More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3249 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3249  response regulator receiver protein  100 
 
 		 405 aa  834    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2999  response regulator receiver protein  51.73 
 
 		 421 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0723  response regulator receiver protein  49.87 
 
 		 405 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0752  response regulator receiver protein  49.12 
 
 		 405 aa  363  4e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0509  response regulator receiver domain-containing protein  44.61 
 
 		 412 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3748  response regulator receiver protein  35.37 
 
 		 393 aa  243  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2781  response regulator receiver protein  28.61 
 
 		 399 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3336  response regulator receiver protein  28.61 
 
 		 399 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2790  response regulator receiver protein  29.63 
 
 		 398 aa  176  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1061  response regulator receiver protein  29.49 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.609626  hitchhiker  0.0000494803 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4742  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 382 aa  156  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  hitchhiker  0.00408649 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3775  response regulator receiver domain-containing protein  26.76 
 
 		 394 aa  155  9e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0963043 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1421  response regulator receiver protein  28.9 
 
 		 384 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0650838  normal  0.210106 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0855  response regulator receiver domain-containing protein  28.42 
 
 		 417 aa  154  4e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541919 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0987  response regulator receiver protein  27.2 
 
 		 414 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0608  response regulator receiver protein  25.94 
 
 		 398 aa  146  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0058  response regulator receiver domain-containing protein  27.2 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.259686  normal  0.253815 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0413  response regulator receiver protein  26.89 
 
 		 347 aa  134  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2801  response regulator receiver protein  24.71 
 
 		 417 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0414738  normal  0.24206 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3316  response regulator receiver protein  24.71 
 
 		 417 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1102  response regulator receiver domain-containing protein  24.77 
 
 		 457 aa  123  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4057  response regulator receiver protein  23.01 
 
 		 396 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4606  response regulator receiver protein  27.56 
 
 		 408 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4019  response regulator receiver protein  23.01 
 
 		 396 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0718  response regulator receiver protein  27.72 
 
 		 388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2923  response regulator receiver domain-containing protein  25.53 
 
 		 381 aa  116  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0474804 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  41.09 
 
 		 161 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0612  response regulator receiver protein  40.62 
 
 		 152 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0560  response regulator receiver protein  40.62 
 
 		 165 aa  114  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03180  type IV pili response regulator, PilG  41.6 
 
 		 135 aa  113  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392248  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 130 aa  113  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2400  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 135 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.726464 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5034  type IV pilus response regulator PilG  40 
 
 		 136 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0488  response regulator receiver  40 
 
 		 136 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4868  response regulator receiver protein  40.15 
 
 		 143 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3634  response regulator receiver domain-containing protein  41.03 
 
 		 131 aa  111  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.185946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05320  twitching motility protein PilG  39.2 
 
 		 135 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0508  twitching motility protein PilG  39.2 
 
 		 135 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3491  response regulator receiver protein  24.59 
 
 		 345 aa  110  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0403  response regulator receiver protein  39.2 
 
 		 135 aa  110  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  41.94 
 
 		 160 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5308  response regulator receiver domain-containing protein  39.23 
 
 		 134 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0630269  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0893  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 138 aa  108  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.605635  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1017  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 138 aa  108  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88924  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0761  response regulator receiver protein  24.63 
 
 		 423 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 137 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  42.24 
 
 		 132 aa  106  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0787  response regulator receiver protein  24.63 
 
 		 423 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1818  two component reponse regulator  40.52 
 
 		 125 aa  105  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3138  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 455 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3089  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 133 aa  105  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22915 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2159  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 129 aa  105  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0901  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 136 aa  105  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3354  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 147 aa  104  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878811  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0668  twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  35.51 
 
 		 179 aa  104  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3021  response regulator receiver protein  39.06 
 
 		 144 aa  104  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.381292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1572  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 132 aa  104  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1371  response regulator receiver domain-containing protein  40.52 
 
 		 132 aa  104  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.019268  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1136  response regulator receiver domain-containing protein  41.74 
 
 		 132 aa  104  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2101  response regulator receiver domain-containing protein  39.66 
 
 		 125 aa  104  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 132 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01602  type IV pilus response regulator PilG  39.82 
 
 		 117 aa  103  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2901  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 130 aa  103  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191122  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3578  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 130 aa  103  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.677729  normal  0.0425656 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 133 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0669  response regulator receiver domain-containing protein  39.32 
 
 		 167 aa  103  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00304574  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3971  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 145 aa  103  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 133 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3774  response regulator receiver protein  44.23 
 
 		 123 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5042  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 133 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0472  response regulator receiver protein  36.22 
 
 		 133 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2552  response regulator receiver domain-containing protein  38.33 
 
 		 130 aa  101  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3190  twitching motility, CheY-like protein  40.52 
 
 		 141 aa  101  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3899  response regulator receiver  37.5 
 
 		 136 aa  99  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4284  response regulator receiver protein  22.55 
 
 		 391 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 138 aa  97.1  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4344  response regulator receiver protein  22.67 
 
 		 391 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0880263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3688  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 133 aa  94.4  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478813  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 1758 aa  89  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 2539 aa  87.4  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 1609 aa  87  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 1907 aa  87  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0988  response regulator receiver protein  24.07 
 
 		 417 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.331078 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.6 
 
 		 232 aa  86.7  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03422  hypothetical protein  37.29 
 
 		 1128 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.75 
 
 		 1131 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 576 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 		 1559 aa  84.7  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  38.18 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0468  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.42 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  36.75 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5381  two component transcriptional regulator, winged helix family  35 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0242785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 1832 aa  84  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1040  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 365 aa  84.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5086  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.74 
 
 		 465 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002587  chitin catabolic cascade sensor histidine kinase ChiS  37.29 
 
 		 1111 aa  83.2  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  36 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.4 
 
 		 310 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 229 aa  82.4  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>