More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0916 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 231 aa  471  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0574949  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  42.06 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  42.06 
 
 		 234 aa  205  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  42.49 
 
 		 233 aa  201  6e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  42.49 
 
 		 233 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  42.49 
 
 		 233 aa  201  8e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  42.49 
 
 		 233 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  42.49 
 
 		 233 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  42.49 
 
 		 233 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  42.49 
 
 		 233 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  42.49 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  41.2 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  41.63 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0255  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000922211  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  41.2 
 
 		 233 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  39.48 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2674  DNA-binding response regulator  41.15 
 
 		 232 aa  187  9e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00069138  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1580  response regulator receiver  40.09 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2359  DNA-binding response regulator  40.71 
 
 		 232 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.596616  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0963  two component transcriptional regulator  41.15 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  38.96 
 
 		 231 aa  185  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  38.96 
 
 		 231 aa  184  9e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  38.53 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  38.53 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  38.53 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1055  DNA-binding response regulator SrrA  40.95 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  38.53 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  38.53 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  38.53 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  38.53 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  39.04 
 
 		 228 aa  182  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4663  DNA-binding response regulator  38.6 
 
 		 230 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  37.93 
 
 		 232 aa  180  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3518  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.99 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4433  DNA-binding response regulator  38.16 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4777  DNA-binding response regulator  38.16 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3233  two component transcriptional regulator  38.16 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4272  response regulator  38.16 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1336  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.71 
 
 		 228 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4662  DNA-binding response regulator  37.72 
 
 		 230 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2940  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 		 228 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0012757  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4650  DNA-binding response regulator  38.16 
 
 		 230 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  37.72 
 
 		 237 aa  178  8e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  37.72 
 
 		 237 aa  178  8e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  37.28 
 
 		 237 aa  177  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  37.72 
 
 		 237 aa  178  8e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4365  two component transcriptional regulator  36.84 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.36 
 
 		 236 aa  177  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4647  DNA-binding response regulator  37.72 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1956  DNA-binding response regulator  40.6 
 
 		 232 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  37.28 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4283  response regulator  38.16 
 
 		 230 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.65 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0590  DNA-binding response regulator  36.84 
 
 		 230 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  37.83 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  39.22 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  37.72 
 
 		 237 aa  176  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0488  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.34 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1715  response regulator  40.6 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0124001  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  39.22 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  37.83 
 
 		 237 aa  176  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 232 aa  175  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  39.21 
 
 		 232 aa  175  6e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1689  response regulator  40.17 
 
 		 232 aa  175  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3473  DNA-binding response regulator  38.53 
 
 		 232 aa  174  7e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348992 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1403  DNA-binding response regulator  41.33 
 
 		 225 aa  174  8e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000398651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1985  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 232 aa  174  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1739  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1877  DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.67 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  38.26 
 
 		 229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23040  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  38.53 
 
 		 229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.318653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1869  DNA-binding response regulator  38.36 
 
 		 232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1912  DNA-binding response regulator  38.1 
 
 		 232 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0928779 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  39.11 
 
 		 231 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1399  two component transcriptional regulator  38.1 
 
 		 238 aa  171  9e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129694  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1531  DNA-binding response regulator ResD  38.53 
 
 		 238 aa  170  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3814  DNA-binding response regulator ResD  38.53 
 
 		 238 aa  170  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.95849e-16 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  36.68 
 
 		 238 aa  170  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.79 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1601  DNA-binding response regulator ResD  38.53 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953648  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1386  DNA-binding response regulator ResD  38.53 
 
 		 238 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1359  response regulator  38.53 
 
 		 238 aa  170  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1358  response regulator  38.53 
 
 		 238 aa  170  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1569  DNA-binding response regulator ResD  38.53 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45334e-32 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0117  two component transcriptional regulator  38.22 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000111014  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1497  DNA-binding response regulator ResD  38.53 
 
 		 238 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.862661  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1637  DNA-binding response regulator ResD  38.53 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0246031  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5471  two component transcriptional regulator  38.43 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00800002  hitchhiker  0.0013378 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0351  DNA-binding response regulator  38.22 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 224 aa  169  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0867  two component transcriptional regulator  39.41 
 
 		 236 aa  169  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1735  DNA-binding response regulator  37.78 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  38.16 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>