More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0669 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0669  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 167 aa  337  4e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00304574  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  73.72 
 
 		 160 aa  229  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0560  response regulator receiver protein  82.05 
 
 		 165 aa  206  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0612  response regulator receiver protein  82.05 
 
 		 152 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296044  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0668  twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  75 
 
 		 179 aa  201  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3899  response regulator receiver  69.49 
 
 		 136 aa  180  9.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1371  response regulator receiver domain-containing protein  63.87 
 
 		 132 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.019268  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3354  response regulator receiver protein  64.35 
 
 		 147 aa  177  5.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3971  response regulator receiver protein  69.03 
 
 		 145 aa  177  8e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1136  response regulator receiver domain-containing protein  64.04 
 
 		 132 aa  175  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3190  twitching motility, CheY-like protein  64.35 
 
 		 141 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  62.5 
 
 		 132 aa  173  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2901  response regulator receiver protein  59.68 
 
 		 130 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191122  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0901  response regulator receiver protein  61.34 
 
 		 136 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3688  response regulator receiver protein  66.96 
 
 		 133 aa  170  7.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478813  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3578  response regulator receiver protein  58.87 
 
 		 130 aa  169  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.677729  normal  0.0425656 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3021  response regulator receiver protein  63.72 
 
 		 144 aa  168  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.381292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1572  response regulator receiver protein  59.66 
 
 		 132 aa  167  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2552  response regulator receiver domain-containing protein  63.48 
 
 		 130 aa  166  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  65.79 
 
 		 138 aa  166  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  58.09 
 
 		 161 aa  164  4e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5034  type IV pilus response regulator PilG  58.87 
 
 		 136 aa  158  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0488  response regulator receiver  58.87 
 
 		 136 aa  158  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3089  response regulator receiver protein  55.91 
 
 		 133 aa  157  9e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22915 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1017  response regulator receiver protein  56.35 
 
 		 138 aa  155  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88924  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0893  response regulator receiver protein  56.35 
 
 		 138 aa  155  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.605635  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5308  response regulator receiver domain-containing protein  59.02 
 
 		 134 aa  155  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0630269  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  57.26 
 
 		 130 aa  154  6e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2101  response regulator receiver domain-containing protein  59.13 
 
 		 125 aa  154  8e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1818  two component reponse regulator  59.13 
 
 		 125 aa  153  9e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3634  response regulator receiver domain-containing protein  58.26 
 
 		 131 aa  153  9e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.185946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0472  response regulator receiver protein  56.69 
 
 		 133 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01602  type IV pilus response regulator PilG  60.18 
 
 		 117 aa  153  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2400  response regulator receiver protein  55.38 
 
 		 135 aa  152  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.726464 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05320  twitching motility protein PilG  58.26 
 
 		 135 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0508  twitching motility protein PilG  58.26 
 
 		 135 aa  151  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  55.04 
 
 		 137 aa  151  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2159  response regulator receiver protein  57.39 
 
 		 129 aa  151  5e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0403  response regulator receiver protein  58.26 
 
 		 135 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  55.12 
 
 		 133 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  55.12 
 
 		 133 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  58.26 
 
 		 132 aa  150  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5042  response regulator receiver protein  57.14 
 
 		 133 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03180  type IV pili response regulator, PilG  54.33 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392248  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0987  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 414 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0723  response regulator receiver protein  42.2 
 
 		 405 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0752  response regulator receiver protein  42.99 
 
 		 405 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3249  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 405 aa  103  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0509  response regulator receiver domain-containing protein  38.93 
 
 		 412 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  38.79 
 
 		 2301 aa  102  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  37.07 
 
 		 2458 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  37.07 
 
 		 2476 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 121 aa  101  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 121 aa  101  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  42.2 
 
 		 2092 aa  100  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 		 1758 aa  99.4  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  39.34 
 
 		 2070 aa  99.4  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  37.93 
 
 		 2284 aa  99  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 1629 aa  99  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 		 2164 aa  98.2  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 123 aa  98.2  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  37.29 
 
 		 2336 aa  97.8  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 		 1974 aa  97.4  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  43.22 
 
 		 1012 aa  97.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  33.79 
 
 		 1989 aa  97.4  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 1647 aa  97.4  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 1646 aa  97.1  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 		 566 aa  97.4  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 1646 aa  97.1  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 		 2539 aa  96.7  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 121 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  35.61 
 
 		 1834 aa  96.7  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  40.37 
 
 		 1866 aa  96.3  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 2423 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3535  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 134 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.283754  normal  0.0368978 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  40.16 
 
 		 255 aa  96.3  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 2012 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 1832 aa  95.5  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0843  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 122 aa  95.5  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.774989  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 2009 aa  95.5  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 2137 aa  95.5  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 122 aa  95.9  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0855  response regulator receiver domain-containing protein  35.07 
 
 		 417 aa  95.5  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541919 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2999  response regulator receiver protein  38.53 
 
 		 421 aa  95.5  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 122 aa  95.9  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 		 1907 aa  95.1  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 		 2022 aa  95.1  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0323  two component transcriptional regulator  40.91 
 
 		 227 aa  95.1  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1476  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 453 aa  94.7  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.832694  normal  0.439282 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  32.64 
 
 		 1956 aa  94.7  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 125 aa  94.7  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.54 
 
 		 1960 aa  94.4  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  37.69 
 
 		 231 aa  94.4  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  38.4 
 
 		 230 aa  94.4  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  38.4 
 
 		 230 aa  94.4  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  41.88 
 
 		 970 aa  94.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  38.4 
 
 		 230 aa  94.4  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1568  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 476 aa  94.4  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 121 aa  94.4  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4057  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 396 aa  94  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>