More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3763 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  100 
 
 		 121 aa  244  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  74.79 
 
 		 123 aa  188  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  73.11 
 
 		 121 aa  181  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  71.79 
 
 		 123 aa  179  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4000  response regulator receiver protein  68.07 
 
 		 125 aa  172  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  68.91 
 
 		 128 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0604  response regulator receiver protein  61.54 
 
 		 123 aa  150  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.72319  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3554  response regulator receiver protein  59.13 
 
 		 125 aa  148  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3565  response regulator receiver protein  57.14 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4732  response regulator receiver protein  57.52 
 
 		 133 aa  144  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.788518  decreased coverage  0.0029072 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4215  response regulator receiver  57.52 
 
 		 124 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783308  normal  0.412692 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4585  response regulator receiver protein  57.52 
 
 		 124 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0945273  normal  0.0607582 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3308  response regulator receiver protein  52.07 
 
 		 130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.678314  normal  0.215079 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5197  response regulator receiver protein  54.78 
 
 		 134 aa  137  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1706  response regulator receiver protein  50.42 
 
 		 131 aa  133  8e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3877  response regulator receiver protein  52.5 
 
 		 130 aa  133  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0214  response regulator receiver protein  55.46 
 
 		 139 aa  130  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00485635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1527  response regulator receiver protein  51.26 
 
 		 119 aa  124  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1097  response regulator receiver protein  49.14 
 
 		 131 aa  123  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00801176  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.72 
 
 		 1274 aa  120  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3077  response regulator receiver protein  45.76 
 
 		 124 aa  120  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.74045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.37 
 
 		 397 aa  118  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.83 
 
 		 1245 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.31 
 
 		 1352 aa  116  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.72 
 
 		 1977 aa  114  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1548  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 124 aa  115  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  42.37 
 
 		 122 aa  111  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3612  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.01 
 
 		 1768 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.01 
 
 		 1765 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2626  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.54 
 
 		 392 aa  110  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4908  response regulator receiver protein  46.22 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100675  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.18 
 
 		 1245 aa  109  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.76 
 
 		 1284 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  46.15 
 
 		 1763 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4302  response regulator receiver protein  44.17 
 
 		 124 aa  107  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.15 
 
 		 1767 aa  107  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.15 
 
 		 1767 aa  107  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.15 
 
 		 1788 aa  107  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  45.3 
 
 		 1765 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  44.54 
 
 		 1053 aa  107  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2107  response regulator receiver protein  45 
 
 		 123 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.58 
 
 		 1078 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2535  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4133  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.76 
 
 		 1629 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1219  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 126 aa  105  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2543  response regulator receiver protein  46.67 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.72 
 
 		 940 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4337  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.76 
 
 		 1629 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.571014  normal  0.322198 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  47.01 
 
 		 742 aa  104  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.59 
 
 		 1792 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.59 
 
 		 1782 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.59 
 
 		 1786 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.59 
 
 		 1784 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1051  response regulator receiver  45.38 
 
 		 125 aa  103  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.11 
 
 		 1068 aa  104  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2690  response regulator receiver domain-containing protein  40.34 
 
 		 124 aa  103  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1000  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.45 
 
 		 1161 aa  103  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  40.17 
 
 		 497 aa  103  7e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0497  response regulator receiver protein  44.64 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.41839  hitchhiker  0.0000227207 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.35 
 
 		 1271 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  49.52 
 
 		 1028 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.74 
 
 		 1767 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4002  sensory transduction histidine kinase  45.61 
 
 		 1689 aa  101  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 		 1287 aa  102  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  46.9 
 
 		 1160 aa  101  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  43.33 
 
 		 823 aa  101  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3226  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.25 
 
 		 1251 aa  101  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0796968  normal  0.806997 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1639  histidine kinase  50 
 
 		 676 aa  101  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.576569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  40 
 
 		 124 aa  101  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.84 
 
 		 863 aa  101  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  46.28 
 
 		 818 aa  100  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.76 
 
 		 763 aa  100  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  43.1 
 
 		 1060 aa  100  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  44.07 
 
 		 1384 aa  100  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.74 
 
 		 1771 aa  100  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 121 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1346  PAS sensor protein  42.74 
 
 		 803 aa  100  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 121 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 121 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 124 aa  100  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.3 
 
 		 827 aa  100  9e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4205  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.07 
 
 		 1625 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2891  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  48.57 
 
 		 858 aa  99.4  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.432629 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.02 
 
 		 1245 aa  99.8  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  42.98 
 
 		 736 aa  99.4  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.1 
 
 		 326 aa  99.4  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 144 aa  99.4  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1368  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 125 aa  98.6  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.136056  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1099  response regulator receiver  46.22 
 
 		 129 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0981  putative sensor/response regulator hybrid  47.79 
 
 		 1418 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195382  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2101  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.63 
 
 		 678 aa  98.6  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.007905  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  41.96 
 
 		 1233 aa  99  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.44 
 
 		 454 aa  99  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45 
 
 		 1055 aa  99.4  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  41.82 
 
 		 1200 aa  99.4  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  44.07 
 
 		 735 aa  98.6  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.97 
 
 		 1166 aa  99  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 		 1230 aa  99  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.46 
 
 		 1040 aa  99.4  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>