More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2480 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2480  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
899 aa  1813    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.618287  normal  0.57938 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.48 
 
 
1202 aa  271  5e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.62 
 
 
1499 aa  235  3e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  28.24 
 
 
1135 aa  230  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.72 
 
 
1240 aa  227  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  28.64 
 
 
1014 aa  225  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.72 
 
 
977 aa  225  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  28 
 
 
801 aa  223  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.93 
 
 
1820 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  31.38 
 
 
1177 aa  222  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.53 
 
 
993 aa  221  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.89 
 
 
833 aa  221  5e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.32 
 
 
818 aa  219  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02943  two-component system sensor protein  30.12 
 
 
727 aa  219  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00726909  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.55 
 
 
1363 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.69 
 
 
1069 aa  216  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.96 
 
 
705 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.36 
 
 
1548 aa  213  9e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.75 
 
 
925 aa  213  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.77 
 
 
921 aa  213  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.75 
 
 
950 aa  213  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.17 
 
 
1266 aa  213  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.68 
 
 
818 aa  211  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.19 
 
 
1326 aa  210  8e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  32.63 
 
 
977 aa  209  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1512  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.63 
 
 
1480 aa  209  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0878697 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.45 
 
 
909 aa  205  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2842  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.15 
 
 
936 aa  205  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  27.26 
 
 
1287 aa  205  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.86 
 
 
1611 aa  204  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3706  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.75 
 
 
738 aa  205  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  28.51 
 
 
923 aa  204  7e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  26.85 
 
 
1442 aa  200  9e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.29 
 
 
1305 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  26.31 
 
 
1255 aa  198  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0706  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.74 
 
 
928 aa  197  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357941  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  25.79 
 
 
1322 aa  197  8.000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.08 
 
 
1369 aa  197  9e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3979  histidine kinase  31.35 
 
 
778 aa  197  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.405731  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.91 
 
 
946 aa  196  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.17 
 
 
876 aa  195  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.41 
 
 
816 aa  195  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27550  putative sensor/response regulator hybrid  33.59 
 
 
786 aa  195  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00922112 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.41 
 
 
1267 aa  195  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.82 
 
 
957 aa  195  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217317 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15460  membrane sensor hybrid histidine protein kinase  32.75 
 
 
772 aa  194  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.361903  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.21 
 
 
1040 aa  194  6e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.76 
 
 
1765 aa  194  7e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.84 
 
 
929 aa  193  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1381  Signal transduction histidine kinase-like protein  26.2 
 
 
1468 aa  193  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.770562  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.7 
 
 
1245 aa  193  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.15 
 
 
916 aa  192  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  24.23 
 
 
1763 aa  193  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.76 
 
 
1245 aa  192  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.87 
 
 
812 aa  192  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0943  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.18 
 
 
1384 aa  192  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.292303  normal  0.468485 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3612  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  32.02 
 
 
796 aa  191  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463414  normal  0.719468 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  26 
 
 
1397 aa  191  5.999999999999999e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2015  putative PAS/PAC sensor protein  25.13 
 
 
1119 aa  191  7e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000673901 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0067  signal transduction histidine kinase-like protein protein  26.88 
 
 
1021 aa  189  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1977  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.24 
 
 
1072 aa  190  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732577  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.57 
 
 
1398 aa  189  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  27.49 
 
 
852 aa  189  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4877  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.42 
 
 
923 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.876139  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.94 
 
 
1313 aa  188  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4824  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.42 
 
 
923 aa  188  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.688381 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  26.52 
 
 
1331 aa  188  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3120  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  25.54 
 
 
1653 aa  188  5e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  24.78 
 
 
1574 aa  187  6e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2941  putative PAS/PAC sensor protein  24.35 
 
 
1169 aa  187  7e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.725686  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06870  hybrid histidine protein kinase RetS  29.25 
 
 
933 aa  187  9e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.577631  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4699  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.24 
 
 
923 aa  187  9e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.200679  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1484  histidine kinase  31.44 
 
 
785 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.66 
 
 
1397 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1782  sensor histidine kinase/response regulator  31.02 
 
 
783 aa  185  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.78 
 
 
916 aa  185  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.04 
 
 
1767 aa  185  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.92 
 
 
1771 aa  185  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  25.86 
 
 
1765 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0611  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.59 
 
 
925 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62789  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 
887 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2377  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.25 
 
 
1124 aa  184  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.506766  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4614  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.24 
 
 
923 aa  184  7e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.863482  normal  0.296425 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  25.77 
 
 
1200 aa  184  7e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.27 
 
 
1767 aa  184  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  28.99 
 
 
758 aa  183  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1908  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.36 
 
 
991 aa  182  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1875  histidine kinase  30.84 
 
 
785 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0661847  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.74 
 
 
1768 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.54 
 
 
937 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.38 
 
 
1042 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.27 
 
 
835 aa  181  7e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4645  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.44 
 
 
948 aa  181  7e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1450  histidine kinase  30.92 
 
 
785 aa  181  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106734  normal  0.251272 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.59 
 
 
1767 aa  180  8e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.23 
 
 
1316 aa  181  8e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  28.6 
 
 
1346 aa  180  8e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.66 
 
 
964 aa  181  8e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03340  protein-histidine kinase, putative  27.41 
 
 
1390 aa  180  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.205996  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  28.32 
 
 
932 aa  180  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>