More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0522 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0522  response regulator receiver protein  100 
 
 		 125 aa  260  4.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0537  response regulator receiver protein  96 
 
 		 125 aa  252  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  57.66 
 
 		 947 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.85 
 
 		 962 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2957  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  56.9 
 
 		 810 aa  130  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1879  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.61 
 
 		 604 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.34 
 
 		 940 aa  124  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  50.43 
 
 		 1346 aa  123  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2220  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.28 
 
 		 928 aa  122  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.467526 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.43 
 
 		 1245 aa  122  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  55.36 
 
 		 589 aa  121  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.35 
 
 		 816 aa  120  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  48.7 
 
 		 578 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.86 
 
 		 1363 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  47.83 
 
 		 923 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  48.7 
 
 		 588 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  49.11 
 
 		 667 aa  118  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  47.97 
 
 		 1135 aa  117  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.15 
 
 		 785 aa  115  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.86 
 
 		 871 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.363033  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  47.37 
 
 		 1193 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.22 
 
 		 995 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.86 
 
 		 817 aa  114  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 		 881 aa  114  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  47.46 
 
 		 718 aa  114  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000325842 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2693  histidine kinase  46.72 
 
 		 571 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0909214 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2004  response regulator receiver protein  46.55 
 
 		 149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  48.67 
 
 		 835 aa  112  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  47.79 
 
 		 2035 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.43 
 
 		 1126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121173  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  47.46 
 
 		 724 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  49.14 
 
 		 631 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.02 
 
 		 641 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.870294  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.43 
 
 		 1131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0232  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  49.14 
 
 		 738 aa  111  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0559  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.79 
 
 		 704 aa  111  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.86 
 
 		 765 aa  111  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  45.3 
 
 		 968 aa  111  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  47.86 
 
 		 982 aa  110  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1723  response regulator receiver and Hpt phospho transfer protein  45.69 
 
 		 285 aa  110  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.9 
 
 		 1788 aa  110  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2575  sensor histidine kinase/response regulator  48.21 
 
 		 850 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  47.32 
 
 		 743 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  46.22 
 
 		 666 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  46.96 
 
 		 781 aa  110  8.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  46.36 
 
 		 763 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.07 
 
 		 1127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2964  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.57 
 
 		 647 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.443547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.74 
 
 		 863 aa  109  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0558  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.59 
 
 		 893 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.843554  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.6 
 
 		 833 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.3 
 
 		 767 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2532  histidine kinase  45.61 
 
 		 399 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0679268  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 		 1007 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.01 
 
 		 916 aa  108  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0915  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.26 
 
 		 822 aa  108  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0616  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.59 
 
 		 766 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0116444 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0319  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  49.17 
 
 		 636 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2265  histidine kinase  45.69 
 
 		 559 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  48.67 
 
 		 909 aa  107  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.54 
 
 		 1692 aa  107  5e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2480  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.86 
 
 		 899 aa  107  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.618287  normal  0.57938 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2891  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  45.69 
 
 		 858 aa  107  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.432629 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  51.33 
 
 		 905 aa  107  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.3 
 
 		 647 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.83 
 
 		 1237 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.24 
 
 		 782 aa  106  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003637  hypothetical protein  46.22 
 
 		 1055 aa  105  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  47.32 
 
 		 582 aa  106  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  48.72 
 
 		 1885 aa  106  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.92 
 
 		 1397 aa  106  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  48.65 
 
 		 742 aa  105  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.53 
 
 		 1078 aa  105  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0425  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.35 
 
 		 893 aa  106  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.22 
 
 		 1398 aa  106  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.15 
 
 		 1358 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.54 
 
 		 877 aa  105  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.97 
 
 		 902 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  43.59 
 
 		 736 aa  105  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 1068 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2938  two component signal transduction response regulator  43.09 
 
 		 409 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.03674e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  46.15 
 
 		 1109 aa  105  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.876623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.86 
 
 		 1326 aa  105  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  43.1 
 
 		 921 aa  105  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2105  PAS  49.19 
 
 		 680 aa  105  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.292551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  43.55 
 
 		 833 aa  104  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2327  ATP-binding region ATPase domain protein  45.45 
 
 		 758 aa  104  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  45.69 
 
 		 606 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.74 
 
 		 876 aa  104  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  42.74 
 
 		 1014 aa  104  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2168  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.38 
 
 		 1204 aa  104  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172741 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.36 
 
 		 627 aa  104  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.22 
 
 		 964 aa  104  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.13 
 
 		 647 aa  104  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00025473 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  45.54 
 
 		 772 aa  103  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4725  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.1 
 
 		 614 aa  103  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269083  normal  0.0435637 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1794  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.55 
 
 		 965 aa  103  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332193  normal  0.80092 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0407  ATP-binding region, ATPase-like  41.41 
 
 		 650 aa  103  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0223  PAS  46.22 
 
 		 1214 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1639  histidine kinase  41.03 
 
 		 676 aa  102  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.576569  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>