More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4606 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4606  response regulator receiver protein  100 
 
 		 408 aa  832    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0987  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 414 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1061  response regulator receiver protein  29.76 
 
 		 427 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.609626  hitchhiker  0.0000494803 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0855  response regulator receiver domain-containing protein  31.8 
 
 		 417 aa  190  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541919 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1102  response regulator receiver domain-containing protein  29.65 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3138  response regulator receiver protein  28.51 
 
 		 455 aa  164  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3249  response regulator receiver protein  27.56 
 
 		 405 aa  120  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0509  response regulator receiver domain-containing protein  25.71 
 
 		 412 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2923  response regulator receiver domain-containing protein  24.33 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0474804 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0723  response regulator receiver protein  26.58 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0752  response regulator receiver protein  26.58 
 
 		 405 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0058  response regulator receiver domain-containing protein  36.21 
 
 		 347 aa  97.8  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.259686  normal  0.253815 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0413  response regulator receiver protein  34.87 
 
 		 347 aa  95.9  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2999  response regulator receiver protein  24.93 
 
 		 421 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2790  response regulator receiver protein  24.29 
 
 		 398 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3491  response regulator receiver protein  31.78 
 
 		 345 aa  87.4  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4868  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 143 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4284  response regulator receiver protein  25.38 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4344  response regulator receiver protein  25.38 
 
 		 391 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0880263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2781  response regulator receiver protein  23.91 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3336  response regulator receiver protein  23.91 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3775  response regulator receiver domain-containing protein  26.36 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0963043 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1421  response regulator receiver protein  22.51 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0650838  normal  0.210106 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2801  response regulator receiver protein  22.94 
 
 		 417 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0414738  normal  0.24206 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3316  response regulator receiver protein  22.94 
 
 		 417 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2657  response regulator receiver  32.74 
 
 		 121 aa  75.1  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  0.494085 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  32.5 
 
 		 121 aa  73.6  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0787  response regulator receiver protein  27.73 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0608  response regulator receiver protein  24.31 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0560  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0472  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  28.68 
 
 		 2284 aa  73.2  0.000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0612  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 152 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  31.62 
 
 		 160 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 		 374 aa  72.8  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 161 aa  72.4  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 133 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 		 369 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.847548  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0761  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4742  response regulator receiver protein  28.68 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  hitchhiker  0.00408649 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  34.17 
 
 		 132 aa  72.4  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 133 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  34.48 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  35 
 
 		 121 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5308  response regulator receiver domain-containing protein  32.52 
 
 		 134 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0630269  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  28.7 
 
 		 120 aa  71.2  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 1002 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3089  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 133 aa  70.9  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22915 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 121 aa  70.9  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  34.48 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0905  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000245258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.73 
 
 		 870 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3971  response regulator receiver protein  29.91 
 
 		 145 aa  70.5  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2960  response regulator receiver  27.87 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0852903  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1136  response regulator receiver domain-containing protein  30.77 
 
 		 132 aa  70.5  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2400  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 135 aa  70.5  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.726464 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  30.17 
 
 		 132 aa  70.5  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5042  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0718  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  28.68 
 
 		 2301 aa  69.7  0.00000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  32.48 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0508  twitching motility protein PilG  32.77 
 
 		 135 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1392  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.75 
 
 		 584 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 235 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1371  response regulator receiver domain-containing protein  28.93 
 
 		 132 aa  69.3  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.019268  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0669  response regulator receiver domain-containing protein  31.36 
 
 		 167 aa  69.3  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00304574  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0403  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 135 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05320  twitching motility protein PilG  32.77 
 
 		 135 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 121 aa  68.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5034  type IV pilus response regulator PilG  33.33 
 
 		 136 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0488  response regulator receiver  33.33 
 
 		 136 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3813  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28 
 
 		 963 aa  68.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000539796  normal  0.0501343 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2552  response regulator receiver domain-containing protein  28.23 
 
 		 130 aa  68.6  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3634  response regulator receiver domain-containing protein  31.86 
 
 		 131 aa  68.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.185946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  31.3 
 
 		 121 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3354  response regulator receiver protein  30.97 
 
 		 147 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878811  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0668  twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  28.39 
 
 		 179 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1798  response regulator receiver protein  27.97 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0425033  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  28.21 
 
 		 138 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 121 aa  68.2  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3105  DNA-binding response regulator PhoB  29.41 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1017  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 138 aa  67.8  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88924  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01602  type IV pilus response regulator PilG  31.03 
 
 		 117 aa  67.8  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0893  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 138 aa  67.8  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.605635  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  31.3 
 
 		 125 aa  67  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 1758 aa  67.4  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.17 
 
 		 1514 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.17 
 
 		 1514 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0713  response regulator receiver protein  27.59 
 
 		 321 aa  67  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2046  response regulator  27.35 
 
 		 404 aa  67  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1818  two component reponse regulator  30.17 
 
 		 125 aa  67  0.0000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  30 
 
 		 121 aa  67  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4057  response regulator receiver protein  25.6 
 
 		 396 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2746  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.33 
 
 		 1096 aa  67  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.455726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4019  response regulator receiver protein  25.6 
 
 		 396 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 2212 aa  66.6  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 566 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  31.3 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>