More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1312 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2755  periplasmic substrate-binding protein/sensor histidine kinase  58.23 
 
 
590 aa  644    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1037  histidine kinase  59.59 
 
 
608 aa  668    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.37 
 
 
604 aa  671    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00123104  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3228  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.96 
 
 
609 aa  675    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
584 aa  1203    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3526  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.4 
 
 
584 aa  634  1e-180  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2923  histidine kinase  56.44 
 
 
598 aa  629  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1302  histidine kinase  55.03 
 
 
596 aa  620  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000333005 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.14 
 
 
620 aa  620  1e-176  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.838333  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4130  histidine kinase  55.1 
 
 
572 aa  610  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.964997 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2102  histidine kinase  52.48 
 
 
575 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1774  histidine kinase  52.65 
 
 
578 aa  601  1e-170  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1854  histidine kinase  51.83 
 
 
578 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4039  histidine kinase  55.1 
 
 
572 aa  593  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1802  histidine kinase  55.81 
 
 
540 aa  590  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.963501  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1728  histidine kinase  55.39 
 
 
560 aa  588  1e-167  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1759  histidine kinase  49.45 
 
 
596 aa  559  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37697  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2081  histidine kinase  48.2 
 
 
597 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2175  histidine kinase  48.43 
 
 
599 aa  524  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1761  histidine kinase  42.57 
 
 
578 aa  471  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1907  histidine kinase  45.31 
 
 
560 aa  469  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.649995 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1870  histidine kinase  49.29 
 
 
779 aa  272  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3419  sensor histidine kinase  51.29 
 
 
774 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2172  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.1 
 
 
406 aa  257  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1249  sensory box histidine kinase  46.42 
 
 
524 aa  250  5e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0948878  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2854  putative two component signal transduction protein  45.72 
 
 
917 aa  239  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1894  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.62 
 
 
1085 aa  233  9e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.95 
 
 
986 aa  232  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0721424  decreased coverage  0.00000190438 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0377  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.56 
 
 
771 aa  229  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2289  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.59 
 
 
536 aa  224  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000503711  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2003  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
653 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.977312  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 
1055 aa  204  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 
780 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.111266  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2643  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 
552 aa  196  7e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1960  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 
525 aa  195  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1832  histidine kinase  38.61 
 
 
550 aa  192  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00156636 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3266  putative PAS/PAC sensor protein  37.59 
 
 
830 aa  178  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0071  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 
392 aa  177  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 
683 aa  171  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  26.94 
 
 
576 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2945  sensor histidine kinase/response regulator  34.21 
 
 
505 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2742  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 
467 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759384  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3689  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 
655 aa  162  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1566  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.01 
 
 
1047 aa  160  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3113  histidine kinase  35.77 
 
 
654 aa  160  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000907022 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3777  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 
701 aa  160  6e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215477  hitchhiker  0.0067097 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0721  histidine kinase  36.23 
 
 
675 aa  159  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1567  histidine kinase  38.69 
 
 
310 aa  157  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3878  histidine kinase  37.84 
 
 
692 aa  157  7e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.245936  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4555  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 
467 aa  156  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 
528 aa  155  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1535  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 
566 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06148  histidine kinase  36.86 
 
 
408 aa  154  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00011043  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01018  histidine kinase  36.86 
 
 
408 aa  154  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2669  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.28 
 
 
1047 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 
553 aa  151  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.260474  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  35.93 
 
 
1187 aa  150  8e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2950  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
710 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03495  Signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 
557 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  35.06 
 
 
1808 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1575  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 
683 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.539969  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6389  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.82 
 
 
688 aa  148  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0658  sensor histide kinase  33.65 
 
 
315 aa  148  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 
494 aa  148  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30840  putative signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 
470 aa  147  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000329503  hitchhiker  1.67285e-16 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0965  PAS:hemerythrin HHE cation binding region  35.22 
 
 
681 aa  147  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94683  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  36.58 
 
 
524 aa  145  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3946  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 
448 aa  146  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2272  putative two-component sensor  35.48 
 
 
433 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  32.57 
 
 
1850 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 
1021 aa  145  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01455  sensor histidine kinase  31.53 
 
 
436 aa  144  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2466  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 
688 aa  144  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1526  ATP-binding region ATPase domain protein  33.22 
 
 
730 aa  143  7e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  0.545024 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0719  Signal transduction histidine kinase sensor  31.13 
 
 
785 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00268576  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  34.49 
 
 
708 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1428  histidine kinase  33.88 
 
 
457 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0603  sensory box sensor histidine kinase  30.95 
 
 
439 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4350  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.84 
 
 
686 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4373  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.84 
 
 
687 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0865062  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2797  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 
480 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2449  putative two-component sensor  34.01 
 
 
305 aa  141  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4367  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 
800 aa  141  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.522603  normal  0.113968 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1911  histidine kinase  35.92 
 
 
406 aa  140  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.267492 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5807  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
990 aa  140  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26810  putative two-component sensor  34.94 
 
 
371 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2392  histidine kinase  36.57 
 
 
502 aa  139  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2369  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 
1146 aa  139  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2545  sensor histidine kinase  32.11 
 
 
429 aa  139  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2312  Signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 
389 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
537 aa  139  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.559504  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  34.1 
 
 
611 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1767  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 
785 aa  139  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0937227 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0478  histidine kinase  33.56 
 
 
616 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02433  sensor histide kinase  33 
 
 
482 aa  137  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2796  phosphoglycerate transport; protein for signal transmission  31.88 
 
 
724 aa  137  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000463972  normal  0.015669 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
611 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
611 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2229  sensor histidine kinase  33.23 
 
 
389 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0709  sensory box sensor histidine kinase  33.12 
 
 
358 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>