More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2755 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2755  periplasmic substrate-binding protein/sensor histidine kinase  100 
 
 		 590 aa  1189    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3526  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  67.59 
 
 		 584 aa  711    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1728  histidine kinase  64.85 
 
 		 560 aa  665    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  64.84 
 
 		 604 aa  745    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00123104  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2923  histidine kinase  65.93 
 
 		 598 aa  715    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1802  histidine kinase  64.84 
 
 		 540 aa  664    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.963501  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.86 
 
 		 620 aa  701    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.838333  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4039  histidine kinase  62.52 
 
 		 572 aa  688    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4130  histidine kinase  62.34 
 
 		 572 aa  698    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.964997 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1037  histidine kinase  62.29 
 
 		 608 aa  695    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1302  histidine kinase  62.05 
 
 		 596 aa  699    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000333005 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3228  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  62.29 
 
 		 609 aa  699    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.29 
 
 		 584 aa  641    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1774  histidine kinase  58.67 
 
 		 578 aa  631  1e-180  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2102  histidine kinase  58.23 
 
 		 575 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1854  histidine kinase  58.04 
 
 		 578 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1759  histidine kinase  54.93 
 
 		 596 aa  590  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37697  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2081  histidine kinase  54.65 
 
 		 597 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2175  histidine kinase  54.28 
 
 		 599 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1761  histidine kinase  45.97 
 
 		 578 aa  510  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1907  histidine kinase  48.35 
 
 		 560 aa  503  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.649995 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3419  sensor histidine kinase  50.99 
 
 		 774 aa  265  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1870  histidine kinase  51.42 
 
 		 779 aa  254  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2172  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.1 
 
 		 406 aa  250  6e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.93 
 
 		 986 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0721424  decreased coverage  0.00000190438 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1894  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.01 
 
 		 1085 aa  234  3e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1249  sensory box histidine kinase  44.49 
 
 		 524 aa  233  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0948878  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2289  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.91 
 
 		 536 aa  231  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000503711  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2854  putative two component signal transduction protein  42.59 
 
 		 917 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.86 
 
 		 1055 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0377  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.66 
 
 		 771 aa  211  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 780 aa  206  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.111266  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2003  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 653 aa  205  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.977312  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3266  putative PAS/PAC sensor protein  41.85 
 
 		 830 aa  199  9e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2643  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 		 552 aa  192  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2945  sensor histidine kinase/response regulator  40.67 
 
 		 505 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1960  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 		 525 aa  184  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2742  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.67 
 
 		 467 aa  183  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1832  histidine kinase  37.31 
 
 		 550 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00156636 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 		 528 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4555  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 		 467 aa  166  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2669  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.6 
 
 		 1047 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3113  histidine kinase  37.45 
 
 		 654 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000907022 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1566  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.92 
 
 		 1047 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0071  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 392 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03495  Signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 557 aa  162  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  37.97 
 
 		 524 aa  162  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1567  histidine kinase  38.65 
 
 		 310 aa  160  8e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 		 611 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 		 683 aa  159  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 		 611 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 588 aa  158  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2950  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 710 aa  158  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3689  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 		 655 aa  158  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3878  histidine kinase  36.94 
 
 		 692 aa  158  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.245936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  36.86 
 
 		 611 aa  158  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 553 aa  157  7e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.260474  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3777  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 701 aa  156  9e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215477  hitchhiker  0.0067097 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5981  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 		 602 aa  154  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0658  sensor histide kinase  35.13 
 
 		 315 aa  154  5.9999999999999996e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 678 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2369  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 1146 aa  152  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30840  putative signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 470 aa  153  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000329503  hitchhiker  1.67285e-16 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0719  Signal transduction histidine kinase sensor  31.65 
 
 		 785 aa  152  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00268576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 594 aa  153  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2667  histidine kinase  38.58 
 
 		 486 aa  152  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06148  histidine kinase  33.92 
 
 		 408 aa  151  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00011043  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01018  histidine kinase  33.92 
 
 		 408 aa  151  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.04 
 
 		 819 aa  150  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1535  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 566 aa  150  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 1021 aa  150  7e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0260  sensor histidine kinase  35.51 
 
 		 627 aa  150  8e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2386  sensor histidine kinase  35.51 
 
 		 627 aa  150  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0743  sensor histidine kinase  35.51 
 
 		 627 aa  150  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573337  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0922  EAL/GGDEF domain-containing protein  35.51 
 
 		 627 aa  150  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2691  sensor histidine kinase  35.51 
 
 		 627 aa  150  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0755  sensor histidine kinase  35.51 
 
 		 627 aa  150  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997175  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2467  sensor histidine kinase  35.51 
 
 		 627 aa  150  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7222  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 589 aa  150  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368099  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  33.44 
 
 		 516 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3259  sensor histidine kinase  33.91 
 
 		 598 aa  148  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408532  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3946  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 		 448 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1575  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 683 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.539969  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0721  histidine kinase  33.95 
 
 		 675 aa  148  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1500  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 		 560 aa  148  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1767  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 785 aa  148  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0937227 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0603  sensory box sensor histidine kinase  30.36 
 
 		 439 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3826  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 492 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0965  PAS:hemerythrin HHE cation binding region  35.37 
 
 		 681 aa  147  6e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94683  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.59 
 
 		 541 aa  147  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  34.81 
 
 		 912 aa  147  7.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1897  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 488 aa  146  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 679 aa  146  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 713 aa  146  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4155  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 440 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0614  sensor histidine kinase  35.09 
 
 		 626 aa  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.294788  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2646  sensor histidine kinase  34.38 
 
 		 445 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215713  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  31.55 
 
 		 1850 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2200  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.46 
 
 		 848 aa  145  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00863508  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.59 
 
 		 850 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.346291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>