More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0639 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  86.31 
 
 		 662 aa  1122    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00238573 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4796  sensor histidine kinase  55.21 
 
 		 668 aa  707    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  86.77 
 
 		 662 aa  1125    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4339  sensor histidine kinase  56.39 
 
 		 677 aa  704    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.691571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3766  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  64.31 
 
 		 802 aa  812    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0676736 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1134  two-component sensor  63.94 
 
 		 795 aa  814    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0980947  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4944  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  64.84 
 
 		 782 aa  833    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.947631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  86.77 
 
 		 662 aa  1147    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475165 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 663 aa  1337    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.7 
 
 		 914 aa  301  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19340  putative sensor/response regulator hybrid  34.29 
 
 		 918 aa  298  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1665  putative sensor/response regulator hybrid  33.33 
 
 		 918 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.879832  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  32.82 
 
 		 914 aa  268  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00490  sensor protein BarA  27.12 
 
 		 1042 aa  234  3e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0507  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.2 
 
 		 1045 aa  231  5e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1906  response regulator receiver domain-containing protein  32.38 
 
 		 603 aa  214  4.9999999999999996e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 		 644 aa  211  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00181069  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2109  diguanylate cyclase  30.57 
 
 		 630 aa  209  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.843932  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0529  diguanylate cyclase  32.78 
 
 		 614 aa  206  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1682  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.93 
 
 		 749 aa  204  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0141753  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1596  Diverse 7TM receptor transmembrane region  26.65 
 
 		 660 aa  203  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.351374 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1456  diguanylate cyclase  33.69 
 
 		 636 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0501  histidine kinase  26.56 
 
 		 955 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2391  Diverse 7TM receptor transmembrane region  32.26 
 
 		 726 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2871  response regulator  33.09 
 
 		 564 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2513  ATP-binding region, ATPase-like  27.27 
 
 		 945 aa  194  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.543755  normal  0.160676 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2796  phosphoglycerate transport; protein for signal transmission  24.54 
 
 		 724 aa  188  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000463972  normal  0.015669 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3939  response regulator receiver domain-containing protein  31.65 
 
 		 588 aa  187  5e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.238688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0058  diguanylate cyclase  34.4 
 
 		 565 aa  187  5e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.714624  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2954  diguanylate cyclase  33.84 
 
 		 612 aa  183  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0512853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2730  diguanylate cyclase  32.07 
 
 		 638 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.814579  normal  0.595433 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3148  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.2 
 
 		 932 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0238696  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3291  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.2 
 
 		 933 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.59315  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1223  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.2 
 
 		 933 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.915072  hitchhiker  0.00275603 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3146  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.2 
 
 		 933 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.155765  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.17 
 
 		 816 aa  181  4.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2767  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.17 
 
 		 933 aa  180  9e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294821  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4293  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.98 
 
 		 1011 aa  179  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.291525  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2797  sensor kinase of Zn/Pb responsive two-component regulatory system  29.3 
 
 		 707 aa  179  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000203115  normal  0.0370017 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4117  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.32 
 
 		 948 aa  179  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.56 
 
 		 935 aa  178  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715392 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1175  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.56 
 
 		 935 aa  179  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  normal  0.0419846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4725  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.97 
 
 		 614 aa  179  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269083  normal  0.0435637 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.56 
 
 		 935 aa  179  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1047  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.84 
 
 		 952 aa  178  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.017027  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.02 
 
 		 606 aa  177  4e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 631 aa  177  6e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  26.29 
 
 		 708 aa  177  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3457  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.84 
 
 		 935 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.25 
 
 		 667 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.25 
 
 		 1363 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  33.43 
 
 		 661 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 		 896 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1191  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.56 
 
 		 950 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000146059  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1876  histidine kinase  26.93 
 
 		 979 aa  174  5e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0246829  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.88 
 
 		 1202 aa  173  7.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1928  sensor histidine kinase/response regulator  35.85 
 
 		 793 aa  173  9e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2693  histidine kinase  39.13 
 
 		 571 aa  173  9e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0909214 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  37.26 
 
 		 1346 aa  173  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  41.96 
 
 		 1177 aa  172  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.27 
 
 		 941 aa  172  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3589  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.63 
 
 		 853 aa  171  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0611  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.23 
 
 		 925 aa  171  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.02 
 
 		 937 aa  171  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1879  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.02 
 
 		 604 aa  171  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1988  sensor protein for response regulator AtoC  25.77 
 
 		 715 aa  170  6e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.431904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.6 
 
 		 1442 aa  170  6e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  36.63 
 
 		 932 aa  170  7e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.67 
 
 		 929 aa  170  8e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.85 
 
 		 929 aa  170  8e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.26 
 
 		 932 aa  170  9e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  39.67 
 
 		 982 aa  170  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.88 
 
 		 765 aa  169  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 		 633 aa  170  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0659  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.41 
 
 		 570 aa  169  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.75 
 
 		 874 aa  170  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.79 
 
 		 933 aa  168  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0986  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.97 
 
 		 921 aa  168  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000725177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0847  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.07 
 
 		 918 aa  168  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185431  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.19 
 
 		 918 aa  167  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1873  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.84 
 
 		 923 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.44 
 
 		 898 aa  168  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 		 918 aa  167  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  36.57 
 
 		 1407 aa  167  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.46 
 
 		 927 aa  167  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  36.3 
 
 		 1014 aa  167  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.9 
 
 		 918 aa  167  5e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1360  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.65 
 
 		 974 aa  167  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.9 
 
 		 918 aa  167  5e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.9 
 
 		 918 aa  167  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.9 
 
 		 918 aa  167  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  37.61 
 
 		 736 aa  167  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.9 
 
 		 918 aa  167  5e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.55 
 
 		 627 aa  167  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.9 
 
 		 918 aa  167  5e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  33.9 
 
 		 918 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  33.9 
 
 		 918 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3391  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.19 
 
 		 931 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3322  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.97 
 
 		 930 aa  167  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000885025  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3463  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.42 
 
 		 1333 aa  167  8e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.245922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>