More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2690 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2690  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 124 aa  252  1.0000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  59.17 
 
 		 122 aa  154  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3271  response regulator receiver protein  58.33 
 
 		 120 aa  145  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1368  response regulator receiver protein  57.14 
 
 		 125 aa  141  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.136056  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  48.72 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1548  response regulator receiver protein  51.75 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2535  response regulator receiver protein  50.43 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4176  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 126 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1381  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1289  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254052  hitchhiker  0.00394342 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 123 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0925  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 123 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3678  response regulator receiver protein  45 
 
 		 123 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.716343  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1749  two component response regulator  42.5 
 
 		 123 aa  113  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  44.17 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  44.17 
 
 		 123 aa  111  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0903  cell division response regulator DivK  42.74 
 
 		 121 aa  110  5e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.91869  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 123 aa  110  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1219  response regulator receiver protein  52.34 
 
 		 126 aa  110  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3554  response regulator receiver protein  44.25 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1865  response regulator receiver protein  40.65 
 
 		 123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.111325  normal  0.212824 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0966  response regulator receiver  42.74 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.734958  normal  0.0218415 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  44.54 
 
 		 1954 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4117  GAF sensor hybrid histidine kinase  45.61 
 
 		 1588 aa  108  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0887298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.62 
 
 		 397 aa  108  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  41.03 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2080  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  45.76 
 
 		 1158 aa  108  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.264996 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.43 
 
 		 1352 aa  108  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0423  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 123 aa  107  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.89687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0930  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.177566 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3206  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.901142  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2107  response regulator receiver protein  47.79 
 
 		 123 aa  106  9.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1431  response regulator receiver  39.32 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  39.32 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  40.17 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0248  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.17 
 
 		 1271 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  40.71 
 
 		 121 aa  103  6e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3542  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 121 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 121 aa  103  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  40.17 
 
 		 121 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  39.32 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1051  response regulator receiver  43.75 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1134  two-component sensor  44.66 
 
 		 795 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0980947  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5565  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00725459 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1099  response regulator receiver  46.15 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1943  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.53 
 
 		 1468 aa  101  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.34 
 
 		 1245 aa  101  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3493  GAF sensor hybrid histidine kinase  44.86 
 
 		 1782 aa  100  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0298684  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1646  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.54 
 
 		 391 aa  100  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.930467  normal  0.0178265 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.1 
 
 		 1816 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3565  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 126 aa  100  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1307  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.43 
 
 		 391 aa  100  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  41.03 
 
 		 929 aa  100  9e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2180  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 		 922 aa  100  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.238731  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 123 aa  99.4  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0080  response regulator receiver domain-containing protein  38.46 
 
 		 124 aa  99.4  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  43.81 
 
 		 128 aa  99  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4585  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 124 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0945273  normal  0.0607582 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4215  response regulator receiver  39.66 
 
 		 124 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783308  normal  0.412692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6993  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.33 
 
 		 1159 aa  98.2  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.922616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1997  response regulator receiver  49.02 
 
 		 106 aa  98.6  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.34 
 
 		 1245 aa  98.6  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  45.79 
 
 		 920 aa  98.6  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.52 
 
 		 1839 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.2 
 
 		 1284 aa  97.8  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4732  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 133 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.788518  decreased coverage  0.0029072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0649  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 		 387 aa  97.4  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.736737  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0195  two component transcriptional regulator  38.71 
 
 		 222 aa  97.8  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.304768 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3766  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.72 
 
 		 802 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0676736 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0046  response regulator receiver protein  38.53 
 
 		 125 aa  97.4  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 1195 aa  97.4  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2257  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.53 
 
 		 1162 aa  97.4  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1118  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 452 aa  97.4  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000972917  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5197  response regulator receiver protein  41.59 
 
 		 134 aa  97.1  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.36 
 
 		 964 aa  96.7  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 		 1044 aa  96.7  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1614  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.34 
 
 		 873 aa  96.3  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.499982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 		 1917 aa  96.3  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.38 
 
 		 1896 aa  96.3  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  35 
 
 		 231 aa  96.7  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4465  adenylate/guanylate cyclase  42.02 
 
 		 561 aa  96.3  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.45 
 
 		 2213 aa  95.9  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0185  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 		 1214 aa  96.3  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467777  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 		 1857 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0876  response regulator receiver  42.11 
 
 		 526 aa  95.9  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183507 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0304  response regulator PleD  42.86 
 
 		 458 aa  95.9  2e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0864091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1737  response regulator receiver domain-containing protein  39.5 
 
 		 277 aa  95.5  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.570794  normal  0.630295 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2642  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 		 1216 aa  95.5  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.974276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3009  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 		 920 aa  95.5  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.59521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0500  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 		 373 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  43.27 
 
 		 1763 aa  95.5  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.52 
 
 		 2107 aa  95.5  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.2 
 
 		 1977 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>