More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00947 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00947  Signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 237 aa  489  1e-137  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000206574  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0516  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.91 
 
 		 850 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.377634 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0307  response regulator, histidine kinase  40.43 
 
 		 755 aa  169  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1614  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.3 
 
 		 873 aa  169  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.499982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.77 
 
 		 643 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  41.89 
 
 		 1028 aa  166  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.91 
 
 		 643 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2664  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 		 662 aa  165  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373594  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0688  histidine kinase  38.66 
 
 		 691 aa  164  9e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2212  sensor histidine kinase/response regulator  41.52 
 
 		 641 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  40.35 
 
 		 645 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2895  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 		 1324 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.00000343468  normal  0.0609683 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  41.26 
 
 		 651 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  36.51 
 
 		 641 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.51 
 
 		 1029 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.34 
 
 		 763 aa  162  6e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  41.52 
 
 		 1023 aa  161  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1639  histidine kinase  38.86 
 
 		 676 aa  160  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.576569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  40.95 
 
 		 1560 aa  160  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.34 
 
 		 1452 aa  160  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.34 
 
 		 643 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3366  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.45 
 
 		 762 aa  159  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  37.77 
 
 		 631 aa  159  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0244  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.92 
 
 		 1066 aa  159  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2108  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.36 
 
 		 924 aa  159  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.154995  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  38.7 
 
 		 982 aa  159  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0876  response regulator receiver  37.89 
 
 		 526 aa  159  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183507 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  40.81 
 
 		 651 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  40.18 
 
 		 853 aa  158  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1760  histidine kinase  40.47 
 
 		 671 aa  158  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4173  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.77 
 
 		 643 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  43.75 
 
 		 781 aa  157  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3852  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.38 
 
 		 879 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0452097  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.99 
 
 		 633 aa  156  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.7 
 
 		 1407 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01620  Signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 		 806 aa  156  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2847  PAS  42.92 
 
 		 764 aa  155  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.445085  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 		 1229 aa  155  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1360  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.16 
 
 		 974 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3798  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.91 
 
 		 864 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 		 572 aa  155  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.74 
 
 		 631 aa  154  8e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.74 
 
 		 817 aa  154  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.78 
 
 		 1791 aa  154  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.66 
 
 		 1287 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1497  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 		 880 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0460  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  39.57 
 
 		 835 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.980587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.91 
 
 		 932 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.19 
 
 		 846 aa  152  7e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.81 
 
 		 959 aa  151  8e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  39.74 
 
 		 659 aa  150  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0551  PAS  42.38 
 
 		 1026 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.425664 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003904  sensor histidine kinase  39.11 
 
 		 806 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.397449  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0522  two component sensor kinase/response regulator hybrid  39.63 
 
 		 751 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1360  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.19 
 
 		 644 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.528402  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.2 
 
 		 1110 aa  149  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000219546 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.71 
 
 		 524 aa  149  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  39.34 
 
 		 735 aa  149  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.19 
 
 		 1199 aa  149  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.27 
 
 		 1127 aa  149  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1601  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.22 
 
 		 685 aa  149  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0518398  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1055  sensor histidine kinase/response regulator  38.67 
 
 		 514 aa  148  8e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  40.62 
 
 		 732 aa  148  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  38.6 
 
 		 582 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  37.12 
 
 		 759 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.45 
 
 		 863 aa  147  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.09 
 
 		 827 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3508  sensor histidine kinase  38.16 
 
 		 729 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.84 
 
 		 939 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.99 
 
 		 896 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.29 
 
 		 785 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  39.23 
 
 		 736 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0420  PAS  36.92 
 
 		 787 aa  146  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0516903 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03102  sensor histidine kinase/response regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12550)  35.83 
 
 		 2312 aa  145  4.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.461392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  38.74 
 
 		 794 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  39.29 
 
 		 777 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2168  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.05 
 
 		 1204 aa  145  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172741 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  38.5 
 
 		 853 aa  145  5e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4076  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.78 
 
 		 876 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.64 
 
 		 1195 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2833  histidine kinase  38.64 
 
 		 576 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535084 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  37.61 
 
 		 631 aa  144  8.000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.23 
 
 		 874 aa  144  9e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  38.22 
 
 		 968 aa  144  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.81 
 
 		 627 aa  144  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2934  PAS  40.99 
 
 		 955 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000914767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1877  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.18 
 
 		 863 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.61 
 
 		 945 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.67 
 
 		 969 aa  143  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.64 
 
 		 862 aa  143  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3528  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.72 
 
 		 690 aa  143  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148332  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.18 
 
 		 957 aa  143  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.09 
 
 		 1049 aa  142  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.66 
 
 		 873 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.94 
 
 		 869 aa  142  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 		 1433 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1933  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.21 
 
 		 650 aa  142  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.77937  normal  0.846715 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  37.39 
 
 		 666 aa  142  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  33.59 
 
 		 1060 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4224  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.11 
 
 		 877 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.249922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>