More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2552 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2552  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 130 aa  268  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3688  response regulator receiver protein  82.26 
 
 		 133 aa  215  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478813  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3899  response regulator receiver  79.2 
 
 		 136 aa  213  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  78.4 
 
 		 138 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3971  response regulator receiver protein  76.07 
 
 		 145 aa  198  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1136  response regulator receiver domain-containing protein  72.73 
 
 		 132 aa  197  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3190  twitching motility, CheY-like protein  72.27 
 
 		 141 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  70.83 
 
 		 132 aa  190  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2101  response regulator receiver domain-containing protein  71.2 
 
 		 125 aa  190  5e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1818  two component reponse regulator  73.73 
 
 		 125 aa  189  8e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3021  response regulator receiver protein  66.17 
 
 		 144 aa  189  8e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.381292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  67.48 
 
 		 130 aa  189  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0901  response regulator receiver protein  71.43 
 
 		 136 aa  189  8e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3354  response regulator receiver protein  70.94 
 
 		 147 aa  189  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  67.2 
 
 		 161 aa  189  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  67.74 
 
 		 137 aa  188  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1371  response regulator receiver domain-containing protein  72.17 
 
 		 132 aa  187  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.019268  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2901  response regulator receiver protein  70.59 
 
 		 130 aa  187  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191122  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5308  response regulator receiver domain-containing protein  71.19 
 
 		 134 aa  186  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0630269  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3089  response regulator receiver protein  67.48 
 
 		 133 aa  186  9e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22915 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0508  twitching motility protein PilG  68.6 
 
 		 135 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0403  response regulator receiver protein  69.75 
 
 		 135 aa  186  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05320  twitching motility protein PilG  68.6 
 
 		 135 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  65.32 
 
 		 133 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5034  type IV pilus response regulator PilG  70.34 
 
 		 136 aa  185  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0488  response regulator receiver  70.34 
 
 		 136 aa  185  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3578  response regulator receiver protein  69.75 
 
 		 130 aa  185  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.677729  normal  0.0425656 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  65.32 
 
 		 133 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5042  response regulator receiver protein  65.32 
 
 		 133 aa  184  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2159  response regulator receiver protein  63.71 
 
 		 129 aa  184  5e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1572  response regulator receiver protein  68.64 
 
 		 132 aa  183  8e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  64 
 
 		 132 aa  182  9e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3634  response regulator receiver domain-containing protein  68.33 
 
 		 131 aa  182  9e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.185946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0612  response regulator receiver protein  65.57 
 
 		 152 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0560  response regulator receiver protein  65.57 
 
 		 165 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0893  response regulator receiver protein  66.39 
 
 		 138 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.605635  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1017  response regulator receiver protein  66.39 
 
 		 138 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88924  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0472  response regulator receiver protein  63.71 
 
 		 133 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01602  type IV pilus response regulator PilG  68.38 
 
 		 117 aa  180  7e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03180  type IV pili response regulator, PilG  68.64 
 
 		 135 aa  177  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392248  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2400  response regulator receiver protein  63.33 
 
 		 135 aa  175  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.726464 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  64 
 
 		 160 aa  175  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0668  twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  61.16 
 
 		 179 aa  171  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0669  response regulator receiver domain-containing protein  63.48 
 
 		 167 aa  166  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00304574  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 		 2539 aa  110  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0987  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 414 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 		 1646 aa  106  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 		 1646 aa  106  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 		 1647 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0855  response regulator receiver domain-containing protein  40.17 
 
 		 417 aa  105  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541919 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 		 1758 aa  104  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 		 1629 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0413  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 347 aa  104  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0058  response regulator receiver domain-containing protein  39.32 
 
 		 347 aa  104  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.259686  normal  0.253815 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0723  response regulator receiver protein  37.9 
 
 		 405 aa  103  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0752  response regulator receiver protein  39.64 
 
 		 405 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 		 2423 aa  101  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  42.11 
 
 		 2336 aa  101  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3249  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 405 aa  101  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  38.94 
 
 		 2458 aa  100  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 125 aa  100  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  38.94 
 
 		 2476 aa  100  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  36.97 
 
 		 1987 aa  100  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  37.82 
 
 		 1992 aa  100  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1102  response regulator receiver domain-containing protein  38.79 
 
 		 457 aa  100  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  40.34 
 
 		 1888 aa  99.4  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  41.23 
 
 		 1974 aa  99.8  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3942  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 163 aa  98.2  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 246 aa  97.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  37.17 
 
 		 2301 aa  97.8  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2790  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 398 aa  97.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4742  response regulator receiver protein  39.09 
 
 		 382 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  hitchhiker  0.00408649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 121 aa  97.1  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.62 
 
 		 1971 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  37.8 
 
 		 235 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  37.8 
 
 		 235 aa  96.7  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3336  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 399 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  37.8 
 
 		 235 aa  96.7  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  37.8 
 
 		 235 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3491  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 345 aa  96.3  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  37.8 
 
 		 235 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  37.8 
 
 		 235 aa  96.7  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2781  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 399 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  37.8 
 
 		 235 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0323  two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 227 aa  96.7  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1061  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 427 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.609626  hitchhiker  0.0000494803 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  39.82 
 
 		 1956 aa  95.5  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0509  response regulator receiver domain-containing protein  37.8 
 
 		 412 aa  95.9  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3775  response regulator receiver domain-containing protein  35.65 
 
 		 394 aa  95.9  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0963043 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01871  two-component response regulator  35.77 
 
 		 242 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.528311  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 1907 aa  95.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  37.01 
 
 		 235 aa  95.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  37.01 
 
 		 235 aa  95.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  37.01 
 
 		 235 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 245 aa  94.7  4e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01891  two-component response regulator  34.96 
 
 		 242 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 121 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0171  two component LuxR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 242 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  36.28 
 
 		 2284 aa  94  6e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>