More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1102 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1102  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 
457 aa  943    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3138  response regulator receiver protein  58.03 
 
 
455 aa  544  1e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1061  response regulator receiver protein  41.09 
 
 
427 aa  346  4e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.609626  hitchhiker  0.0000494803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0987  response regulator receiver protein  38.63 
 
 
414 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0855  response regulator receiver domain-containing protein  36.78 
 
 
417 aa  291  1e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541919 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4606  response regulator receiver protein  29.65 
 
 
408 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0058  response regulator receiver domain-containing protein  52.17 
 
 
347 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.259686  normal  0.253815 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0413  response regulator receiver protein  54.47 
 
 
347 aa  155  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2923  response regulator receiver domain-containing protein  45.21 
 
 
381 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0474804 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3491  response regulator receiver protein  45.9 
 
 
345 aa  125  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3249  response regulator receiver protein  24.77 
 
 
405 aa  123  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4742  response regulator receiver protein  38.74 
 
 
382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  hitchhiker  0.00408649 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2790  response regulator receiver protein  43.97 
 
 
398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  40 
 
 
161 aa  111  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0787  response regulator receiver protein  38.93 
 
 
423 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0761  response regulator receiver protein  38.93 
 
 
423 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  41.03 
 
 
137 aa  110  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  43.1 
 
 
132 aa  108  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4868  response regulator receiver protein  34.62 
 
 
143 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3634  response regulator receiver domain-containing protein  40.17 
 
 
131 aa  104  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.185946  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3971  response regulator receiver protein  37.88 
 
 
145 aa  104  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5042  response regulator receiver protein  40 
 
 
133 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  40 
 
 
133 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  40 
 
 
133 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2999  response regulator receiver protein  40.68 
 
 
421 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0901  response regulator receiver protein  38.4 
 
 
136 aa  103  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01602  type IV pilus response regulator PilG  42.2 
 
 
117 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0723  response regulator receiver protein  43.27 
 
 
405 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0472  response regulator receiver protein  39.17 
 
 
133 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3089  response regulator receiver protein  41.82 
 
 
133 aa  102  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.22915 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0752  response regulator receiver protein  38.4 
 
 
405 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26894  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1017  response regulator receiver protein  41.59 
 
 
138 aa  101  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88924  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  40.35 
 
 
132 aa  101  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0893  response regulator receiver protein  41.59 
 
 
138 aa  101  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.605635  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3190  twitching motility, CheY-like protein  38.02 
 
 
141 aa  101  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3578  response regulator receiver protein  38.52 
 
 
130 aa  100  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.677729  normal  0.0425656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0608  response regulator receiver protein  42.75 
 
 
398 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2901  response regulator receiver protein  38.52 
 
 
130 aa  100  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191122  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2781  response regulator receiver protein  39.66 
 
 
399 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5308  response regulator receiver domain-containing protein  39.32 
 
 
134 aa  100  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0630269  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3336  response regulator receiver protein  39.66 
 
 
399 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2552  response regulator receiver domain-containing protein  38.79 
 
 
130 aa  100  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2159  response regulator receiver protein  39.66 
 
 
129 aa  100  6e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  41.03 
 
 
130 aa  100  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3688  response regulator receiver protein  39.66 
 
 
133 aa  99.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478813  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  40.52 
 
 
138 aa  98.6  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0508  twitching motility protein PilG  40.17 
 
 
135 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05320  twitching motility protein PilG  40.17 
 
 
135 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1371  response regulator receiver domain-containing protein  37.82 
 
 
132 aa  98.2  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.019268  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4019  response regulator receiver protein  40.18 
 
 
396 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0403  response regulator receiver protein  40.17 
 
 
135 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4057  response regulator receiver protein  40.18 
 
 
396 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1818  two component reponse regulator  38.05 
 
 
125 aa  97.4  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2101  response regulator receiver domain-containing protein  38.05 
 
 
125 aa  97.4  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3021  response regulator receiver protein  37.61 
 
 
144 aa  97.8  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.381292  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5034  type IV pilus response regulator PilG  38.46 
 
 
136 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0488  response regulator receiver  38.46 
 
 
136 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4284  response regulator receiver protein  35.51 
 
 
391 aa  96.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3775  response regulator receiver domain-containing protein  37.69 
 
 
394 aa  96.7  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0963043 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4344  response regulator receiver protein  35.51 
 
 
391 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0880263  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2400  response regulator receiver protein  39.82 
 
 
135 aa  96.3  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.726464 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1136  response regulator receiver domain-containing protein  38.94 
 
 
132 aa  95.9  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3354  response regulator receiver protein  38.94 
 
 
147 aa  95.9  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878811  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03180  type IV pili response regulator, PilG  39.32 
 
 
135 aa  95.9  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392248  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0509  response regulator receiver domain-containing protein  22.38 
 
 
412 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75217  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1572  response regulator receiver protein  38.05 
 
 
132 aa  95.1  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0718  response regulator receiver protein  37.61 
 
 
388 aa  94.7  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3899  response regulator receiver  38.94 
 
 
136 aa  94.4  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 
2539 aa  93.6  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3774  response regulator receiver protein  38.61 
 
 
123 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.66 
 
 
337 aa  90.5  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0668  twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  33.33 
 
 
179 aa  90.1  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  36.28 
 
 
160 aa  89.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3139  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.9 
 
 
676 aa  89.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.990746 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0560  response regulator receiver protein  35.04 
 
 
165 aa  89  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1421  response regulator receiver protein  32.06 
 
 
384 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0650838  normal  0.210106 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6548  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 
397 aa  87  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.543575 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  43.12 
 
 
1974 aa  86.7  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3359  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
395 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361398  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1240  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.03 
 
 
227 aa  85.5  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  37.07 
 
 
1177 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
437 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0612  response regulator receiver protein  35.04 
 
 
152 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296044  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2743  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
395 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 
566 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  36.59 
 
 
2336 aa  84.7  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0669  response regulator receiver domain-containing protein  35.4 
 
 
167 aa  84.7  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00304574  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 
541 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  40 
 
 
239 aa  84  0.000000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  36.3 
 
 
256 aa  84  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 
2212 aa  83.2  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  36.28 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0522  response regulator receiver domain-containing protein  35.4 
 
 
120 aa  83.2  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  38.35 
 
 
2301 aa  83.2  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2002  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.29 
 
 
306 aa  82.8  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03422  hypothetical protein  38.94 
 
 
1128 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  37.17 
 
 
1127 aa  82.4  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1826  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 
363 aa  82  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  36.28 
 
 
123 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  39.09 
 
 
229 aa  82.4  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>