More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3688 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3688  response regulator receiver protein  100 
 
 
133 aa  269  8.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478813  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3899  response regulator receiver  84.3 
 
 
136 aa  216  8.999999999999998e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2552  response regulator receiver domain-containing protein  82.26 
 
 
130 aa  215  2e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  80.99 
 
 
138 aa  207  3e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3971  response regulator receiver protein  77.31 
 
 
145 aa  199  7e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3190  twitching motility, CheY-like protein  75.63 
 
 
141 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  68.8 
 
 
132 aa  192  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1818  two component reponse regulator  73.55 
 
 
125 aa  191  2e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2101  response regulator receiver domain-containing protein  73.55 
 
 
125 aa  192  2e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3354  response regulator receiver protein  72.03 
 
 
147 aa  189  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878811  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5308  response regulator receiver domain-containing protein  73.11 
 
 
134 aa  188  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0630269  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  70.73 
 
 
137 aa  187  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  69.42 
 
 
161 aa  187  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1136  response regulator receiver domain-containing protein  68.8 
 
 
132 aa  187  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3089  response regulator receiver protein  70.25 
 
 
133 aa  186  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.22915 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0508  twitching motility protein PilG  72.03 
 
 
135 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05320  twitching motility protein PilG  72.03 
 
 
135 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5034  type IV pilus response regulator PilG  71.43 
 
 
136 aa  185  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0901  response regulator receiver protein  68 
 
 
136 aa  185  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0488  response regulator receiver  71.43 
 
 
136 aa  185  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0403  response regulator receiver protein  72.03 
 
 
135 aa  185  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  68.6 
 
 
130 aa  185  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  72.03 
 
 
132 aa  185  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3021  response regulator receiver protein  68.33 
 
 
144 aa  184  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.381292  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3634  response regulator receiver domain-containing protein  69.11 
 
 
131 aa  183  5e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.185946  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1371  response regulator receiver domain-containing protein  68.91 
 
 
132 aa  183  7e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.019268  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0893  response regulator receiver protein  68.85 
 
 
138 aa  182  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.605635  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0612  response regulator receiver protein  68.33 
 
 
152 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296044  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1017  response regulator receiver protein  68.85 
 
 
138 aa  182  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88924  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0560  response regulator receiver protein  68.33 
 
 
165 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2159  response regulator receiver protein  65.87 
 
 
129 aa  181  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1572  response regulator receiver protein  67.21 
 
 
132 aa  182  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2901  response regulator receiver protein  71.05 
 
 
130 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191122  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  69.23 
 
 
133 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  69.23 
 
 
133 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  71.68 
 
 
160 aa  178  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5042  response regulator receiver protein  69.23 
 
 
133 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3578  response regulator receiver protein  70.18 
 
 
130 aa  178  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.677729  normal  0.0425656 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0472  response regulator receiver protein  68.38 
 
 
133 aa  178  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03180  type IV pili response regulator, PilG  71.19 
 
 
135 aa  177  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392248  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01602  type IV pilus response regulator PilG  69.57 
 
 
117 aa  175  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0668  twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  64.17 
 
 
179 aa  174  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2400  response regulator receiver protein  61.11 
 
 
135 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.726464 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0669  response regulator receiver domain-containing protein  66.96 
 
 
167 aa  170  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00304574  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 
2539 aa  107  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0987  response regulator receiver protein  40.71 
 
 
414 aa  105  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  41.23 
 
 
2476 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  41.23 
 
 
2458 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
1646 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
1647 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
1646 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  41.23 
 
 
2423 aa  104  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  37.82 
 
 
1987 aa  102  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  38.66 
 
 
1992 aa  102  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 
1629 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
1758 aa  102  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0855  response regulator receiver domain-containing protein  38.33 
 
 
417 aa  102  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541919 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0413  response regulator receiver protein  39.13 
 
 
347 aa  100  9e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  40.52 
 
 
121 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 
1832 aa  99.8  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  38.66 
 
 
121 aa  99.4  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1102  response regulator receiver domain-containing protein  39.66 
 
 
457 aa  99.4  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.84 
 
 
231 aa  98.6  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  40.35 
 
 
2301 aa  99.4  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3942  response regulator receiver protein  43.36 
 
 
163 aa  97.8  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0058  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 
347 aa  97.8  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.259686  normal  0.253815 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  37.5 
 
 
1971 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  41.27 
 
 
255 aa  97.4  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 
246 aa  97.1  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4019  response regulator receiver protein  35.96 
 
 
396 aa  97.1  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4057  response regulator receiver protein  35.96 
 
 
396 aa  97.1  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  37.17 
 
 
123 aa  96.3  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  37.29 
 
 
121 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  40.34 
 
 
235 aa  95.1  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  43.12 
 
 
1974 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  41.07 
 
 
2336 aa  95.5  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  39.47 
 
 
2284 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0323  two component transcriptional regulator  36.07 
 
 
227 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  37.12 
 
 
235 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  37.12 
 
 
235 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  37.12 
 
 
235 aa  94.4  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  37.12 
 
 
235 aa  94.4  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  37.12 
 
 
235 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  37.12 
 
 
235 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0723  response regulator receiver protein  39.05 
 
 
405 aa  94.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  37.12 
 
 
235 aa  94.4  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  37.12 
 
 
235 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1061  response regulator receiver protein  37.72 
 
 
427 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.609626  hitchhiker  0.0000494803 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4742  response regulator receiver protein  39.45 
 
 
382 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  hitchhiker  0.00408649 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0752  response regulator receiver protein  39.42 
 
 
405 aa  94  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26894  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3249  response regulator receiver protein  38.79 
 
 
405 aa  94.4  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.18 
 
 
326 aa  94  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  37.12 
 
 
235 aa  94  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  35.4 
 
 
125 aa  94  6e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  41.07 
 
 
1989 aa  94  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  37.3 
 
 
236 aa  94  7e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  37.12 
 
 
235 aa  94  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  37.12 
 
 
235 aa  94  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5381  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.5 
 
 
235 aa  94  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0242785  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  40 
 
 
352 aa  93.6  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>