More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0748 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  100 
 
 		 123 aa  249  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  74.79 
 
 		 121 aa  188  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  71.9 
 
 		 123 aa  187  2.9999999999999997e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4000  response regulator receiver protein  67.21 
 
 		 125 aa  182  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  72.73 
 
 		 121 aa  178  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  67.23 
 
 		 128 aa  172  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3565  response regulator receiver protein  60.66 
 
 		 126 aa  158  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0604  response regulator receiver protein  60.34 
 
 		 123 aa  158  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.72319  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3554  response regulator receiver protein  63.33 
 
 		 125 aa  158  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4732  response regulator receiver protein  60 
 
 		 133 aa  157  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.788518  decreased coverage  0.0029072 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4215  response regulator receiver  61.02 
 
 		 124 aa  156  8e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783308  normal  0.412692 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4585  response regulator receiver protein  61.02 
 
 		 124 aa  156  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0945273  normal  0.0607582 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5197  response regulator receiver protein  54.24 
 
 		 134 aa  140  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1527  response regulator receiver protein  56.67 
 
 		 119 aa  140  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0214  response regulator receiver protein  55 
 
 		 139 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00485635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1706  response regulator receiver protein  50 
 
 		 131 aa  135  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3877  response regulator receiver protein  50.42 
 
 		 130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3308  response regulator receiver protein  49.17 
 
 		 130 aa  130  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.678314  normal  0.215079 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1097  response regulator receiver protein  54.87 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00801176  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3077  response regulator receiver protein  49.14 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.74045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.85 
 
 		 1274 aa  122  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.96 
 
 		 397 aa  115  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1548  response regulator receiver protein  45 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2626  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.22 
 
 		 392 aa  115  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.33 
 
 		 1352 aa  114  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4302  response regulator receiver protein  46.22 
 
 		 124 aa  113  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4908  response regulator receiver protein  46.72 
 
 		 130 aa  113  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100675  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.28 
 
 		 1977 aa  113  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2535  response regulator receiver protein  44.26 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3612  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  44.74 
 
 		 122 aa  111  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  45 
 
 		 228 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.61 
 
 		 1245 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3206  response regulator receiver protein  48.28 
 
 		 126 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.901142  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1749  two component response regulator  43.8 
 
 		 123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.25 
 
 		 1245 aa  108  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.06 
 
 		 940 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 124 aa  107  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  48.21 
 
 		 1233 aa  107  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  42.86 
 
 		 1053 aa  106  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0925  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  49.17 
 
 		 823 aa  105  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  49.04 
 
 		 2213 aa  105  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.98 
 
 		 763 aa  105  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  44.92 
 
 		 651 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3355  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  44.17 
 
 		 685 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0162851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  44.54 
 
 		 651 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1289  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 123 aa  104  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254052  hitchhiker  0.00394342 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1099  response regulator receiver  47.15 
 
 		 129 aa  104  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1219  response regulator receiver protein  45.37 
 
 		 126 aa  105  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 123 aa  105  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1381  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 123 aa  104  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2107  response regulator receiver protein  46.28 
 
 		 123 aa  104  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3678  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 123 aa  104  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.716343  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.92 
 
 		 1765 aa  103  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1031  GAF sensor hybrid histidine kinase  48.65 
 
 		 1131 aa  104  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.768055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.98 
 
 		 1271 aa  103  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0631  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 123 aa  103  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1865  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 123 aa  103  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.111325  normal  0.212824 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  50 
 
 		 645 aa  103  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 124 aa  103  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  45.38 
 
 		 123 aa  103  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  43.86 
 
 		 921 aa  103  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.8 
 
 		 225 aa  102  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0179  histidine kinase  44.92 
 
 		 758 aa  103  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0640  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 123 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.98 
 
 		 1064 aa  103  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  43.64 
 
 		 1200 aa  102  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.45 
 
 		 1230 aa  102  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0966  response regulator receiver  41.88 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.734958  normal  0.0218415 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1051  response regulator receiver  45.53 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0960  histidine kinase  43.33 
 
 		 258 aa  102  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.61 
 
 		 1287 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  40.17 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  40.17 
 
 		 134 aa  101  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  40.17 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.64 
 
 		 1236 aa  101  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0318  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.11 
 
 		 1223 aa  101  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.438074 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2324  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.35 
 
 		 1162 aa  101  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.45 
 
 		 1245 aa  101  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  39.09 
 
 		 497 aa  101  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.09 
 
 		 1078 aa  101  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.07 
 
 		 1768 aa  101  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.13 
 
 		 782 aa  101  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.37 
 
 		 833 aa  100  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3000  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.37 
 
 		 968 aa  100  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  42.74 
 
 		 1236 aa  100  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0930  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 126 aa  100  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.177566 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.35 
 
 		 1791 aa  100  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  42.28 
 
 		 1574 aa  100  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.8 
 
 		 1199 aa  100  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.37 
 
 		 1234 aa  100  8e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  42.86 
 
 		 1188 aa  100  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 123 aa  100  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2891  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  45.71 
 
 		 858 aa  99.4  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.432629 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>