More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1421 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1421  response regulator receiver protein  100 
 
 
384 aa  779    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0650838  normal  0.210106 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2790  response regulator receiver protein  44.93 
 
 
398 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3336  response regulator receiver protein  44.44 
 
 
399 aa  295  7e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2781  response regulator receiver protein  44.44 
 
 
399 aa  295  7e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3775  response regulator receiver domain-containing protein  34.83 
 
 
394 aa  251  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0963043 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4057  response regulator receiver protein  33.59 
 
 
396 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4019  response regulator receiver protein  33.59 
 
 
396 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0608  response regulator receiver protein  30.71 
 
 
398 aa  211  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2801  response regulator receiver protein  30.22 
 
 
417 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0414738  normal  0.24206 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3316  response regulator receiver protein  30.22 
 
 
417 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0988  response regulator receiver protein  31.52 
 
 
417 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.331078 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0718  response regulator receiver protein  30.75 
 
 
388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3249  response regulator receiver protein  28.9 
 
 
405 aa  154  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0723  response regulator receiver protein  29.65 
 
 
405 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0752  response regulator receiver protein  29.94 
 
 
405 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26894  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1061  response regulator receiver protein  28.16 
 
 
427 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.609626  hitchhiker  0.0000494803 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0855  response regulator receiver domain-containing protein  26.36 
 
 
417 aa  140  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541919 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0987  response regulator receiver protein  27.79 
 
 
414 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2999  response regulator receiver protein  27.45 
 
 
421 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0509  response regulator receiver domain-containing protein  27.17 
 
 
412 aa  126  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75217  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0761  response regulator receiver protein  26.56 
 
 
423 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0787  response regulator receiver protein  26.56 
 
 
423 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4742  response regulator receiver protein  40.38 
 
 
382 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  hitchhiker  0.00408649 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4868  response regulator receiver protein  41.67 
 
 
143 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3491  response regulator receiver protein  25.39 
 
 
345 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0058  response regulator receiver domain-containing protein  38.46 
 
 
347 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.259686  normal  0.253815 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2923  response regulator receiver domain-containing protein  23.57 
 
 
381 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0474804 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4344  response regulator receiver protein  37.5 
 
 
391 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0880263  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3774  response regulator receiver protein  43.52 
 
 
123 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4284  response regulator receiver protein  36.67 
 
 
391 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0413  response regulator receiver protein  35.54 
 
 
347 aa  100  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0472  response regulator receiver protein  33.06 
 
 
133 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  32.23 
 
 
133 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  32.23 
 
 
133 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  30.23 
 
 
132 aa  92.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5042  response regulator receiver protein  31.4 
 
 
133 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3138  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
455 aa  89.4  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0612  response regulator receiver protein  35.04 
 
 
152 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296044  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1102  response regulator receiver domain-containing protein  32.06 
 
 
457 aa  87.8  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0560  response regulator receiver protein  35.04 
 
 
165 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  27.87 
 
 
130 aa  85.9  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  30.94 
 
 
160 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5308  response regulator receiver domain-containing protein  28.45 
 
 
134 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0630269  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1371  response regulator receiver domain-containing protein  29.41 
 
 
132 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.019268  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0669  response regulator receiver domain-containing protein  35.09 
 
 
167 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00304574  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5034  type IV pilus response regulator PilG  28.45 
 
 
136 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0488  response regulator receiver  28.45 
 
 
136 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01602  type IV pilus response regulator PilG  29.2 
 
 
117 aa  83.6  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3354  response regulator receiver protein  32.76 
 
 
147 aa  83.6  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878811  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 
2026 aa  83.2  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0403  response regulator receiver protein  27.59 
 
 
135 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2159  response regulator receiver protein  29.57 
 
 
129 aa  83.2  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  32.56 
 
 
2026 aa  83.2  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3634  response regulator receiver domain-containing protein  26.56 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.185946  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3089  response regulator receiver protein  27.27 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.22915 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1818  two component reponse regulator  27.64 
 
 
125 aa  82  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1572  response regulator receiver protein  30.36 
 
 
132 aa  82.4  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 
2137 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  30.6 
 
 
1983 aa  82.8  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  27.19 
 
 
132 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03180  type IV pili response regulator, PilG  27.59 
 
 
135 aa  82  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392248  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0508  twitching motility protein PilG  27.59 
 
 
135 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2901  response regulator receiver protein  30.36 
 
 
130 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191122  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3578  response regulator receiver protein  30.36 
 
 
130 aa  82  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.677729  normal  0.0425656 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  27.19 
 
 
161 aa  81.6  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05320  twitching motility protein PilG  27.59 
 
 
135 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0668  twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  36.28 
 
 
179 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  30.95 
 
 
1888 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1136  response regulator receiver domain-containing protein  29.91 
 
 
132 aa  81.3  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  34.45 
 
 
125 aa  81.3  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0901  response regulator receiver protein  30.36 
 
 
136 aa  81.3  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1017  response regulator receiver protein  27.35 
 
 
138 aa  80.9  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88924  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2552  response regulator receiver domain-containing protein  27.73 
 
 
130 aa  80.5  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
1907 aa  80.9  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2101  response regulator receiver domain-containing protein  26.96 
 
 
125 aa  80.5  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0893  response regulator receiver protein  27.35 
 
 
138 aa  80.9  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.605635  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0519  putative CheA signal transduction histidine kinases  36.29 
 
 
1029 aa  79  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3190  twitching motility, CheY-like protein  27.68 
 
 
141 aa  78.6  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3021  response regulator receiver protein  29.46 
 
 
144 aa  78.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.381292  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  26.72 
 
 
137 aa  78.2  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2400  response regulator receiver protein  26.09 
 
 
135 aa  77.4  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.726464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3748  response regulator receiver protein  24.86 
 
 
393 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4606  response regulator receiver protein  22.51 
 
 
408 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03422  hypothetical protein  32.52 
 
 
1128 aa  77  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002587  chitin catabolic cascade sensor histidine kinase ChiS  31.71 
 
 
1111 aa  77  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  26.09 
 
 
138 aa  77  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 
2212 aa  77  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  35.59 
 
 
1127 aa  76.3  0.0000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1038  sensory box histidine kinase/response regulator  38.68 
 
 
513 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3899  response regulator receiver  26.96 
 
 
136 aa  76.3  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  28.39 
 
 
1177 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 
1974 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3476  response regulator receiver protein  35 
 
 
412 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0690542  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0791  response regulator receiver domain-containing protein  34.23 
 
 
125 aa  75.5  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00778943 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 
2022 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  31.09 
 
 
2070 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  31.09 
 
 
2458 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 
1832 aa  74.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 
1758 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  31.09 
 
 
2476 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>