More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0608 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0608  response regulator receiver protein  100 
 
 		 398 aa  817    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3775  response regulator receiver domain-containing protein  36.91 
 
 		 394 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0963043 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2781  response regulator receiver protein  34.59 
 
 		 399 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3336  response regulator receiver protein  34.59 
 
 		 399 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2790  response regulator receiver protein  34.69 
 
 		 398 aa  229  7e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4019  response regulator receiver protein  32.61 
 
 		 396 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1421  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 384 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0650838  normal  0.210106 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4057  response regulator receiver protein  32.61 
 
 		 396 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2801  response regulator receiver protein  30.75 
 
 		 417 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0414738  normal  0.24206 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3316  response regulator receiver protein  30.75 
 
 		 417 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3249  response regulator receiver protein  25.94 
 
 		 405 aa  146  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0787  response regulator receiver protein  28.3 
 
 		 423 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0761  response regulator receiver protein  28.06 
 
 		 423 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2999  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 421 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0723  response regulator receiver protein  27.92 
 
 		 405 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0752  response regulator receiver protein  27.64 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0718  response regulator receiver protein  29.97 
 
 		 388 aa  140  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0509  response regulator receiver domain-containing protein  24.87 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0988  response regulator receiver protein  26.59 
 
 		 417 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.331078 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0987  response regulator receiver protein  27.14 
 
 		 414 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1061  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.609626  hitchhiker  0.0000494803 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4742  response regulator receiver protein  27.97 
 
 		 382 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  hitchhiker  0.00408649 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3774  response regulator receiver protein  50.49 
 
 		 123 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0058  response regulator receiver domain-containing protein  40.31 
 
 		 347 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.259686  normal  0.253815 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3138  response regulator receiver protein  41.61 
 
 		 455 aa  112  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0855  response regulator receiver domain-containing protein  31.33 
 
 		 417 aa  110  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541919 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0413  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 347 aa  110  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4868  response regulator receiver protein  36.15 
 
 		 143 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1102  response regulator receiver domain-containing protein  42.75 
 
 		 457 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3491  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 345 aa  99.8  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  35.42 
 
 		 161 aa  96.7  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2923  response regulator receiver domain-containing protein  38.39 
 
 		 381 aa  95.5  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0474804 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 130 aa  95.1  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3748  response regulator receiver protein  22.16 
 
 		 393 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 137 aa  94.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  35.59 
 
 		 132 aa  94  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 138 aa  93.2  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4284  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 391 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4344  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 391 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0880263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 132 aa  92.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2552  response regulator receiver domain-containing protein  34.78 
 
 		 130 aa  91.3  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0809  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 367 aa  92  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3089  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 133 aa  91.7  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22915 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01602  type IV pilus response regulator PilG  33.62 
 
 		 117 aa  91.7  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0669  response regulator receiver domain-containing protein  35.59 
 
 		 167 aa  92  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00304574  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0508  twitching motility protein PilG  34.15 
 
 		 135 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0612  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 152 aa  90.5  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3634  response regulator receiver domain-containing protein  32.23 
 
 		 131 aa  90.5  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.185946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0893  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 138 aa  90.5  5e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.605635  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1017  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 138 aa  90.5  5e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88924  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05320  twitching motility protein PilG  34.15 
 
 		 135 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  31.65 
 
 		 160 aa  90.1  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3190  twitching motility, CheY-like protein  32.59 
 
 		 141 aa  89.7  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0403  response regulator receiver protein  32.8 
 
 		 135 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0560  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 165 aa  89.7  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.25 
 
 		 231 aa  89.7  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5086  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.59 
 
 		 465 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1371  response regulator receiver domain-containing protein  34.78 
 
 		 132 aa  89  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.019268  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3354  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 147 aa  89  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1572  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 132 aa  88.6  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1818  two component reponse regulator  33.04 
 
 		 125 aa  88.6  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3578  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 130 aa  88.6  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.677729  normal  0.0425656 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2901  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 130 aa  88.6  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191122  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0901  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 136 aa  88.2  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2101  response regulator receiver domain-containing protein  33.04 
 
 		 125 aa  89  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2400  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 135 aa  88.2  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.726464 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3021  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 144 aa  87.8  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.381292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03422  hypothetical protein  35.9 
 
 		 1128 aa  88.2  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1136  response regulator receiver domain-containing protein  35.4 
 
 		 132 aa  87.8  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3899  response regulator receiver  34.78 
 
 		 136 aa  87.4  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4602  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  37.9 
 
 		 396 aa  87.4  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  35.34 
 
 		 227 aa  87.4  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 503 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3971  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 145 aa  86.3  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5034  type IV pilus response regulator PilG  31.9 
 
 		 136 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  33.08 
 
 		 1127 aa  85.5  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0488  response regulator receiver  31.9 
 
 		 136 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3553  response regulator receiver  37.88 
 
 		 384 aa  85.9  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 437 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002587  chitin catabolic cascade sensor histidine kinase ChiS  33.33 
 
 		 1111 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3688  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 133 aa  86.3  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478813  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0629  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.5 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1777  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.04 
 
 		 226 aa  85.1  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0722021  normal  0.591414 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3634  two component transcriptional regulator  34.38 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.966844 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4328  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 612 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4473  two component transcriptional regulator  34.38 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3893  two component transcriptional regulator  34.38 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.09 
 
 		 1322 aa  85.1  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  27.87 
 
 		 133 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0668  twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  32.76 
 
 		 179 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.46 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.43 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5308  response regulator receiver domain-containing protein  32.52 
 
 		 134 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0630269  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  33.06 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00878  two-component response regulator  33.88 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0871  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.5 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2977  response regulator receiver domain-containing protein  33.61 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.13601 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2984  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  33.88 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.43543  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  27.87 
 
 		 133 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.07 
 
 		 823 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>