More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3039 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  100 
 
 		 121 aa  249  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  97.52 
 
 		 121 aa  244  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3542  response regulator receiver protein  97.52 
 
 		 121 aa  243  8e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  95.04 
 
 		 121 aa  240  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  95.87 
 
 		 121 aa  240  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1431  response regulator receiver  94.21 
 
 		 121 aa  238  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  90.91 
 
 		 121 aa  229  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  79.34 
 
 		 126 aa  205  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0966  response regulator receiver  79.34 
 
 		 126 aa  205  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.734958  normal  0.0218415 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0930  response regulator receiver protein  78.51 
 
 		 126 aa  203  7e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.177566 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  76.03 
 
 		 123 aa  201  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  76.03 
 
 		 134 aa  201  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  76.86 
 
 		 126 aa  199  8e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  76.86 
 
 		 126 aa  199  9e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3678  response regulator receiver protein  76.03 
 
 		 123 aa  199  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.716343  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  76.86 
 
 		 124 aa  195  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  73.55 
 
 		 123 aa  192  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1749  two component response regulator  74.38 
 
 		 123 aa  192  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1381  response regulator receiver protein  75.21 
 
 		 123 aa  192  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  75 
 
 		 124 aa  191  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1289  response regulator receiver protein  75.21 
 
 		 123 aa  192  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254052  hitchhiker  0.00394342 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0423  response regulator receiver protein  72.73 
 
 		 123 aa  191  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.89687 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  75 
 
 		 144 aa  191  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1865  response regulator receiver protein  74.17 
 
 		 123 aa  190  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.111325  normal  0.212824 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0925  response regulator receiver protein  74.38 
 
 		 123 aa  190  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  71.9 
 
 		 123 aa  188  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  71.67 
 
 		 127 aa  185  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3206  response regulator receiver protein  68.6 
 
 		 126 aa  178  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.901142  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0903  cell division response regulator DivK  68.33 
 
 		 121 aa  168  2e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.91869  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3009  response regulator receiver protein  61.34 
 
 		 120 aa  150  7e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2781  response regulator receiver protein  55.37 
 
 		 133 aa  144  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3108  response regulator receiver protein  50 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.6062  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.17 
 
 		 1274 aa  113  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  41.67 
 
 		 122 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1051  response regulator receiver  46.28 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0046  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 125 aa  110  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2107  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 123 aa  107  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1368  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 125 aa  105  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.136056  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2690  response regulator receiver domain-containing protein  39.32 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 		 1977 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0604  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 123 aa  102  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.72319  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3271  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 		 1352 aa  101  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  42.02 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.83 
 
 		 1070 aa  99.8  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1097  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00801176  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0988  response regulator receiver  42.24 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.634077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5197  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 134 aa  99  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4176  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 128 aa  98.2  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1099  response regulator receiver  47.57 
 
 		 129 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.98 
 
 		 763 aa  98.2  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0248  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 128 aa  97.4  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 		 1271 aa  97.4  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2709  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 129 aa  97.1  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000626377  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  40.34 
 
 		 1060 aa  96.3  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0135  response regulator receiver domain-containing protein  44.83 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1219  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 126 aa  96.7  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1409  two component signal transduction response regulator  42.37 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120114  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1548  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 		 1771 aa  95.5  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0877  response regulator  42.15 
 
 		 248 aa  95.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200847  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 123 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  37.93 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0497  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 124 aa  94.7  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.41839  hitchhiker  0.0000227207 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2241  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 		 956 aa  95.1  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87793  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 123 aa  94.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 		 1078 aa  94.4  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  34.48 
 
 		 497 aa  94.4  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 		 397 aa  94  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1527  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 119 aa  94  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 1044 aa  92.8  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 1172 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 		 993 aa  93.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  38.66 
 
 		 1765 aa  92.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 121 aa  92  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 		 1767 aa  92  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 		 1767 aa  92  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 		 1784 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 		 1782 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 		 1786 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 		 1792 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  38.33 
 
 		 1331 aa  91.7  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  36.84 
 
 		 742 aa  92  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 778 aa  91.7  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  42.5 
 
 		 666 aa  92  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  40.87 
 
 		 732 aa  91.3  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  41.96 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1706  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 		 1767 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.87 
 
 		 1160 aa  90.9  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 124 aa  90.9  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  37.61 
 
 		 1233 aa  90.9  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 964 aa  91.3  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 		 1313 aa  90.9  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 902 aa  90.5  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1220  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 130 aa  90.1  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0214  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 139 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00485635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 1788 aa  90.1  9e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3548  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.87 
 
 		 1007 aa  89.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.508984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>