More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3766 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  64.35 
 
 		 662 aa  814    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00238573 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4796  sensor histidine kinase  55.09 
 
 		 668 aa  728    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4339  sensor histidine kinase  56.28 
 
 		 677 aa  727    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.691571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  64.31 
 
 		 662 aa  814    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4944  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  65.93 
 
 		 782 aa  1012    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.947631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  64.16 
 
 		 663 aa  813    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1134  two-component sensor  79.07 
 
 		 795 aa  1254    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0980947  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3766  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 802 aa  1627    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0676736 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  63.79 
 
 		 662 aa  821    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475165 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 		 914 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1665  putative sensor/response regulator hybrid  34.51 
 
 		 918 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.879832  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19340  putative sensor/response regulator hybrid  34.51 
 
 		 918 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2513  ATP-binding region, ATPase-like  29.27 
 
 		 945 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.543755  normal  0.160676 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.39 
 
 		 863 aa  281  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  41.52 
 
 		 982 aa  280  5e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  33.28 
 
 		 914 aa  280  6e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  40.2 
 
 		 620 aa  278  3e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.66 
 
 		 633 aa  278  4e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  38.19 
 
 		 651 aa  277  7e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 		 631 aa  275  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.38 
 
 		 781 aa  270  8.999999999999999e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  37.74 
 
 		 651 aa  270  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.28 
 
 		 1199 aa  267  5e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  35.28 
 
 		 641 aa  266  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.36 
 
 		 1127 aa  265  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.35 
 
 		 765 aa  265  4e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  33.84 
 
 		 732 aa  264  4.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 		 940 aa  264  6e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  37.41 
 
 		 772 aa  262  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.9 
 
 		 1407 aa  260  7e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  35.85 
 
 		 735 aa  259  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.48 
 
 		 995 aa  258  4e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.67 
 
 		 785 aa  258  4e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.02 
 
 		 643 aa  256  9e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  35.79 
 
 		 736 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.3 
 
 		 606 aa  255  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 		 1195 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.26 
 
 		 631 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  39.04 
 
 		 1023 aa  255  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.35 
 
 		 1068 aa  255  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.63 
 
 		 1078 aa  254  5.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  38.52 
 
 		 578 aa  254  6e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.15 
 
 		 827 aa  254  6e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.37 
 
 		 827 aa  253  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4293  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.56 
 
 		 1011 aa  253  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.291525  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  36.28 
 
 		 645 aa  251  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.68 
 
 		 973 aa  251  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2265  histidine kinase  38.27 
 
 		 559 aa  251  4e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.52 
 
 		 846 aa  251  5e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 		 902 aa  251  5e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  37.28 
 
 		 588 aa  251  5e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2693  histidine kinase  38.16 
 
 		 571 aa  250  6e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0909214 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.98 
 
 		 743 aa  251  6e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.6 
 
 		 881 aa  249  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00490  sensor protein BarA  27.77 
 
 		 1042 aa  249  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 643 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.9 
 
 		 778 aa  249  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.97 
 
 		 947 aa  249  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.2 
 
 		 898 aa  248  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.59 
 
 		 874 aa  248  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.48 
 
 		 1070 aa  249  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.42 
 
 		 643 aa  249  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.25 
 
 		 896 aa  248  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 957 aa  248  3e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2101  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.3 
 
 		 678 aa  248  4e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.007905  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.4 
 
 		 1135 aa  247  8e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4173  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.42 
 
 		 643 aa  246  9e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.22 
 
 		 1791 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  35.02 
 
 		 968 aa  246  9.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1928  sensor histidine kinase/response regulator  37.02 
 
 		 793 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0185  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 		 1214 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467777  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  36.9 
 
 		 742 aa  246  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.2 
 
 		 767 aa  245  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1360  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.85 
 
 		 974 aa  245  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.9 
 
 		 1358 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  37.62 
 
 		 661 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 644 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00181069  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4076  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.59 
 
 		 876 aa  244  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 		 817 aa  243  7e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.48 
 
 		 1055 aa  243  9e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.88 
 
 		 764 aa  243  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  36.18 
 
 		 606 aa  242  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.51 
 
 		 902 aa  242  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1760  histidine kinase  35.45 
 
 		 671 aa  242  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.81 
 
 		 957 aa  241  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.12 
 
 		 1287 aa  241  5.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 		 572 aa  240  9e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  35.98 
 
 		 1560 aa  239  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.39 
 
 		 1110 aa  239  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000219546 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  33.49 
 
 		 853 aa  239  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.55 
 
 		 763 aa  239  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2212  sensor histidine kinase/response regulator  34.93 
 
 		 641 aa  239  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 		 907 aa  239  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.79 
 
 		 1007 aa  238  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.93 
 
 		 962 aa  238  4e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0634  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.68 
 
 		 1000 aa  237  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.932649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3277  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.84 
 
 		 741 aa  237  6e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  36.71 
 
 		 900 aa  237  7e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.99 
 
 		 866 aa  237  8e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1879  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 		 604 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>