More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2623 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  100 
 
 		 160 aa  325  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0669  response regulator receiver domain-containing protein  73.72 
 
 		 167 aa  229  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00304574  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0560  response regulator receiver protein  70.34 
 
 		 165 aa  208  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0612  response regulator receiver protein  70.34 
 
 		 152 aa  208  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296044  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0668  twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  69.23 
 
 		 179 aa  204  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3354  response regulator receiver protein  63.43 
 
 		 147 aa  192  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3190  twitching motility, CheY-like protein  64.44 
 
 		 141 aa  192  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3899  response regulator receiver  70.63 
 
 		 136 aa  188  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1136  response regulator receiver domain-containing protein  68.91 
 
 		 132 aa  189  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1371  response regulator receiver domain-containing protein  68.33 
 
 		 132 aa  186  8e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.019268  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3971  response regulator receiver protein  75.22 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  69.49 
 
 		 132 aa  182  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2901  response regulator receiver protein  70.18 
 
 		 130 aa  180  9.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191122  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0901  response regulator receiver protein  66.1 
 
 		 136 aa  178  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1572  response regulator receiver protein  69.3 
 
 		 132 aa  179  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3688  response regulator receiver protein  71.68 
 
 		 133 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478813  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3578  response regulator receiver protein  69.3 
 
 		 130 aa  177  5.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.677729  normal  0.0425656 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3021  response regulator receiver protein  69.03 
 
 		 144 aa  176  8e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.381292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2552  response regulator receiver domain-containing protein  64 
 
 		 130 aa  175  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  66.67 
 
 		 138 aa  168  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  57.55 
 
 		 161 aa  164  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5308  response regulator receiver domain-containing protein  58.78 
 
 		 134 aa  163  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0630269  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5034  type IV pilus response regulator PilG  59.35 
 
 		 136 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0488  response regulator receiver  59.35 
 
 		 136 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3089  response regulator receiver protein  63.48 
 
 		 133 aa  162  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22915 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2400  response regulator receiver protein  62.28 
 
 		 135 aa  159  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.726464 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05320  twitching motility protein PilG  55.56 
 
 		 135 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1818  two component reponse regulator  61.4 
 
 		 125 aa  158  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  56.78 
 
 		 130 aa  159  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2101  response regulator receiver domain-containing protein  61.4 
 
 		 125 aa  158  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0508  twitching motility protein PilG  58.47 
 
 		 135 aa  158  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1017  response regulator receiver protein  61.74 
 
 		 138 aa  157  4e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88924  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0403  response regulator receiver protein  58.47 
 
 		 135 aa  157  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0893  response regulator receiver protein  61.74 
 
 		 138 aa  157  4e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.605635  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  62.28 
 
 		 137 aa  156  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01602  type IV pilus response regulator PilG  61.95 
 
 		 117 aa  156  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  61.95 
 
 		 132 aa  156  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0472  response regulator receiver protein  58.2 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3634  response regulator receiver domain-containing protein  59.13 
 
 		 131 aa  155  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.185946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2159  response regulator receiver protein  59.65 
 
 		 129 aa  154  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  57.38 
 
 		 133 aa  154  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  57.38 
 
 		 133 aa  154  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5042  response regulator receiver protein  57.85 
 
 		 133 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03180  type IV pili response regulator, PilG  58.47 
 
 		 135 aa  152  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392248  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0723  response regulator receiver protein  42.73 
 
 		 405 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0752  response regulator receiver protein  43.12 
 
 		 405 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3249  response regulator receiver protein  41.94 
 
 		 405 aa  109  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  40 
 
 		 2301 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0987  response regulator receiver protein  34.97 
 
 		 414 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0509  response regulator receiver domain-containing protein  38.41 
 
 		 412 aa  104  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  39.17 
 
 		 2284 aa  103  7e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 		 1629 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  36.13 
 
 		 2458 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  36.13 
 
 		 2476 aa  101  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2999  response regulator receiver protein  40.37 
 
 		 421 aa  101  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 		 1646 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 		 1646 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  45.05 
 
 		 255 aa  100  7e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  37.5 
 
 		 2336 aa  100  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 1647 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0058  response regulator receiver domain-containing protein  36.23 
 
 		 347 aa  99.4  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.259686  normal  0.253815 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  40.5 
 
 		 1758 aa  99.4  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  38.31 
 
 		 970 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0855  response regulator receiver domain-containing protein  36.59 
 
 		 417 aa  98.2  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541919 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 2423 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  39.1 
 
 		 243 aa  98.2  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 123 aa  97.8  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 121 aa  97.8  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.52 
 
 		 237 aa  97.4  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 125 aa  97.1  8e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.71 
 
 		 236 aa  97.4  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  37.29 
 
 		 1834 aa  97.1  9e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 121 aa  97.1  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  36.51 
 
 		 235 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 2212 aa  96.7  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1777  metal dependent phosphohydrolase, HD region with response regulator receiver modulation  40.5 
 
 		 414 aa  96.3  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  36.51 
 
 		 235 aa  96.3  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 1832 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 		 2539 aa  97.1  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  36.51 
 
 		 235 aa  96.3  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  36.51 
 
 		 235 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 		 2137 aa  95.9  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  36.51 
 
 		 235 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  36.51 
 
 		 235 aa  95.9  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  36.51 
 
 		 235 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  39.29 
 
 		 1866 aa  95.9  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 		 1974 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35 
 
 		 1971 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  36.51 
 
 		 235 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1061  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 427 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.609626  hitchhiker  0.0000494803 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  36.51 
 
 		 235 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4742  response regulator receiver protein  37.6 
 
 		 382 aa  96.3  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  hitchhiker  0.00408649 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  36.51 
 
 		 235 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  36.29 
 
 		 1989 aa  95.5  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  41.88 
 
 		 246 aa  95.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  35.71 
 
 		 235 aa  95.5  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 121 aa  95.5  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01511  two-component response regulator  39.2 
 
 		 248 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>