More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3316 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3316  response regulator receiver protein  100 
 
 		 417 aa  864    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2801  response regulator receiver protein  100 
 
 		 417 aa  864    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0414738  normal  0.24206 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3336  response regulator receiver protein  39.45 
 
 		 399 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2781  response regulator receiver protein  39.45 
 
 		 399 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2790  response regulator receiver protein  40.2 
 
 		 398 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0988  response regulator receiver protein  33.17 
 
 		 417 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.331078 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3775  response regulator receiver domain-containing protein  33.78 
 
 		 394 aa  239  4e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0963043 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1421  response regulator receiver protein  30.22 
 
 		 384 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0650838  normal  0.210106 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4019  response regulator receiver protein  31.73 
 
 		 396 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4057  response regulator receiver protein  31.73 
 
 		 396 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0608  response regulator receiver protein  30.75 
 
 		 398 aa  173  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0718  response regulator receiver protein  28.02 
 
 		 388 aa  150  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3249  response regulator receiver protein  24.71 
 
 		 405 aa  126  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2999  response regulator receiver protein  24.19 
 
 		 421 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0509  response regulator receiver domain-containing protein  24.57 
 
 		 412 aa  109  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0787  response regulator receiver protein  22.14 
 
 		 423 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0723  response regulator receiver protein  23.86 
 
 		 405 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0752  response regulator receiver protein  23.89 
 
 		 405 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0761  response regulator receiver protein  21.62 
 
 		 423 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1061  response regulator receiver protein  25.19 
 
 		 427 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.609626  hitchhiker  0.0000494803 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0855  response regulator receiver domain-containing protein  27.63 
 
 		 417 aa  86.3  8e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541919 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4284  response regulator receiver protein  21.68 
 
 		 391 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3138  response regulator receiver protein  21.9 
 
 		 455 aa  82.8  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4344  response regulator receiver protein  21.68 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0880263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4742  response regulator receiver protein  22.69 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  hitchhiker  0.00408649 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3748  response regulator receiver protein  22.08 
 
 		 393 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0987  response regulator receiver protein  22.81 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4606  response regulator receiver protein  22.94 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4868  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 143 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3774  response regulator receiver protein  30.1 
 
 		 123 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2923  response regulator receiver domain-containing protein  27.59 
 
 		 381 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0474804 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  26.62 
 
 		 1127 aa  62  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  25.95 
 
 		 132 aa  62  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2746  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.23 
 
 		 1096 aa  61.6  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.455726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2068  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.14 
 
 		 948 aa  60.8  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.53 
 
 		 1261 aa  60.5  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1830  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.07 
 
 		 941 aa  60.1  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2299  response regulator receiver protein  25.22 
 
 		 275 aa  59.7  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0218685  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2960  response regulator receiver  23.57 
 
 		 190 aa  59.7  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0852903  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.56 
 
 		 784 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  24.79 
 
 		 161 aa  59.3  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  25.62 
 
 		 1177 aa  58.9  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3491  response regulator receiver protein  23.81 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1865  response regulator receiver protein  25 
 
 		 123 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.111325  normal  0.212824 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0978  response regulator receiver protein  28 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000299391  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2174  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.73 
 
 		 633 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.634157  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0186  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.95 
 
 		 657 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00908915 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.98 
 
 		 764 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.736998  normal  0.0891785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0058  response regulator receiver domain-containing protein  25 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.259686  normal  0.253815 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0372  response regulator receiver protein  25.81 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.463682  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4374  response regulator receiver protein  27.43 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.45297 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.21 
 
 		 224 aa  57  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2540  two component transcriptional regulator  26.72 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0258785  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0423  response regulator receiver protein  24.58 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.89687 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  23.89 
 
 		 124 aa  55.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  30.69 
 
 		 373 aa  55.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1124  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.61 
 
 		 502 aa  55.8  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.963767  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1250  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.7 
 
 		 936 aa  55.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2281  response regulator receiver protein  22.39 
 
 		 280 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.217898  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1942  response regulator receiver protein  22.39 
 
 		 280 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  22.88 
 
 		 123 aa  55.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00475  two-component system sensor histidine kinase-response regulator hybridprotein  25.83 
 
 		 1364 aa  55.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679058  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2528  two component transcriptional regulator, LuxR family  23.39 
 
 		 201 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0341229 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4984  two component transcriptional regulator, LuxR family  23.39 
 
 		 201 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0145131 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  23.73 
 
 		 126 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0042  response regulator  27.68 
 
 		 240 aa  55.5  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.382747  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.48 
 
 		 781 aa  55.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  30.17 
 
 		 125 aa  55.1  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  23.73 
 
 		 126 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1352  response regulator receiver protein  27.05 
 
 		 410 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  23.73 
 
 		 126 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0717  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.72 
 
 		 641 aa  55.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.3 
 
 		 228 aa  55.5  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.39 
 
 		 1977 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0713  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 321 aa  55.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0966  response regulator receiver  23.73 
 
 		 126 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.734958  normal  0.0218415 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  25.62 
 
 		 123 aa  55.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03422  hypothetical protein  25.41 
 
 		 1128 aa  54.7  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002587  chitin catabolic cascade sensor histidine kinase ChiS  25.41 
 
 		 1111 aa  55.1  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3127  response regulator receiver protein  27.2 
 
 		 283 aa  55.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5034  type IV pilus response regulator PilG  27.73 
 
 		 136 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  23.97 
 
 		 137 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0488  response regulator receiver  27.73 
 
 		 136 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1135  response regulator receiver protein  26.06 
 
 		 283 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0903  cell division response regulator DivK  21.85 
 
 		 121 aa  54.7  0.000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.91869  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5308  response regulator receiver domain-containing protein  26.89 
 
 		 134 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0630269  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1798  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0425033  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  25.86 
 
 		 130 aa  54.7  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2818  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.19 
 
 		 720 aa  54.7  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.215558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2754  DNA-binding response regulator  25.86 
 
 		 235 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000477477 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0472  response regulator receiver protein  27.43 
 
 		 133 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.8 
 
 		 770 aa  54.3  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0508  twitching motility protein PilG  25.4 
 
 		 135 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2212  sensor histidine kinase/response regulator  28.47 
 
 		 641 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1732  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 122 aa  53.9  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2400  response regulator receiver protein  23.93 
 
 		 135 aa  53.9  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.726464 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0930  response regulator receiver protein  22.88 
 
 		 126 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.177566 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05320  twitching motility protein PilG  25.4 
 
 		 135 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2303  response regulator receiver protein  27.36 
 
 		 227 aa  53.9  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3226  Hpt sensor hybrid histidine kinase  24.06 
 
 		 1251 aa  53.9  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0796968  normal  0.806997 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>