 		 742 aa  90.9  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  44.76 
 
 		 929 aa  90.9  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.93 
 
 		 862 aa  90.1  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 		 1271 aa  90.1  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4173  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.19 
 
 		 643 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1051  response regulator receiver  38.33 
 
 		 125 aa  89.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3150  response regulator receiver protein  34.4 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.14204 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0650  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3612  response regulator receiver protein  39.25 
 
 		 128 aa  89.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.52 
 
 		 2107 aa  89.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3600  histidine kinase  38.98 
 
 		 548 aa  89  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.94225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4117  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 		 1588 aa  89  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0887298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.76 
 
 		 964 aa  89.4  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0631  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1943  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.5 
 
 		 1468 aa  88.6  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0640  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 123 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4133  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.02 
 
 		 1629 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6560  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 720 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.646619 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.02 
 
 		 1397 aa  88.2  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.07 
 
 		 326 aa  87.8  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  34.45 
 
 		 123 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 		 827 aa  88.2  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0318  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.57 
 
 		 1223 aa  87.8  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.438074 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  42.59 
 
 		 606 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.17 
 
 		 1177 aa  87.8  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>