More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1038 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1038  sensory box histidine kinase/response regulator  100 
 
 
513 aa  1046    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2194  histidine kinase  43.09 
 
 
609 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2366  two component sensor histidine kinase  44.72 
 
 
1154 aa  272  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0469089  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2507  sensor histidine kinase  51.53 
 
 
635 aa  227  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.82 
 
 
545 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2227  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.73 
 
 
665 aa  205  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.670404  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.54 
 
 
644 aa  205  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00181069  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 
801 aa  187  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2388  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
552 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.245714  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1054  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 
552 aa  177  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000699137 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.89 
 
 
819 aa  177  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.11 
 
 
804 aa  175  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.27 
 
 
887 aa  169  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0258  two component sensor histidine kinase  33 
 
 
556 aa  169  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 
567 aa  168  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 
663 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 
576 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.413012  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1500  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 
560 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2643  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 
552 aa  164  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 
1131 aa  163  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2778  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 
823 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.960526 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
819 aa  162  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2408  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.08 
 
 
647 aa  162  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385618  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0435  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.1 
 
 
703 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1221  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 
862 aa  160  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000508764  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1723  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.47 
 
 
664 aa  160  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  32.38 
 
 
1379 aa  160  6e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3419  sensor histidine kinase  31.04 
 
 
774 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2960  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 
557 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.87 
 
 
1255 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.21 
 
 
1432 aa  157  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0201  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 
408 aa  155  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  28.43 
 
 
1299 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1502  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.52 
 
 
952 aa  153  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_566  sensor histidine kinase  27.72 
 
 
852 aa  153  8.999999999999999e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0711  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 
702 aa  153  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2787  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.51 
 
 
365 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220649  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0788  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.56 
 
 
634 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0768  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 
673 aa  152  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670648  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3071  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 
1222 aa  151  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0997499 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4753  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.06 
 
 
630 aa  151  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1222  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 
686 aa  150  5e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0583301 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1987  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 
552 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2411  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.44 
 
 
497 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0350  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.68 
 
 
1140 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0625  sensory box sensor histidine kinase  34.87 
 
 
853 aa  148  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0137493  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.77 
 
 
1081 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2275  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 
557 aa  147  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  34.02 
 
 
516 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1112  histidine kinase  34.29 
 
 
453 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0613673  normal  0.382765 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
803 aa  146  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.623752 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2233  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 
552 aa  145  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0296242 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1728  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 
462 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.091875  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  32.13 
 
 
1062 aa  145  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3715  histidine kinase  35.42 
 
 
695 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223291 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0320  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.97 
 
 
838 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 
852 aa  142  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  30.29 
 
 
1092 aa  142  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  31.03 
 
 
1061 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3573  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.65 
 
 
402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1870  histidine kinase  29.38 
 
 
779 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4428  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.38 
 
 
622 aa  142  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 
540 aa  142  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948735  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2358  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.64 
 
 
916 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2693  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.39 
 
 
873 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 
713 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581493 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.06 
 
 
975 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.21 
 
 
1262 aa  140  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 
1428 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
970 aa  140  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2592  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.03 
 
 
539 aa  140  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  36.8 
 
 
1258 aa  140  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
522 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0674  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.86 
 
 
1021 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3233  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.65 
 
 
1151 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.885558  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  31.01 
 
 
1258 aa  139  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.27 
 
 
1418 aa  138  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1634  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.9 
 
 
538 aa  138  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.84 
 
 
759 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1055  two component signal transduction response regulator  45.86 
 
 
734 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0148851  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2727  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.4 
 
 
753 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 
542 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2364  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 
646 aa  138  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.765238  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  32.49 
 
 
1774 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0902  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  44.83 
 
 
718 aa  137  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.651526  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2816  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.56 
 
 
682 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0864703 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  34.78 
 
 
1780 aa  136  8e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1029  two-component sensor CbrA  34.34 
 
 
986 aa  136  9e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.211087  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2710  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  46.32 
 
 
704 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325078 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3371  histidine kinase  35.25 
 
 
887 aa  135  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.564838 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0582  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
587 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6442  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.72 
 
 
688 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.381857  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3207  histidine kinase  33.21 
 
 
347 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00238507  normal  0.252728 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  35.41 
 
 
542 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0721  histidine kinase  27.99 
 
 
675 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.64 
 
 
541 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2742  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 
544 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.617202  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 
743 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.51 
 
 
978 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1506  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  46.32 
 
 
704 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>