More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3419 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3419  sensor histidine kinase  100 
 
 		 774 aa  1583    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1870  histidine kinase  54.24 
 
 		 779 aa  829    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.29 
 
 		 584 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3228  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.64 
 
 		 609 aa  270  7e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3526  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.14 
 
 		 584 aa  270  7e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1774  histidine kinase  53.08 
 
 		 578 aa  269  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1802  histidine kinase  55.91 
 
 		 540 aa  269  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.963501  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1728  histidine kinase  55.91 
 
 		 560 aa  269  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2102  histidine kinase  53.46 
 
 		 575 aa  267  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1854  histidine kinase  52.69 
 
 		 578 aa  266  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1037  histidine kinase  50 
 
 		 608 aa  265  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2755  periplasmic substrate-binding protein/sensor histidine kinase  52.44 
 
 		 590 aa  263  8e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1249  sensory box histidine kinase  39.12 
 
 		 524 aa  258  4e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0948878  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4039  histidine kinase  48.31 
 
 		 572 aa  250  8e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.81 
 
 		 604 aa  248  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00123104  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4130  histidine kinase  47.37 
 
 		 572 aa  248  4e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.964997 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.86 
 
 		 620 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.838333  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.58 
 
 		 986 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0721424  decreased coverage  0.00000190438 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2081  histidine kinase  44.62 
 
 		 597 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2923  histidine kinase  46.99 
 
 		 598 aa  241  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1759  histidine kinase  45.17 
 
 		 596 aa  240  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2175  histidine kinase  44.23 
 
 		 599 aa  236  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2172  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 406 aa  234  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1302  histidine kinase  46.24 
 
 		 596 aa  231  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000333005 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1831  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 793 aa  228  4e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.836817  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1761  histidine kinase  43.75 
 
 		 578 aa  227  5.0000000000000005e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2854  putative two component signal transduction protein  34.23 
 
 		 917 aa  226  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0377  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.66 
 
 		 771 aa  223  7e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  26.79 
 
 		 882 aa  218  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2366  two component sensor histidine kinase  36.11 
 
 		 1154 aa  216  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0469089  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2643  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 		 552 aa  216  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2358  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.26 
 
 		 916 aa  213  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1894  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.41 
 
 		 1085 aa  209  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3357  sensory box histidine kinase  27.57 
 
 		 794 aa  203  9e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1149  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.81 
 
 		 833 aa  203  9e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355741  normal  0.205094 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1907  histidine kinase  44.4 
 
 		 560 aa  203  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.649995 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2003  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 653 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.977312  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1089  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 		 868 aa  198  3e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.371238 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0721  histidine kinase  31.72 
 
 		 675 aa  197  7e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1858  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.06 
 
 		 1191 aa  197  7e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 1246 aa  196  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  29.86 
 
 		 775 aa  196  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 802 aa  194  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.43493  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3777  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 701 aa  194  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215477  hitchhiker  0.0067097 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3113  histidine kinase  32.87 
 
 		 654 aa  191  7e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000907022 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0179  histidine kinase  32.13 
 
 		 758 aa  190  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2289  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.78 
 
 		 536 aa  188  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000503711  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3689  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 655 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.84 
 
 		 898 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0350  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.04 
 
 		 1140 aa  184  7e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3878  histidine kinase  31.44 
 
 		 692 aa  184  7e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.245936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0926  sensory box protein  30.82 
 
 		 1063 aa  182  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2075  signal transduction protein  26.06 
 
 		 988 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1088  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.03 
 
 		 822 aa  180  8e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.436726 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1832  histidine kinase  37.93 
 
 		 550 aa  179  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00156636 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30840  putative signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 		 470 aa  178  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000329503  hitchhiker  1.67285e-16 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.92 
 
 		 1019 aa  177  9e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1273  PAS sensor protein  24.09 
 
 		 728 aa  176  9.999999999999999e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0273  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 		 917 aa  170  8e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.161492 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1041  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.13 
 
 		 1121 aa  170  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.700011  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3233  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.12 
 
 		 1151 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.885558  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1054  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 552 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000699137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2646  sensor histidine kinase  37.99 
 
 		 445 aa  165  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215713  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1500  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 		 560 aa  165  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 713 aa  162  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581493 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1960  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 525 aa  162  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2945  sensor histidine kinase/response regulator  34.84 
 
 		 505 aa  161  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2742  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 467 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 683 aa  158  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2194  histidine kinase  30.69 
 
 		 609 aa  158  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1575  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.81 
 
 		 683 aa  155  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.539969  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0201  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 408 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4555  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 467 aa  154  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2233  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.49 
 
 		 747 aa  154  5e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2960  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.79 
 
 		 557 aa  154  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0258  two component sensor histidine kinase  29.64 
 
 		 556 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1509  diguanylate cyclase  28.45 
 
 		 835 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0192657  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0052  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.18 
 
 		 1054 aa  154  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  37.64 
 
 		 524 aa  152  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3324  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 		 408 aa  153  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.397309  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1221  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 		 862 aa  153  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000508764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2388  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 552 aa  151  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.245714  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0911  sensory box histidine kinase  31.68 
 
 		 581 aa  152  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1038  sensory box histidine kinase/response regulator  31.36 
 
 		 513 aa  150  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0965  PAS:hemerythrin HHE cation binding region  34.1 
 
 		 681 aa  150  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94683  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0581  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.08 
 
 		 748 aa  150  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.401859  normal  0.981088 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  30.63 
 
 		 862 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3102  GGDEF domain-containing protein  29.24 
 
 		 580 aa  148  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3535  histidine kinase  29.32 
 
 		 410 aa  148  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1567  histidine kinase  37.41 
 
 		 310 aa  148  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01018  histidine kinase  33.09 
 
 		 408 aa  146  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06148  histidine kinase  33.09 
 
 		 408 aa  146  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00011043  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 		 528 aa  145  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6389  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.72 
 
 		 688 aa  146  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1728  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 		 462 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.091875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2611  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.16 
 
 		 1134 aa  146  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.413442  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2275  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 		 557 aa  145  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1222  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.54 
 
 		 686 aa  145  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0583301 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 611 aa  145  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 611 aa  145  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>