More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0843 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0843  response regulator receiver protein  100 
 
 		 122 aa  233  5.0000000000000005e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.774989  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0092  response regulator receiver protein  69.49 
 
 		 120 aa  164  4e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0467  response regulator receiver protein  65.83 
 
 		 122 aa  151  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0452  response regulator receiver protein  65.83 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  49.14 
 
 		 233 aa  105  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0775  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 122 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0246849 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  47.46 
 
 		 231 aa  105  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  47.46 
 
 		 231 aa  104  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  38.66 
 
 		 121 aa  103  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1382  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 122 aa  102  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.997925  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  44.17 
 
 		 120 aa  103  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 121 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1576  response regulator receiver domain-containing protein  42.5 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0980022  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1598  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  49.15 
 
 		 231 aa  102  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1110  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.02 
 
 		 234 aa  101  4e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  49.14 
 
 		 235 aa  101  4e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1155  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 122 aa  100  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22671  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 226 aa  100  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.83 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 138 aa  99.4  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.96 
 
 		 236 aa  99.4  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1555  response regulator receiver protein  45 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2177  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1560  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 129 aa  98.6  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  44.07 
 
 		 234 aa  98.6  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  44.07 
 
 		 234 aa  98.6  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3942  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 163 aa  97.8  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3065  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 120 aa  97.8  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3791  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 120 aa  97.8  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1003  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 128 aa  97.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5319  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 137 aa  97.8  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0886883  normal  0.780288 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  48.28 
 
 		 236 aa  97.4  5e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.1 
 
 		 235 aa  97.8  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  45.61 
 
 		 239 aa  97.8  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0566  response regulator receiver domain-containing protein  39.5 
 
 		 120 aa  97.4  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.83 
 
 		 237 aa  97.1  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1793  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 122 aa  97.1  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2318  chemotaxis protein CheY  44.92 
 
 		 121 aa  96.7  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  46.15 
 
 		 403 aa  96.7  9e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2041  DNA-binding response regulator  42.86 
 
 		 225 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972255  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2994  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1315  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 121 aa  96.7  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0517324  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0584  chemotaxis signal transduction protein CheY  40.34 
 
 		 120 aa  96.7  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.74 
 
 		 230 aa  96.7  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 246 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  39.29 
 
 		 1987 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0654  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 120 aa  95.9  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54464 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0315  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 138 aa  95.9  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.198988 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4379  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 120 aa  95.9  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  38.39 
 
 		 1992 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  38.98 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 130 aa  95.1  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1962  DNA-binding response regulator  43.59 
 
 		 225 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.597164  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 236 aa  95.5  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.22 
 
 		 247 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.62 
 
 		 236 aa  95.1  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0669  response regulator receiver domain-containing protein  39.83 
 
 		 167 aa  95.5  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00304574  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 246 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 		 243 aa  95.1  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2062  DNA-binding response regulator  42.86 
 
 		 225 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000169038  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3354  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2437  chemotaxis response regulator, CheY1  38.26 
 
 		 122 aa  94.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.365798  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.06 
 
 		 232 aa  95.1  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 1127 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  38.52 
 
 		 2336 aa  95.1  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3294  response regulator receiver  39.83 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 257 aa  95.1  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.5 
 
 		 246 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2571  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.38 
 
 		 406 aa  94.4  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.156881 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1816  DNA-binding response regulator  43.59 
 
 		 254 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  42.37 
 
 		 242 aa  94.7  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1772  response regulator  42.74 
 
 		 254 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3366  DNA-binding response regulator  43.59 
 
 		 225 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.166078  hitchhiker  0.00000000000000126215 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1101  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 122 aa  94.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2299  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 275 aa  94.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0218685  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1955  DNA-binding response regulator  43.59 
 
 		 228 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1593  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 121 aa  94.7  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1447  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 121 aa  94.7  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2620  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 121 aa  94.7  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1642  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.22 
 
 		 406 aa  94.7  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.905013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1991  DNA-binding response regulator  42.74 
 
 		 254 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9362699999999994e-45 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  40.68 
 
 		 2301 aa  94.7  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 123 aa  94.4  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1456  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 124 aa  94.4  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 239 aa  94.4  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.24 
 
 		 234 aa  94.4  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  44.86 
 
 		 255 aa  94.4  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1371  response regulator receiver domain-containing protein  37.93 
 
 		 132 aa  94.4  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.019268  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.22 
 
 		 230 aa  94.4  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2384  two component transcriptional regulator  41.53 
 
 		 259 aa  94  6e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  43.59 
 
 		 239 aa  94  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  43.22 
 
 		 239 aa  93.6  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  94  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>